| 中文摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-22页 |
| 1.1 引言 | 第10页 |
| 1.2 DNA测序技术的发展 | 第10-16页 |
| 1.2.1 第一代测序技术 | 第11-13页 |
| 1.2.2 第二代测序技术 | 第13-15页 |
| 1.2.3 第三代测序技术 | 第15-16页 |
| 1.3 全基因组扩增技术 | 第16-17页 |
| 1.3.1 基于变性寡核苷酸PCR的全基因组扩增 | 第16页 |
| 1.3.2 基于多重置换扩增的全基因组扩增 | 第16-17页 |
| 1.4 嵌合序列的定义和来源 | 第17-18页 |
| 1.5 基于DNA测序的单体型研究 | 第18-20页 |
| 1.6 论文的主要研究内容 | 第20-22页 |
| 第二章 人类K562细胞基因组测序数据的嵌合序列尝试性探究 | 第22-28页 |
| 2.1 引言 | 第22页 |
| 2.2 K562细胞简介 | 第22页 |
| 2.3 测序数据分析的软件及算法 | 第22-24页 |
| 2.3.1 比对软件SOAP2的使用方法 | 第22-23页 |
| 2.3.2 寻找嵌合序列的核心算法 | 第23-24页 |
| 2.4 测序数据产出及分析结果 | 第24-26页 |
| 2.4.1 测序数据产出 | 第24-25页 |
| 2.4.2 测序数据分析结果 | 第25-26页 |
| 2.5 本章小结 | 第26-28页 |
| 第三章 正常人全基因组测序数据的嵌合序列分析 | 第28-39页 |
| 3.1 引言 | 第28页 |
| 3.2 嵌合序列的详细分类与分级 | 第28-29页 |
| 3.3 测序数据产出及分析结果 | 第29-33页 |
| 3.3.1 测序数据产出 | 第29-30页 |
| 3.3.2 测序数据分析结果 | 第30-33页 |
| 3.3.2.1 嵌合序列总数、总比例以及各类、各级嵌合序列的数量、比例 | 第30-31页 |
| 3.3.2.2 嵌合序列结构性统计指标的分布情况 | 第31-33页 |
| 3.4 影响嵌合序列数量比例因素的探究 | 第33-34页 |
| 3.5 嵌合序列在MDA中形成的机理推断 | 第34-35页 |
| 3.6 提取嵌合序列流程的改进优化 | 第35-37页 |
| 3.7 本章小结 | 第37-39页 |
| 第四章 基于两种大肠杆菌全基因组测序的嵌合序列同源性研究 | 第39-47页 |
| 4.1 引言 | 第39页 |
| 4.2 大肠杆菌菌种的选择 | 第39-40页 |
| 4.3 大肠杆菌基因组DNA的获取 | 第40-42页 |
| 4.3.1 实验材料与方法 | 第40-42页 |
| 4.3.1.1 实验原料与仪器 | 第40-41页 |
| 4.3.1.2 大肠杆菌基因组DNA的提取和定量 | 第41页 |
| 4.3.1.3 大肠杆菌基因组DNA的稀释、混合、扩增与建库 | 第41-42页 |
| 4.3.2 实验结果与讨论 | 第42页 |
| 4.4 测序数据的产出、质量评价和嵌合序列分析 | 第42-45页 |
| 4.4.1 两种大肠杆菌的测序数据产出及参考基因组的组装 | 第42-43页 |
| 4.4.2 嵌合序列的筛选 | 第43-44页 |
| 4.4.3 嵌合序列同源性的证明 | 第44-45页 |
| 4.5 本章小结 | 第45-47页 |
| 第五章 总结与展望 | 第47-49页 |
| 5.1 论文的主要内容和研究成果 | 第47-48页 |
| 5.2 下一步工作展望 | 第48-49页 |
| 参考文献 | 第49-51页 |
| 致谢 | 第51-52页 |
| 攻读硕士学位期间发表论文清单 | 第52页 |
