猪流行性腹泻病毒感染PK-15细胞miRNA表达谱变化及其对病毒增殖影响的初步研究
| 中文摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 缩略词表 | 第7-10页 |
| 第一章 文章综述及研究的目的及意义 | 第10-25页 |
| 1. 猪流行性腹泻病毒研究概况 | 第10-17页 |
| ·形态与理化特性 | 第10-11页 |
| ·培养特性 | 第11-12页 |
| ·基因结构和功能 | 第12-15页 |
| ·S基因及其编码的S蛋白 | 第12-13页 |
| ·M基因及其编码的M蛋白 | 第13页 |
| ·sM基因及其编码的sM蛋白 | 第13-14页 |
| ·N基因及其编码的N蛋白 | 第14页 |
| ·Pol基因及其编码的复制酶多聚蛋白 | 第14-15页 |
| ·病毒的复制 | 第15页 |
| ·致病机理 | 第15-16页 |
| ·病毒的防治 | 第16-17页 |
| 2. MIRNA的研究进展 | 第17-24页 |
| ·MIRNA的发现 | 第17-18页 |
| ·MIRNA的形成 | 第18-19页 |
| ·MIRNA的作用机制 | 第19-20页 |
| ·宿主MIRNA与RNA病毒 | 第20-22页 |
| ·MIRNA的研究方法 | 第22-23页 |
| ·miRNA的鉴定方法 | 第22-23页 |
| ·miRNA的定量检测方法 | 第23页 |
| ·MIRNA的靶基因预测 | 第23-24页 |
| ·MIRNA的应用前景 | 第24页 |
| 3. 研究的目的及意义 | 第24-25页 |
| 第二章 研究内容 | 第25-46页 |
| 1. 材料与方法 | 第25-34页 |
| ·材料 | 第25-26页 |
| ·病毒与细胞 | 第25页 |
| ·试剂及配制溶液 | 第25-26页 |
| ·仪器 | 第26页 |
| ·方法 | 第26-31页 |
| ·PEDV感染PK-15细胞 | 第26页 |
| ·总RNA的提取 | 第26-27页 |
| ·RNA质量鉴定 | 第27页 |
| ·RNA样品文库的构建 | 第27-28页 |
| ·solexa高通量测序 | 第28页 |
| ·分析小RNA数据 | 第28-29页 |
| ·RT-qPCR验证差异表达的miRNA | 第29-31页 |
| ·MIRNA对病毒增殖的影响 | 第31-34页 |
| ·转染miRNA | 第31-32页 |
| ·Real-time PCR检测 | 第32-34页 |
| 3. 结果 | 第34-42页 |
| ·PEDV感染PK-15细胞 | 第34页 |
| ·总RNA样品质量鉴定 | 第34-35页 |
| ·高通量测序结果 | 第35-39页 |
| ·原始数据统计 | 第35页 |
| ·sRNA的长度分布 | 第35-36页 |
| ·miRNA基因分布 | 第36页 |
| ·差异性表达miRNA结果 | 第36-37页 |
| ·miRNA的GO分析 | 第37-39页 |
| ·RT-QPCR验证差异表达的MIRNA结果 | 第39-40页 |
| ·靶向PEDV基因组的MIRNA预测 | 第40页 |
| ·MIRNA对病毒增殖的影响 | 第40-42页 |
| 4. 讨论 | 第42-45页 |
| ·病毒和细胞的选择 | 第42页 |
| ·差异性表达谱的分析 | 第42-43页 |
| ·MIRNA对病毒的抑制作用 | 第43-45页 |
| 5. 结论 | 第45-46页 |
| 参考文献 | 第46-52页 |
| 致谢 | 第52-54页 |
| 附录 | 第54-60页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第60页 |