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不同极性有机电子受体对微生物群落结构和功能活性的影响

中英文对照缩略词表第7-9页
摘要第9-11页
Abstract第11-12页
第一章 绪论第13-27页
    1.1 有机污染物的极性及其环境行为第13-14页
        1.1.1 有机污染物极性的定义及其结构特点第13-14页
        1.1.2 有机污染物的极性对其环境行为的影响第14页
    1.2 有机电子受体的微生物厌氧呼吸特点及其环境效应第14-20页
        1.2.1 偶氮呼吸第16页
        1.2.2 脱卤呼吸第16-17页
        1.2.3 延胡索酸呼吸第17-18页
        1.2.4 DMSO呼吸第18页
        1.2.5 腐殖质(HS)呼吸第18-19页
        1.2.6 有机磺酸盐(OS)呼吸第19-20页
    1.3 厌氧环境中有机污染物的微生物治理技术第20-21页
        1.3.1 外源功能微生物强化技术第20页
        1.3.2 土著微生物原位激活技术第20-21页
    1.4 基因组学技术在环境微生物领域中的应用综述第21-23页
        1.4.1 微生物群落多样性研究方法发展历程第21页
        1.4.2 宏基因组学技术第21-22页
        1.4.3 基于基因组学的高通量测序技术第22-23页
    1.5 本课题研究目的和主要内容第23-27页
        1.5.1 研究目的和意义第23-24页
        1.5.2 实验假说第24-25页
        1.5.3 主要研究内容第25-26页
        1.5.4 技术路线图第26-27页
第二章 材料与方法第27-37页
    2.1 实验材料、试剂和仪器第27-30页
        2.1.1 主要实验试剂及相关配方第27-28页
        2.1.2 菌群来源第28-29页
        2.1.3 实验仪器第29-30页
    2.2 实验方法和数据处理软件第30-37页
        2.2.1 电镜观察方法第30页
        2.2.2 功能菌群的厌氧富集培养操作方法第30页
        2.2.3 生物量(蛋白含量)的测定方法第30-31页
        2.2.4 染料去除速率的测定方法第31页
        2.2.5 菌群CSH的测定方法第31页
        2.2.6 菌群全基因组DNA的提取、纯化及保存第31-33页
        2.2.7 菌群 16S rRNA基因的PCR扩增第33-34页
        2.2.8 琼脂糖凝胶电泳第34-35页
        2.2.9 菌群 16S rRNA基因的高通量测序方法第35页
        2.2.10 不同极性OEAs对微生物表型和组成多样性影响的实验操作步骤第35-36页
        2.2.11 不同极性OEAs对功能微生物功能活性影响的实验操作步骤第36页
        2.2.12 实验数据分析处理相关软件第36-37页
第三章 结果与讨论第37-55页
    3.1 不同极性OEAs对微生物表型结构的影响第37-40页
        3.1.1 电镜观察不同驯化培养周期的菌群表面形态结构变化第37-39页
        3.1.2 不同培养富集时期功能菌群CSH的变化第39-40页
    3.2 不同极性OEAs对微生物功能活性的影响第40-44页
        3.2.1 富集培养过程中菌群生物量的变化第41页
        3.2.2 功能菌群对不同极性OEAs的去除速率第41-42页
        3.2.3 染料存在与否和功能菌群CSH的关联性研究第42-43页
        3.2.4 不同极性OEAs驯化功能菌群对不同极性OEAs的降解作用第43-44页
    3.3 利用NGS技术分析不同极性OEAs对微生物群落结构的影响第44-55页
        3.3.1 不同驯化周期功能菌群的差异性统计分析第44-45页
        3.3.2 不同富集时期功能菌群组成多样性的PCoA分析第45-46页
        3.3.3 驯化富集时期菌群在门水平的主要群落组成与结构分析第46-47页
        3.3.4 驯化功能菌群的Alpha多样性指数分析第47-49页
        3.3.5 菌群在不同极性OEAs中驯化4周后的维恩图第49页
        3.3.6 不同极性OEAs驯化不同周期功能菌群的系统发育树第49-50页
        3.3.7 菌群在不同极性有机电子受体驯化培养时期的典型相关分析第50-51页
        3.3.8 驯化培养不同时期菌群去除速率和CSH的CCA分析第51-53页
        3.3.9 不同极性OEAs对驯化菌群的LEfSe分析第53页
        3.3.10 不同极性OEAs对驯化菌群中功能菌属的丰度变化第53-55页
第四章 结论与展望第55-57页
    4.1 全文结论、创新之处第55-56页
        4.1.1 全文结论第55-56页
        4.1.2 创新之处第56页
    4.2 展望第56-57页
参考文献第57-67页
附录第67-69页
致谢第69-70页
作者简历第70页

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