| 致谢 | 第4-7页 |
| 摘要 | 第7-8页 |
| 1 文献综述 | 第8-19页 |
| 1.1 分子系统学 | 第8-12页 |
| 1.1.1 分子系统学的形成 | 第8页 |
| 1.1.2 分子系统学的研究进展 | 第8-12页 |
| 1.1.2.1 分子系统发生学 | 第8-9页 |
| 1.1.2.2 系统基因组学 | 第9-10页 |
| 1.1.2.3 群体遗传学 | 第10-11页 |
| 1.1.2.4 系统地理学 | 第11页 |
| 1.1.2.5 DNA条形码 | 第11-12页 |
| 1.1.2.6 DNA分类学 | 第12页 |
| 1.2 分子系统学的研究方法 | 第12-14页 |
| 1.2.1 分类群的正确选择 | 第13页 |
| 1.2.2 目的基因的选择 | 第13页 |
| 1.2.3 基因序列数据的对比 | 第13-14页 |
| 1.2.4 基因树的构建方法 | 第14页 |
| 1.3 叶绿体基因组 | 第14-16页 |
| 1.3.1 叶绿体基因组的结构与功能 | 第15-16页 |
| 1.3.2 叶绿体基因组在植物系统发育研究中的应用及优势 | 第16页 |
| 1.4 泡桐属简介 | 第16-19页 |
| 1.4.1 泡桐属资源及特征 | 第16-17页 |
| 1.4.2 泡桐属种类 | 第17-19页 |
| 2 引言 | 第19-20页 |
| 3 材料与方法 | 第20-25页 |
| 3.1 材料与试剂 | 第20-21页 |
| 3.1.1 实验材料 | 第20-21页 |
| 3.1.2 实验所用试剂 | 第21页 |
| 3.1.2.1 提取植物基因组DNA所用试剂 | 第21页 |
| 3.1.2.2 反应体系所用试剂及所需仪器 | 第21页 |
| 3.2 试验方法 | 第21-24页 |
| 3.2.1 植物基因组DNA的提取 | 第21页 |
| 3.2.2 模板DNA质量检测及浓度检测 | 第21-22页 |
| 3.2.2.1 DNA的质量检测 | 第21页 |
| 3.2.2.2 DNA的浓度检测 | 第21-22页 |
| 3.2.3 cpDNA分子发育系统PCR体系的建立及优化 | 第22页 |
| 3.2.4 PCR体系和扩增引物的筛选 | 第22-24页 |
| 3.2.4.1 PCR体系和反应程序 | 第22页 |
| 3.2.4.2 PCR反应体系优化及引物筛选 | 第22-24页 |
| 3.3 数据处理与分析 | 第24-25页 |
| 3.3.1 序列编辑与比对 | 第24页 |
| 3.3.2 数据特征分析 | 第24-25页 |
| 4 结果与分析 | 第25-39页 |
| 4.1 植物总DNA的检测结果 | 第25页 |
| 4.2 PCR反应体系的优化 | 第25-28页 |
| 4.2.1 PCR反应体系单因子试验 | 第25-27页 |
| 4.2.1.1 不同DNA模板浓度对PCR体系的影响 | 第25-26页 |
| 4.2.1.2 不同引物浓度对PCR体系的影响 | 第26页 |
| 4.2.1.3 不同退火温度对PCR体系的影响 | 第26-27页 |
| 4.2.2 PR引物的筛选 | 第27-28页 |
| 4.3 PCR扩增和序列的测定 | 第28-29页 |
| 4.4 测序结果和分析 | 第29-39页 |
| 4.4.1 序列分析 | 第29-32页 |
| 4.4.2 序列特点 | 第32-36页 |
| 4.4.2.1 petL-psbE序列 | 第32-34页 |
| 4.4.2.2 trnD-trnT序列 | 第34-36页 |
| 4.4.2.3 petL-psbE和trnD-trnT结合序列 | 第36页 |
| 4.4.3 系统发育结果分析 | 第36-39页 |
| 4.4.3.1 基于petL-psbE序列数据集构建的最大简约树（MP） | 第36-37页 |
| 4.4.3.2 基于trnD-trnT序列数据集构建的最大简约树（MP） | 第37-38页 |
| 4.4.3.3 基于petL-psbE和trnD-trnT联合数据集构建的最大简约树（MP） | 第38-39页 |
| 5 结论与讨论 | 第39-41页 |
| 5.1 改良CTAB法及尿素法提取基因组总DNA | 第39页 |
| 5.2 优化建立PCR最佳反应体系 | 第39页 |
| 5.3 泡桐属植物及其近缘科植物的遗传距离 | 第39-40页 |
| 5.4 cpDNA序列信息揭示泡桐属植物系统进化关系 | 第40-41页 |
| 参考文献 | 第41-46页 |
| 英文摘要 | 第46-47页 |
