| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6页 |
| 第1章 绪论 | 第9-17页 |
| 1.1 课题背景 | 第9-11页 |
| 1.1.1 离子通道简介 | 第9-10页 |
| 1.1.2 钾离子通道的分类 | 第10页 |
| 1.1.3 生物大分子中的弱相互作用 | 第10-11页 |
| 1.2 BK通道简介 | 第11-15页 |
| 1.2.1 BK通道国内外研究动态 | 第11页 |
| 1.2.2 BK通道的分布与功能 | 第11-12页 |
| 1.2.3 BK通道的结构 | 第12-13页 |
| 1.2.4 BK通道的门控特性 | 第13-15页 |
| 1.3 研究内容 | 第15-16页 |
| 1.4 研究意义 | 第16-17页 |
| 第2章 蛋白分子模拟理论 | 第17-23页 |
| 2.1 蛋白分子结构预测 | 第17-18页 |
| 2.1.1 同源模建 | 第17页 |
| 2.1.2 SWISS-MODEL | 第17-18页 |
| 2.2 分子动力学模拟 | 第18-20页 |
| 2.2.1 分子动力学模拟原理 | 第18-19页 |
| 2.2.2 能量最小化和能量平衡 | 第19-20页 |
| 2.3 靶向分子动力学模拟 | 第20-21页 |
| 2.4 主成分分析 | 第21页 |
| 2.5 分子动力学模拟软件 | 第21-23页 |
| 2.5.1 Visual Molecular Dynamics | 第22页 |
| 2.5.2 Nanoscale Molecular Dynamics | 第22-23页 |
| 第3章 BK通道模拟过程 | 第23-28页 |
| 3.1 构建BK通道结构 | 第23页 |
| 3.2 优化BK通道结构 | 第23-24页 |
| 3.3 确定BK通道Ca~(2+)结合结构域 | 第24-26页 |
| 3.4 实现BK通道构象变化 | 第26页 |
| 3.5 分析BK通道构象变化的运动模式 | 第26-27页 |
| 3.6 本章小结 | 第27-28页 |
| 第4章 分子动力学模拟结果 | 第28-33页 |
| 4.1 成功构建BK通道关闭态构象和开放态构象 | 第28-29页 |
| 4.2 RCK1-RCK2 domain之间的关联性分析 | 第29-30页 |
| 4.3 基于构象变化的弱相互作用分析 | 第30-32页 |
| 4.4 本章小结 | 第32-33页 |
| 第5章 靶向分子动力学模拟结果 | 第33-42页 |
| 5.1 BK通道开放过程中RCK1 Site的贡献大于Ca~(2+) bowl | 第33-36页 |
| 5.2 BK通道开放过程中存在两种主要运动模式 | 第36-38页 |
| 5.3 调控BK通道开放的弱相互作用网络 | 第38-39页 |
| 5.4 调控BK通道开放弱相互作用的传递路径 | 第39-41页 |
| 5.5 本章小结 | 第41-42页 |
| 第6章 结论与展望 | 第42-43页 |
| 6.1 结论 | 第42页 |
| 6.2 展望 | 第42-43页 |
| 参考文献 | 第43-47页 |
| 攻读学位期间所取得的相关科研成果 | 第47-48页 |
| 致谢 | 第48页 |
