| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4-5页 |
| 1 绪论 | 第9-16页 |
| 1.1 肠道共生菌群与宿主免疫系统互作研究进展 | 第9-12页 |
| 1.1.1 肠道菌群概述 | 第9-10页 |
| 1.1.2 肠道菌群与疾病 | 第10页 |
| 1.1.3 肠道共生菌群与宿主免疫系统互作 | 第10-12页 |
| 1.2 七鳃鳗及其适应性免疫发育相关的研究进展 | 第12-15页 |
| 1.2.1 七鳃鳗概述 | 第12-13页 |
| 1.2.2 七鳃鳗消化系统相关研究 | 第13-14页 |
| 1.2.3 七鳃鳗适应性免疫系统 | 第14-15页 |
| 1.3 本论文的研究目的及意义 | 第15-16页 |
| 2 七鳃鳗肠道菌群结构的分析 | 第16-28页 |
| 2.1 实验材料 | 第16-17页 |
| 2.1.1 主要材料 | 第16页 |
| 2.1.2 主要试剂 | 第16页 |
| 2.1.3 主要仪器 | 第16-17页 |
| 2.2 实验方法 | 第17-20页 |
| 2.2.1 肠道内容物的收集 | 第17页 |
| 2.2.2 基因组DNA的提取 | 第17页 |
| 2.2.3 七鳃鳗肠道细菌 16S rDNA片段的宏基因组文库构建及分析 | 第17页 |
| 2.2.4 七鳃鳗肠道细菌 16S rDNA文库的构建 | 第17-19页 |
| 2.2.5 七鳃鳗肠道细菌 16S rDNA文库的HinfI酶切分析及测序 | 第19页 |
| 2.2.6 七鳃鳗肠道细菌的系统发育分析 | 第19页 |
| 2.2.7 生物信息学和多变量统计学分析 | 第19-20页 |
| 2.3 结果 | 第20-25页 |
| 2.3.1 七鳃鳗肠道细菌 16S rDNA文库的构建 | 第20-21页 |
| 2.3.2 七鳃鳗肠道细菌 16S rDNA文库的HinfI酶切分析及测序 | 第21-23页 |
| 2.3.3 七鳃鳗肠道细菌的系统发育分析 | 第23-24页 |
| 2.3.4 七鳃鳗肠道细菌文库的数据统计分析 | 第24-25页 |
| 2.4 讨论 | 第25-28页 |
| 3 七鳃鳗肠道气单胞菌的分离与鉴定 | 第28-42页 |
| 3.1 实验材料 | 第28-29页 |
| 3.1.1 主要材料 | 第28页 |
| 3.1.2 主要试剂 | 第28页 |
| 3.1.3 主要仪器 | 第28-29页 |
| 3.2 实验方法 | 第29-34页 |
| 3.2.1 七鳃鳗肠道细菌的分离和纯化 | 第29页 |
| 3.2.2 七鳃鳗肠道细菌的鉴定 | 第29-30页 |
| 3.2.3 气单胞菌株的筛选与鉴定 | 第30页 |
| 3.2.4 qPCR检测总细菌和气单胞菌标准曲线的构建 | 第30-31页 |
| 3.2.5 qPCR检测七鳃鳗肠道总细菌和气单胞菌丰度的变化 | 第31页 |
| 3.2.6 气单胞菌株lam-2 免疫七鳃鳗 | 第31-32页 |
| 3.2.7 七鳃鳗外周血白细胞的分离 | 第32页 |
| 3.2.8 七鳃鳗外周血白细胞总RNA的提取 | 第32-33页 |
| 3.2.9 反转录反应 | 第33页 |
| 3.2.10 qPCR反应检测七鳃鳗白细胞VLRA、VLRB和VLRC的表达 | 第33-34页 |
| 3.3 结果 | 第34-40页 |
| 3.3.1 七鳃鳗肠道菌群的分离与鉴定 | 第34-36页 |
| 3.3.2 气单胞菌株lam-2 的分子鉴定及系统发育分析 | 第36-37页 |
| 3.3.3 LPS刺激提高了肠道总细菌和气单胞菌的丰度 | 第37-38页 |
| 3.3.4 七鳃鳗外周血白细胞总RNA的提取 | 第38-39页 |
| 3.3.5 气单胞菌刺激提高了七鳃鳗白细胞VLRA、VLRB和VLRC的表达 | 第39-40页 |
| 3.4 讨论 | 第40-42页 |
| 4 七鳃鳗应答气单胞菌免疫刺激相关蛋白质的鉴定 | 第42-57页 |
| 4.1 实验材料 | 第42-43页 |
| 4.1.1 主要材料 | 第42页 |
| 4.1.2 主要试剂 | 第42页 |
| 4.1.3 主要仪器 | 第42-43页 |
| 4.2 实验方法 | 第43-47页 |
| 4.2.1 七鳃鳗外周血白细胞总蛋白的提取 | 第43页 |
| 4.2.2 SDS-PAGE电泳分析 | 第43-45页 |
| 4.2.3 蛋白样品FASP酶解 | 第45页 |
| 4.2.4 酶解产物LC-MS/MS分析 | 第45页 |
| 4.2.5 序列数据库检索和数据分析 | 第45-46页 |
| 4.2.6 qPCR检测差异表达蛋白mRNA水平的表达 | 第46页 |
| 4.2.7 Western blot检测STAT3的表达 | 第46-47页 |
| 4.3 结果 | 第47-55页 |
| 4.3.1 七鳃鳗外周血白细胞总蛋白SDS-PAGE分析 | 第47-48页 |
| 4.3.2 七鳃鳗应答气单胞菌免疫刺激相关蛋白质的鉴定 | 第48-51页 |
| 4.3.3 差异蛋白质的统计分析和功能分类 | 第51-53页 |
| 4.3.4 qPCR检测差异表达蛋白mRNA水平的表达 | 第53-54页 |
| 4.3.5 Western blot检测STAT3的表达 | 第54-55页 |
| 4.4 讨论 | 第55-57页 |
| 结论 | 第57-58页 |
| 本论文的创新点 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-66页 |
| 附录A qPCR引物序列 | 第66-67页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第67-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
