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施用粪肥的设施菜地土壤中抗生素及抗性基因多样性及丰度的研究

符号说明第4-7页
中文摘要第7-9页
ABSTRACT第9-10页
1. 前言第11-20页
    1.1 抗生素的概况第11-13页
        1.1.1 抗生素的种类第11页
        1.1.2 抗生素的应用现状第11-12页
        1.1.3 抗生素在土壤环境中的行为第12-13页
    1.2 抗生素耐药菌的耐药性第13-15页
        1.2.1 细菌耐药性的产生机制第13-14页
        1.2.2 多重耐药菌的出现第14-15页
    1.3 抗生素抗性基因的概况第15-18页
        1.3.1 抗性基因的来源与分布第15页
        1.3.2 抗性基因的抗性机制第15-16页
        1.3.3 抗性基因的传播与环境风险第16-17页
        1.3.4 抗性基因的检测手段第17-18页
    1.4 抗性基因与土壤理化性质、抗生素、耐药菌及可移动元件的相关性第18-19页
    1.5 本论文的研究意义及内容第19-20页
2. 材料与方法第20-32页
    2.1 药品试剂第20-21页
    2.2 仪器设备第21页
    2.3 土壤样品的采集和理化性质的测定第21-23页
    2.4 土壤样品中抗生素含量的检测第23-24页
    2.5 土样中可培养细菌及耐药菌计数第24-26页
        2.5.1 溶液配制第25页
        2.5.2 可培养细菌的计数第25页
        2.5.3 抗生素耐药菌的计数第25-26页
    2.6 土样中抗生素耐药菌的鉴定第26-27页
        2.6.1 溶液配制第26页
        2.6.2 抗生素耐药菌的纯化培养第26页
        2.6.3 抗生素耐药菌DNA的提取第26页
        2.6.4 抗生素耐药菌的鉴定第26-27页
    2.7 土壤样品中ARGs的定性检测第27-29页
        2.7.1 土壤样品中总DNA的提取第27页
        2.7.2 ARGs和MGEs的定性PCR检测第27-29页
    2.8 土壤样品中ARGs的定量检测第29-32页
        2.8.1 试剂及培养基的配制第29-30页
        2.8.2 目标基因片段回收纯化第30页
        2.8.3 连接转化第30页
        2.8.4 质粒的提取与鉴定第30-31页
        2.8.5 基因拷贝数的计算及质粒标准品的制备第31页
        2.8.6 Real-time qPCR标准曲线的制备第31页
        2.8.7 土壤样品中抗性基因的含量检测第31-32页
    2.9 数据分析第32页
3. 结果与分析第32-53页
    3.1 土壤中抗生素含量检测结果第32-33页
    3.2 土样中可培养细菌的耐药性第33-38页
        3.2.1 可培养耐药菌的数量第33-36页
        3.2.2 可培养细菌的耐药率第36-38页
    3.3 抗生素耐药菌的鉴定第38-44页
    3.4 土样中抗性基因的定性检测第44-45页
    3.5 土样中抗性基因的定量检测第45-51页
    3.6 抗性基因与理化性质、抗生素含量、耐药菌数量及可移动元件的相关性第51-53页
4. 讨论第53-59页
    4.1 土样中抗生素的残留第53-54页
    4.2 可培养细菌的耐药性第54-55页
    4.3 可培养耐药菌的多样性第55-56页
    4.4 抗性基因的多样性及丰度第56-58页
    4.5 抗性基因与理化性质、抗生素含量、耐药菌数量及可移动元件的相关性第58-59页
5. 结论第59页
6. 创新之处第59-61页
7. 参考文献第61-67页
8. 致谢第67-68页
9. 攻读硕士期间发表论文情况第68页

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