| 摘要 | 第1-12页 |
| ABSTRACT | 第12-18页 |
| 第一章 文献综述 | 第18-28页 |
| ·microRNA的概述 | 第18-23页 |
| ·microRNA的发现 | 第18页 |
| ·microRNA的生物合成和作用机制 | 第18-20页 |
| ·miRNA在植物中的生物学功能 | 第20-23页 |
| ·外源miRNA的跨界调节研究现状 | 第23-28页 |
| ·外源miRNA能进行跨界调节 | 第24-26页 |
| ·外源miRNA不能进行跨界转运 | 第26-28页 |
| 第二章 引言 | 第28-32页 |
| ·研究背景 | 第28页 |
| ·研究目的和意义 | 第28-29页 |
| ·主要研究内容 | 第29页 |
| ·技术路线 | 第29-32页 |
| 第三章 利用高通量测序技术鉴定川桑的保守miRNA和新miRNA | 第32-56页 |
| ·材料和方法 | 第32-36页 |
| ·植物材料和小RNA文库的构建 | 第32-33页 |
| ·小RNA生物信息学分析 | 第33页 |
| ·新miRNA的预测 | 第33页 |
| ·采用qRT-PCR检测川桑miRNA和靶基因的表达量 | 第33-35页 |
| ·miRNA靶基因的预测 | 第35-36页 |
| ·结果与分析 | 第36-54页 |
| ·桑树3个组织的小RNA分析 | 第36-37页 |
| ·桑树保守miRNA的鉴定 | 第37-39页 |
| ·桑树新miRNA的鉴定 | 第39-40页 |
| ·桑树组织倾向性miRNA的鉴定 | 第40-49页 |
| ·利用RT-PCR检测川桑miRNA及其靶基因的表达水平 | 第49页 |
| ·miRNA靶基因的预测 | 第49-52页 |
| ·利用荧光定量PCR检测靶基因的表达模式 | 第52-54页 |
| ·小结与讨论 | 第54-56页 |
| 第四章 栽培桑miRNA的鉴定及其与野生桑miRNA的比较分析 | 第56-72页 |
| ·材料和方法 | 第56-57页 |
| ·材料 | 第56页 |
| ·两个栽培桑品系总RNA的提取和小RNA文库的构建 | 第56页 |
| ·小RNA的生物信息学分析和保守miRNA的鉴定 | 第56-57页 |
| ·新miRNA的预测 | 第57页 |
| ·miRNA的靶基因预测 | 第57页 |
| ·结果与分析 | 第57-62页 |
| ·栽培桑和野生桑叶片小RNA序列分析 | 第57-59页 |
| ·栽培桑和野生桑保守miRNA的比较分析 | 第59-60页 |
| ·栽培桑和野生桑新miRNA的比较分析 | 第60页 |
| ·差异表达miRNA对应靶基因的分析 | 第60-61页 |
| ·栽培桑和野生桑差异表达的miRNA靶基因的GO和KEGG分析 | 第61-62页 |
| ·小结与讨论 | 第62-72页 |
| 第五章 家蚕血淋巴小RNA种类的鉴定和分析 | 第72-90页 |
| ·材料和方法 | 第72-75页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴的收集 | 第72-73页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴小RNA的提取 | 第73-74页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴小RNA文库的构建 | 第74页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴小RNA的生物信息学分析 | 第74页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴已知miRNA和新miRNA的鉴定 | 第74页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴tRNA衍生片段(tsRNA)的分类鉴定 | 第74页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴中表达量最高且属于3种氨基酸的tsRNA的位置分析 | 第74页 |
| ·存在家蚕幼虫血淋巴中桑树源miRNA的鉴定 | 第74-75页 |
| ·结果与分析 | 第75-87页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴小RNA种类和长度分析 | 第75-77页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴tsRNA归类鉴定 | 第77-81页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴已知miRNA的鉴定 | 第81-85页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴新miRNA的鉴定 | 第85-87页 |
| ·家蚕幼虫血淋巴中植物源miRNA的鉴定 | 第87页 |
| ·小结与讨论 | 第87-90页 |
| 第六章 家蚕体内桑树miRNA的鉴定及miR166b的功能研究 | 第90-118页 |
| ·材料和方法 | 第90-99页 |
| ·家蚕天然血淋巴、多种组织的收集 | 第90页 |
| ·喂食人工合成miR166b的家蚕组织的收集 | 第90-91页 |
| ·RNA提取,反转录,T-A克隆和Sanger测序 | 第91-94页 |
| ·微滴数字化PCR(ddPCR)检测人工合成的miR166b在家蚕摄食前后的拷贝数 | 第94-96页 |
| ·转录组测序材料的准备 | 第96页 |
| ·喂食人工合成miR166b前后的转录组数据分析 | 第96-97页 |
| ·miR166b在30个差异表达基因和家蚕全长cDNA中的靶位点预测 | 第97页 |
| ·miR166b的候选靶基因和喂食人工合成miR166c或167e的6个差异基因RT-PCR检测 | 第97-98页 |
| ·喂食人工合成miR166b之后的表型调查 | 第98-99页 |
| ·结果与分析 | 第99-115页 |
| ·利用T-A克隆和Sanger测序验证桑树源的miRNA存在家蚕的血淋巴中 | 第99-100页 |
| ·桑树源的miRNA存在家蚕的多个组织中 | 第100-102页 |
| ·人工合成的miR166b能进入家蚕体内 | 第102-104页 |
| ·miR166b候选靶基因的表达水平不被人工合成miR166b所抑制 | 第104-109页 |
| ·家蚕喂食人工合成miR166b后的转录组分析 | 第109-114页 |
| ·喂食人工合成miR166b后的家蚕表型调查 | 第114-115页 |
| ·小结与讨论 | 第115-118页 |
| 综合与结论 | 第118-120页 |
| 论文创新点 | 第120-122页 |
| 附录 | 第122-208页 |
| 参考文献 | 第208-218页 |
| 在读期间发表论文及参加课题 | 第218-220页 |
| 致谢 | 第220页 |
