猪流行性腹泻病毒感染PK-15细胞miRNA表达谱变化及其对病毒增殖影响的初步研究
中文摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-7页 |
缩略词表 | 第7-10页 |
第一章 文章综述及研究的目的及意义 | 第10-25页 |
1. 猪流行性腹泻病毒研究概况 | 第10-17页 |
·形态与理化特性 | 第10-11页 |
·培养特性 | 第11-12页 |
·基因结构和功能 | 第12-15页 |
·S基因及其编码的S蛋白 | 第12-13页 |
·M基因及其编码的M蛋白 | 第13页 |
·sM基因及其编码的sM蛋白 | 第13-14页 |
·N基因及其编码的N蛋白 | 第14页 |
·Pol基因及其编码的复制酶多聚蛋白 | 第14-15页 |
·病毒的复制 | 第15页 |
·致病机理 | 第15-16页 |
·病毒的防治 | 第16-17页 |
2. MIRNA的研究进展 | 第17-24页 |
·MIRNA的发现 | 第17-18页 |
·MIRNA的形成 | 第18-19页 |
·MIRNA的作用机制 | 第19-20页 |
·宿主MIRNA与RNA病毒 | 第20-22页 |
·MIRNA的研究方法 | 第22-23页 |
·miRNA的鉴定方法 | 第22-23页 |
·miRNA的定量检测方法 | 第23页 |
·MIRNA的靶基因预测 | 第23-24页 |
·MIRNA的应用前景 | 第24页 |
3. 研究的目的及意义 | 第24-25页 |
第二章 研究内容 | 第25-46页 |
1. 材料与方法 | 第25-34页 |
·材料 | 第25-26页 |
·病毒与细胞 | 第25页 |
·试剂及配制溶液 | 第25-26页 |
·仪器 | 第26页 |
·方法 | 第26-31页 |
·PEDV感染PK-15细胞 | 第26页 |
·总RNA的提取 | 第26-27页 |
·RNA质量鉴定 | 第27页 |
·RNA样品文库的构建 | 第27-28页 |
·solexa高通量测序 | 第28页 |
·分析小RNA数据 | 第28-29页 |
·RT-qPCR验证差异表达的miRNA | 第29-31页 |
·MIRNA对病毒增殖的影响 | 第31-34页 |
·转染miRNA | 第31-32页 |
·Real-time PCR检测 | 第32-34页 |
3. 结果 | 第34-42页 |
·PEDV感染PK-15细胞 | 第34页 |
·总RNA样品质量鉴定 | 第34-35页 |
·高通量测序结果 | 第35-39页 |
·原始数据统计 | 第35页 |
·sRNA的长度分布 | 第35-36页 |
·miRNA基因分布 | 第36页 |
·差异性表达miRNA结果 | 第36-37页 |
·miRNA的GO分析 | 第37-39页 |
·RT-QPCR验证差异表达的MIRNA结果 | 第39-40页 |
·靶向PEDV基因组的MIRNA预测 | 第40页 |
·MIRNA对病毒增殖的影响 | 第40-42页 |
4. 讨论 | 第42-45页 |
·病毒和细胞的选择 | 第42页 |
·差异性表达谱的分析 | 第42-43页 |
·MIRNA对病毒的抑制作用 | 第43-45页 |
5. 结论 | 第45-46页 |
参考文献 | 第46-52页 |
致谢 | 第52-54页 |
附录 | 第54-60页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第60页 |