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基于代谢组学策略的CKD-MBD相关生物标志物筛选及骨代谢毒性机制研究

摘要第11-14页
Abstract第14-17页
缩略词表第18-20页
第一章 综述第20-43页
    一、课题背景介绍第20-31页
        (一)慢性肾脏病-矿物质骨代谢异常的研究概况第20-23页
            1.CKD-MBD的定义及分类第20-21页
            2.CKD-MBD的诊断第21-22页
            3.CKD-MBD的治疗策略概况第22-23页
        (二)尿毒症毒素的研究概述第23-27页
            1.尿毒症毒素的定义及分类第23页
            2.尿毒症毒素的研究焦点第23-27页
        (三)代谢组学与转录组学第27-31页
            1.代谢组学的定义及特点第27页
            2.代谢组学的研究策略第27-29页
            3.代谢组学在临床研究中的应用第29-30页
            4.代谢组学与转录组学结合第30-31页
    二、本研究的内容和意义第31-34页
        (一)本课题研究的内容第31-32页
        (二)本课题研究的意义第32-34页
    参考文献第34-43页
第二章 基于UHPLC-QTOF/MS技术的继发性甲状旁腺亢进血清代谢组学研究第43-57页
    一、前言第43-44页
    二、材料与方法第44-46页
        (一)试剂与耗材第44页
        (二)实验样本的纳入与剔除第44页
        (三)血清样本收集与制备第44-45页
        (四)基于UHPLC-MS技术的血清代谢轮廓分析第45-46页
        (五)数据处理第46页
    三、结果第46-50页
        (一)患者的临床信息第46-48页
        (二)统计分析结果第48-50页
    四、讨论第50-52页
    五、本章小结第52-53页
    参考文献第53-57页
第三章 基于UHPLC-QTOF/MS技术的尿毒症并发瘙痒症血清代谢组学研究第57-70页
    一、前言第57-58页
    二、材料和方法第58-60页
        (一)试剂与耗材第58页
        (二)实验样本的纳入与剔除第58-59页
        (三)样品收集与制备第59页
        (四) 基于UHPLC-MS技术的血清代谢轮廓分析第59页
        (五)数据处理第59-60页
    三、结果第60-64页
        (一)参与患者的临床资料第60页
        (二)血清代谢轮廓分析第60-61页
        (三)代谢标志物筛选第61-63页
        (四)UP生物标志物的诊断性能评价第63-64页
    四、讨论第64-66页
    五、本章小结第66-67页
    参考文献第67-70页
第四章 基于UHPLC-QTOF/MS技术的血清代谢组学预测肾性贫血静脉铁剂治疗响应研究第70-84页
    一、前言第70-71页
    二、材料和方法第71-73页
        (一)试剂与耗材第71页
        (二)实验样本的纳入与剔除第71-72页
        (三)铁剂治疗方案第72页
        (四)不良反应记录第72页
        (五)血清生化指标测定第72页
        (六)样品采集和准备第72-73页
        (七) 基于UHPLC-MS技术的血清代谢轮廓分析第73页
        (八)数据处理第73页
    三、结果第73-78页
        (一)参与患者的临床资料第73-74页
        (二)血清代谢轮廓分析第74-75页
        (三)代谢标志物筛选第75-77页
        (四)铁剂治疗响应相关代谢变量的预测效能评价第77-78页
    四、讨论第78-79页
    五、本章小结第79-80页
    参考文献第80-84页
第五章 基于HPLC-MS/MS技术的人血清中15种蛋白结合类尿毒症毒素的定量方法学研究第84-124页
    一、前言第84-86页
    二、仪器与试剂第86-88页
        (一)仪器与设备第86-87页
        (二)试剂第87-88页
    三、方法与结果第88-114页
        (一)分析条件第88-89页
            1.色谱条件第88页
            2.质谱条件第88-89页
        (二)标准溶液的配制第89-90页
            1.15种蛋白结合类尿毒症毒素工作溶液配制第89-90页
            2.内标卡马西平与酮洛芬工作溶液配制第90页
            3.标准曲线样品与质量控制样品(QC)的配制第90页
        (三) 血清样品收集及样品制备第90-91页
            1.临床样本收集第90-91页
            2.血清样品前处理第91页
        (四) 方法学验证第91-108页
            1.方法选择性(Selectivity)考察第91-92页
            2.标准曲线与线性范围第92-97页
            3.检测限与定量限第97页
            4.稀释效应与残留效应第97页
            5.准确度与精密度试验第97-99页
            6.基质效应第99-102页
            7.稳定性考察第102-108页
            8.随行标曲与质控第108页
        (五)真实样本测定结果第108-114页
    四、讨论第114-121页
        (一) 实验条件的初步探索与建立第114页
        (二)液相色谱条件的优化第114-116页
            1.色谱柱的选择第114-115页
            2.流动相组成、添加剂及梯度的优化第115页
            3.柱温及流速的优化第115-116页
        (三) 质谱检测条件优化第116-117页
            1.不同质谱检测器灵敏度的考察第116页
            2.质谱检测参数的优化第116页
            3.进样浓度对质谱检测的影响第116-117页
        (四) 血清样品前处理条件优化第117-119页
        (五) 内标的选择第119页
        (六) 空白基质的选择第119页
        (七) 尿毒症毒素测定结果分析第119-121页
    五、本章小结第121-122页
    参考文献第122-124页
第六章 硫酸对甲酚对成骨细胞损伤作用的转录组学与代谢组学研究- 114第124-169页
    一.前言第124-126页
    二、实验材料与方法第126-131页
        (一)材料与仪器第126-127页
            1.细胞株第126页
            2.材料与试剂第126-127页
            3.仪器与耗材第127页
        (二)细胞培养第127页
        (三)细胞活性分析第127页
        (四)细胞凋亡测定第127-128页
        (五)细胞周期测定第128页
        (六)细胞实验第128页
        (七)代谢组学分析第128-129页
        (八)转录组学分析第129-130页
        (九)PCS导致生物学功能异常的富集分析第130-131页
    三、实验结果第131-156页
        (一)PCS对MC3T3-E1细胞增殖的抑制作用第131页
        (二) PCS对MC3T3-E1细胞促凋亡作用第131-132页
        (三)PCS对MC3T3-E1细胞周期影响第132-133页
        (四)代谢组学结果第133-142页
            1.胞内提取物代谢轮廓第133-134页
            2.多元统计分析及胞内代谢物鉴别第134-139页
            3.代谢通路分析第139-142页
        (五)转录组测序结果第142-149页
            1.RNA质检结果第142-143页
            2.有效测序量评价第143-144页
            3.基因表达量分析及差异基因筛选第144-145页
            4.GO分析和Pathway分析第145-149页
        (六)整合转录组与代谢组代谢通路和相关生物学功能的显著性分析第149-156页
    四、讨论第156-159页
    五、本章小结第159-161页
    参考文献第161-169页
全文总结第169-172页
在读博士学位期间发表论文第172-174页
致谢第174页

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