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猪圆环病毒2型微滴式数字PCR检测方法的建立与初步应用

中文摘要第5-7页
Abstract第7-8页
缩略词表第9-14页
第一章 文献综述第14-26页
    1 PCV的病原学特征第14-16页
        1.1 PCV的发现第14-15页
        1.2 PCV形态及理化特性第15页
        1.3 培养特性第15页
        1.4 PCV基因组结构特征第15-16页
        1.5 PCV的复制第16页
    2 PCV2的致病机制第16-17页
    3 PCV2的流行及相关疾病第17-19页
        3.1 PCV2的流行情况第17页
        3.2 PCV2的相关疾病第17-19页
            3.2.1 断奶仔猪多系统衰竭综合症(PMWS)第17-18页
            3.2.2 猪皮炎与肾病综合征(PDNS)第18页
            3.2.3 增生和坏死性肺炎(PNP)第18页
            3.2.4 繁殖障碍病(Reproductive failure)第18页
            3.2.5 仔猪先天性震颤(CT)第18-19页
    4 PCV2的实验室检测技术研究进展第19-23页
        4.1 PCV2免疫学诊断方法第19-20页
            4.1.1 免疫组织化学技术(Immunohistochemistry,IHC)第19页
            4.1.2 间接免疫荧光技术(Immunofluorescence assay,IFA)第19页
            4.1.3 过氧化物酶单层试验(Immunoperoxidase monolayer assay,IPMA)第19-20页
            4.1.4 酶联免疫吸附技术(Enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)第20页
        4.2 分子生物学诊断技术第20-23页
            4.2.1 聚合酶链反应(Polymerase Chain Reaction,PCR)第20-22页
            4.2.2 限制性片段长度多态性(restrictionfragment length polymorphism,RFLP)第22页
            4.2.3 核酸环介导等温扩增技术(Loop-Mediated Isothermal Amplification,LAMP)第22-23页
            4.2.4 原位杂交技术(Nucleic acid probe and in situ hybridization,ISH)第23页
            4.2.5 基因芯片技术第23页
    5 微滴式数字PCR技术(droplet digital PCR,ddPCR)第23-25页
        5.1 技术原理及优势第24页
        5.2 研究进展第24-25页
    6 研究目的与意义第25-26页
第二章 猪圆环病毒2型微滴式数字PCR检测方法的建立第26-43页
    1 实验材料第26-27页
        1.1 实验仪器第26-27页
        1.2 主要试剂第27页
        1.3 实验样品第27页
    2 实验方法第27-33页
        2.1 引物和探针的设计与合成第27-28页
        2.2 病毒核酸的提取第28页
        2.3 RNA反转录第28-29页
        2.4 重组质粒标准品的制备第29-30页
            2.4.1 目的片段的扩增第29页
            2.4.2 目的片段的回收与纯化第29页
            2.4.3 纯化产物连接与转化第29页
            2.4.4 感受态细胞的制备第29-30页
        2.5 qPCR检测条件的确定第30页
        2.6 ddPCR检测方法的建立第30-33页
            2.6.1 ddPCR的工作流程第30-31页
            2.6.2 ddPCR反应条件的优化第31-32页
            2.6.3 标准曲线的建立及对比第32页
            2.6.4 特异性试验第32页
            2.6.5 敏感性试验第32页
            2.6.6 重复性试验第32-33页
    3 结果第33-41页
        3.1 重组质粒标准品的制备第33页
        3.2 qPCR反应条件的优化第33-35页
            3.2.1 退火温度优化第33-34页
            3.2.2 引物浓度优化第34页
            3.2.3 探针浓度优化第34-35页
        3.3 ddPCR反应条件的优化第35-37页
            3.3.1 退火温度优化第35-36页
            3.3.2 引物浓度的优化第36页
            3.3.3 探针浓度的优化第36-37页
        3.4 ddPCR与qPCR标准曲线的建立及对比第37-38页
        3.5 特异性试验第38-39页
        3.6 敏感性试验第39-40页
        3.7 重复性试验第40-41页
    4 分析与讨论第41-42页
    5 小结第42-43页
第三章 猪圆环病毒2型微滴式数字PCR检测方法的初步应用第43-51页
    1 材料和方法第43-46页
        1.1 临床样品采集第43页
        1.2 主要试剂及耗材第43-44页
        1.3 主要实验仪器第44页
        1.4 实验方法第44-46页
            1.4.1 组织样品处理第44页
            1.4.2 病毒DNA提取第44-45页
            1.4.3 ddPCR检测方法临床应用第45-46页
    2 结果第46-48页
        2.1 临床血清样品检测第46-47页
        2.2 不同脏器组织中PCV2含量检测第47页
        2.3 PCV2疫苗半成品病毒含量检测第47-48页
    3 分析与讨论第48-50页
    4 小结第50-51页
结论与创新点第51-52页
    1 结论第51页
    2 创新点第51-52页
参考文献第52-59页
致谢第59-60页
攻读学位期间发表的学术论文目录第60页

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