| 符号说明 | 第4-8页 |
| 中文摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-11页 |
| 1 前言 | 第12-25页 |
| 1.1 生姜茎基腐病的研究进展 | 第12-13页 |
| 1.1.1 生姜茎基腐病的发生与危害 | 第13页 |
| 1.1.2 生姜茎基腐病的病原研究现状 | 第13页 |
| 1.2 腐霉菌的危害 | 第13-20页 |
| 1.2.1 腐霉菌的分类地位 | 第14页 |
| 1.2.2 腐霉菌的形态特征 | 第14页 |
| 1.2.3 腐霉菌的病害种类 | 第14-16页 |
| 1.2.4 腐霉菌的分离和检测方法 | 第16-18页 |
| 1.2.5 目前防治腐霉菌的方法 | 第18-20页 |
| 1.3 甲壳胺的研究 | 第20-22页 |
| 1.3.1 甲壳胺的应用范围 | 第20-21页 |
| 1.3.2 甲壳胺的抑菌作用机理 | 第21-22页 |
| 1.4 转录组及高通量测序 | 第22-24页 |
| 1.4.1 转录组学 | 第22-23页 |
| 1.4.2 转录组测序的方法 | 第23-24页 |
| 1.5 本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
| 2 材料与方法 | 第25-31页 |
| 2.1 病株的采集 | 第25页 |
| 2.2 实验材料 | 第25页 |
| 2.3 实验方法 | 第25-31页 |
| 2.3.1 病原菌的分离及显微镜观察 | 第25页 |
| 2.3.2 致病性测定 | 第25-26页 |
| 2.3.3 病原菌测序鉴定 | 第26页 |
| 2.3.4 植物精油抑菌活性测定 | 第26页 |
| 2.3.5 不同浓度甲壳胺的抑菌实验 | 第26页 |
| 2.3.6 甲壳胺对腐霉菌丝形态的影响 | 第26页 |
| 2.3.7 甲壳胺对群结腐霉转录组的影响 | 第26-29页 |
| 2.3.8 田间防治实验 | 第29-31页 |
| 3 结果与分析 | 第31-52页 |
| 3.1 病原菌的形态特征 | 第31-32页 |
| 3.2 致病性测定 | 第32页 |
| 3.3 测序分析 | 第32-33页 |
| 3.4 植物精油抑菌活性测定 | 第33-35页 |
| 3.4.1 10种植物精油对病原菌的抑菌活性 | 第33-34页 |
| 3.4.2 月桂油、肉桂油、丁香酚油、天竺葵油对3种病原菌的抑菌作用 | 第34-35页 |
| 3.5 甲壳胺对3种病原菌的抑制作用 | 第35-36页 |
| 3.6 甲壳胺对腐霉菌丝形态的影响 | 第36页 |
| 3.7 田间防治实验 | 第36-37页 |
| 3.8 甲壳胺对群结腐霉转录组的影响 | 第37-52页 |
| 3.8.1 RNA的提取 | 第37页 |
| 3.8.2 原始序列统计 | 第37-39页 |
| 3.8.3 基因表达水平分析 | 第39-40页 |
| 3.8.4 基因功能注释 | 第40-46页 |
| 3.8.5 差异基因表达分析 | 第46-47页 |
| 3.8.6 GO富集分析 | 第47-50页 |
| 3.8.7 KEGG富集分析 | 第50-52页 |
| 4 讨论 | 第52-55页 |
| 4.1 生姜茎基腐病的病原鉴定 | 第52页 |
| 4.2 植物精油对病原菌的抑菌作用 | 第52-53页 |
| 4.3 甲壳胺对病原菌的抑菌作用 | 第53-54页 |
| 4.4 甲壳胺对群结腐霉转录组的影响 | 第54-55页 |
| 5 结论 | 第55-56页 |
| 5.1 生姜茎基腐病的病原鉴定 | 第55页 |
| 5.2 植物精油对病原菌的抑菌作用 | 第55页 |
| 5.3 甲壳胺对病原菌的抑菌作用 | 第55页 |
| 5.4 甲壳胺对群结腐霉转录组的影响 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-64页 |
| 附录 | 第64-66页 |
| 致谢 | 第66-67页 |
| 攻读学位期间发表论文情况 | 第67页 |