| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-14页 |
| 第1章 文献综述 | 第14-24页 |
| 1 遗传标记的发展阶段 | 第14-17页 |
| ·形态学标记 | 第14页 |
| ·细胞学标记 | 第14页 |
| ·生化标记 | 第14-15页 |
| ·分子标记 | 第15-17页 |
| ·RFLP | 第15-16页 |
| ·RAPD | 第16页 |
| ·AFLP | 第16页 |
| ·线粒体 DNA 标记(Mitochondrial DNA markers) | 第16页 |
| ·SSR | 第16-17页 |
| ·SNP | 第17页 |
| 2 微卫星分子标记的获取方法 | 第17-18页 |
| ·直接利用文献资料中的 SSR 标记 | 第17页 |
| ·利用近缘物种的 SSR 标记 | 第17-18页 |
| ·从公共数据库筛选 SSR 标记 | 第18页 |
| ·从基因组中筛选 SSR 标记 | 第18页 |
| 3 微卫星标记在水产动物中的应用 | 第18-19页 |
| ·遗传多样性和遗传结构分析 | 第18页 |
| ·遗传连锁图谱构建及 QTL(Quantitative Trait Locus )定位 | 第18-19页 |
| ·亲缘关系鉴定 | 第19页 |
| ·在增殖放流中的应用 | 第19页 |
| 4 日本对虾概况 | 第19-24页 |
| ·日本对虾的分类地位和自然分布 | 第19页 |
| ·日本对虾的外部形态和生活习性 | 第19-20页 |
| ·日本对虾的经济和生态地位 | 第20页 |
| ·分子标记在日本对虾中的应用 | 第20-22页 |
| ·国外的研究进展 | 第20-21页 |
| ·国内的研究进展 | 第21-22页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第22-24页 |
| 第2章 日本对虾育种群体两个世代的遗传结构分析 | 第24-37页 |
| 1 实验材料及用品 | 第24-25页 |
| ·实验材料 | 第24页 |
| ·实验用到的主要试剂及配方 | 第24-25页 |
| ·实验用到的主要仪器 | 第25页 |
| 2 实验方法 | 第25-27页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第25-26页 |
| ·基因组 DNA 质量的检测 | 第26页 |
| ·引物合成及 PCR 扩增 | 第26-27页 |
| ·基因分型 | 第27页 |
| ·数据分析 | 第27页 |
| 3 结果 | 第27-34页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第27-28页 |
| ·8 个微卫星位点扩增结果及多态性 | 第28-31页 |
| ·聚类分析和进化树的构建 | 第31-34页 |
| 4. 讨论 | 第34-37页 |
| ·两个世代的遗传多样性 | 第34-35页 |
| ·Hardy-Weinberg 平衡分析 | 第35-36页 |
| ·遗传距离分析 | 第36-37页 |
| 第3章 日本对虾育种群体高温耐受性评估 | 第37-44页 |
| 1 材料与方法 | 第37-39页 |
| ·实验材料 | 第37页 |
| ·耐高温性状的测试 | 第37-38页 |
| ·生长性状的测量 | 第38页 |
| ·基因分型 | 第38页 |
| ·统计分析 | 第38-39页 |
| 2. 结果与分析 | 第39-43页 |
| ·各性状的表型参数统计量 | 第39页 |
| ·形态性状间的相关系数 | 第39页 |
| ·各生长性状对 UTT 的通径系数 | 第39-40页 |
| ·各生长性状对 UTT 的作用 | 第40-41页 |
| ·各生长性状对 UTT 的决定程度分析 | 第41页 |
| ·多元回归方程的建立 | 第41-42页 |
| ·近交系数的统计量及与生长和耐高温性状的相关性 | 第42-43页 |
| 3 讨论 | 第43-44页 |
| 第4章 日本对虾育种群体自然交尾家系的父本快速识别 | 第44-53页 |
| 1 材料与方法 | 第44-46页 |
| ·材料 | 第44页 |
| ·DNA 的提取 | 第44页 |
| ·PCR 程序 | 第44-46页 |
| ·亲权分析 | 第46页 |
| 2 实验结果 | 第46-51页 |
| ·模拟分析结果 | 第46页 |
| ·亲子鉴定结果 | 第46-51页 |
| 3 分析与讨论 | 第51-53页 |
| ·父本鉴定的结果 | 第51页 |
| ·子代混合样品的优缺点 | 第51-53页 |
| 第5章 日本对虾育种群体多家系亲缘关系分析和遗传参数估计 | 第53-67页 |
| 1 材料和方法 | 第53-55页 |
| ·实验材料 | 第53-54页 |
| ·基因组 DNA 的提取 | 第54页 |
| ·引物合成及 PCR 反应 | 第54页 |
| ·数据处理 | 第54-55页 |
| ·亲缘关系鉴定分析 | 第54页 |
| ·遗传参数估计 | 第54-55页 |
| 2 结果与分析 | 第55-67页 |
| ·微卫星扩增结果及多态性 | 第55-56页 |
| ·家系间的遗传分化 | 第56-58页 |
| ·遗传相关性和聚类分析 | 第56-57页 |
| ·家系间的遗传分化分析 | 第57页 |
| ·家系间的鉴定及无效等位基因分析 | 第57-58页 |
| ·家系收获体重的遗传参数估计 | 第58-67页 |
| 第6章 日本对虾育种群体耐高温相关 SNP 位点分析 | 第67-72页 |
| 1 材料和方法 | 第67-69页 |
| ·实验材料 | 第67页 |
| ·操作步骤 | 第67-69页 |
| ·SLAF 文库的构建 | 第67-69页 |
| ·测序数据的分析 | 第69页 |
| 2 结果与分析 | 第69-72页 |
| ·双末端测序和 SLAF 标签的开发 | 第69页 |
| ·与耐高温性状相关 SNP 的发掘 | 第69-72页 |
| 小结 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-83页 |
| 致谢 | 第83页 |
