| 摘要 | 第5-7页 |
| 英文摘要 | 第7-8页 |
| 英文缩略表 | 第12-13页 |
| 第一章 引言 | 第13-25页 |
| 1.1 我国绵羊品种资源概况 | 第13-15页 |
| 1.1.1 中国地方绵羊品种地理分布 | 第13-14页 |
| 1.1.2 中国地方绵羊主要性状描述 | 第14-15页 |
| 1.2 近年我国羊产业经济性状研究状况 | 第15-18页 |
| 1.2.1 肉羊候选基因研究进展 | 第16-17页 |
| 1.2.2 肉羊功能基因研究进展 | 第17-18页 |
| 1.2.3 新技术在肉羊遗传育种研究进展 | 第18页 |
| 1.3 高通量技术的迅猛发展 | 第18-20页 |
| 1.3.1 SNP芯片技术在畜禽中的研究进展 | 第18-19页 |
| 1.3.2 全基因组重测序在畜禽中的研究进展 | 第19-20页 |
| 1.4 选择信号 | 第20-25页 |
| 1.4.1 选择信号的概念 | 第20-21页 |
| 1.4.2 选择信号的检测方法 | 第21-23页 |
| 1.4.3 选择信号研究存在的问题与展望 | 第23-25页 |
| 第二章 中国地方绵羊群体遗传结构分析和选择痕迹挖掘 | 第25-41页 |
| 2.1 前言 | 第25页 |
| 2.2 材料与方法 | 第25-27页 |
| 2.2.1 样品采集和基因分析 | 第25-26页 |
| 2.2.2 质量控制和遗传多样性分析 | 第26页 |
| 2.2.3 群体结构分析 | 第26-27页 |
| 2.2.4 统计分析 | 第27页 |
| 2.3 结果 | 第27-39页 |
| 2.3.1 中国地方绵羊品种遗传变异和群体遗传结构分析 | 第27-33页 |
| 2.3.2 中国地方绵羊基因组选择信号分析 | 第33-36页 |
| 2.3.3 多浪羊的杂交痕迹 | 第36-39页 |
| 2.3.4 其他重要候选基因受人工选择情况 | 第39页 |
| 2.4 讨论 | 第39-41页 |
| 2.4.1 中国地方绵羊群体遗传结构 | 第39-40页 |
| 2.4.2 中国地方绵羊品种中人工选择情况 | 第40-41页 |
| 第三章 藏绵羊高原适应性基因挖掘 | 第41-58页 |
| 3.1 前言 | 第41-42页 |
| 3.2 材料与方法 | 第42-44页 |
| 3.2.1 基因分型和质量控制 | 第42页 |
| 3.2.3 群体分析 | 第42页 |
| 3.2.4 适应高海拔缺氧的先验候选基因 | 第42-43页 |
| 3.2.5 统计分析 | 第43页 |
| 3.2.6 生理测量和关联分析 | 第43-44页 |
| 3.3 结果 | 第44-56页 |
| 3.3.1 群体结构分析 | 第44-46页 |
| 3.3.2 藏羊品种中与高海拔相关的选择信号 | 第46-55页 |
| 3.3.3 EPAS1基因的突变位点与藏羊血液学指标的关系 | 第55-56页 |
| 3.4 讨论 | 第56-58页 |
| 第四章 三个不同类型肉用绵羊品种人工选择痕迹挖掘 | 第58-72页 |
| 4.1 前言 | 第58页 |
| 4.2 材料与方法 | 第58-59页 |
| 4.2.1 试验样本和质量控制 | 第58-59页 |
| 4.2.2 群体分析 | 第59页 |
| 4.2.3 统计分析 | 第59页 |
| 4.3 结果 | 第59-70页 |
| 4.3.1 群体结构分析 | 第59-60页 |
| 4.3.2 两个位点特异性选择分析方法的相关性 | 第60-62页 |
| 4.3.3 检测品种内特定的选择区域 | 第62-66页 |
| 4.3.4 基因注释 | 第66页 |
| 4.3.5 品种内具体受选择的基因 | 第66-69页 |
| 4.3.6 重叠的受选择区域 | 第69-70页 |
| 4.4 讨论 | 第70-72页 |
| 第五章 基于重测序对中国及欧洲绵羊品种的遗传结构分析 | 第72-85页 |
| 5.1 前言 | 第72页 |
| 5.2 材料与方法 | 第72-74页 |
| 5.2.1 试验样本和质量控制 | 第72-73页 |
| 5.2.2 绵羊基因组的变异检测 | 第73页 |
| 5.2.3 连锁不平衡计算 | 第73页 |
| 5.2.4 群体遗传分析 | 第73-74页 |
| 5.3 结果 | 第74-82页 |
| 5.3.1 群体多样性分析 | 第74-75页 |
| 5.3.2 群体结构分析 | 第75-81页 |
| 5.3.3 历史有效群体大小分析 | 第81页 |
| 5.3.4 基因渗入分析 | 第81-82页 |
| 5.4 讨论 | 第82-85页 |
| 第六章 全文结论 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-114页 |
| 附录 | 第114-125页 |
| 致谢 | 第125-126页 |
| 作者简历 | 第126页 |
