| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-13页 |
| 英文缩写说明 | 第13-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-23页 |
| 1. 试验品种概况 | 第15-16页 |
| ·温州水牛 | 第15页 |
| ·中国荷斯坦牛 | 第15页 |
| ·鲁西黄牛 | 第15页 |
| ·温岭高峰牛 | 第15-16页 |
| ·天台黄牛 | 第16页 |
| 2 奶牛产奶性状与乳房炎 | 第16页 |
| 3 干扰素刺激基因ISG15(IFN-STIMULATED GENE 15,ISG15) | 第16-19页 |
| ·ISG15与病毒、细菌及寄生虫感染 | 第17-18页 |
| ·ISG15与肿瘤 | 第18页 |
| ·ISG15与母体妊娠 | 第18-19页 |
| 4 白细胞介素-8(INTERLEUKIN-8,IL8) | 第19-22页 |
| ·IL8与感染和炎症反应 | 第20页 |
| ·IL8与脂质代谢 | 第20-21页 |
| ·IL8与疾病 | 第21-22页 |
| 5. 研究目的及意义 | 第22-23页 |
| 第二章 温州水牛ISG15基因克隆与序列分析 | 第23-37页 |
| 1 材料与方法 | 第23-29页 |
| ·试验材料与采样方法 | 第23页 |
| ·牛外周血白细胞总RNA的提取与纯化 | 第23-24页 |
| ·RNA的反转录 | 第24-25页 |
| ·温州水牛ISG15基因克隆引物的设计 | 第25页 |
| ·应用RACE技术扩增温州水牛ISG15基因 | 第25-26页 |
| ·牛ISG15基因(含3'和5’侧翼区)DNA序列的克隆 | 第26页 |
| ·目的片段的纯化、克隆和测序 | 第26-28页 |
| ·温州水牛ISG15 MRNA序列拼接及反刍动物ISG15基因MRNA序列的多重比对 | 第28页 |
| ·哺乳动物ISG15 DNA序列的多重比对 | 第28页 |
| ·哺乳动物ISG15蛋白序列的多重比对及温州水牛ISG15蛋白的生物信息学分析 | 第28-29页 |
| 2 结果 | 第29-34页 |
| ·温州水牛ISG15基因克隆 | 第29-30页 |
| ·温州水牛ISG15序列拼接及ORF分析 | 第30-31页 |
| ·反刍动物ISG15基因的多重比较 | 第31页 |
| ·温州水牛ISG15蛋白序列与生物信息学分析 | 第31-32页 |
| ·哺乳动物ISG15蛋白的多重比较 | 第32-33页 |
| ·温州水牛ISG15蛋白功能分析 | 第33-34页 |
| 3 讨论 | 第34-37页 |
| ·ISG15蛋白功能域分析 | 第34-35页 |
| ·哺乳动物ISG15蛋白的成熟 | 第35-36页 |
| ·ISG15蛋白的信号肽 | 第36-37页 |
| 第三章 温州水牛IL8基因克隆与序列分析 | 第37-49页 |
| 1 材料与方法 | 第37-40页 |
| ·试验材料与采样方法 | 第37页 |
| ·牛外周血总RNA的提取 | 第37页 |
| ·RNA的反转录 | 第37页 |
| ·温州水牛IL8基因克隆引物的设计 | 第37页 |
| ·应用RACE技术扩增温州水牛IL8基因 | 第37-38页 |
| ·牛IL8基因(含3'和5'侧翼区)DNA序列的克隆 | 第38页 |
| ·目的片段的纯化、克隆和测序 | 第38-39页 |
| ·温州水牛IL8 MRNA序列拼接及反刍动物IL8基因MRNA序列的多重比对 | 第39页 |
| ·哺乳动物IL8 DNA序列的多重比对 | 第39页 |
| ·哺乳动物IL8蛋白序列的多重比对及温州水牛IL8蛋白的生物信息学分析 | 第39-40页 |
| 2 结果 | 第40-46页 |
| ·温州水牛IL8基因克隆 | 第40-41页 |
| ·温州水牛IL8序列拼接及ORF分析 | 第41-42页 |
| ·反刍动物IL8基因的多重比对 | 第42页 |
| ·温州水牛IL8蛋白序列与生物信息学分析 | 第42-44页 |
| ·哺乳动物IL8蛋白的多重比对 | 第44页 |
| ·温州水牛IL8蛋白功能分析 | 第44-46页 |
| 3 讨论 | 第46-49页 |
| ·温州水牛IL8 MRNA不稳定基序 | 第46-47页 |
| ·IL8的蛋白分析 | 第47-48页 |
| ·IL8与信号肽 | 第47页 |
| ·IL8蛋白功能域分析 | 第47-48页 |
| ·IL8与乳房炎 | 第48-49页 |
| 第四章 牛ISG15基因单核苷酸多态性及其与产奶性状关联分析 | 第49-63页 |
| 1 材料与方法 | 第49-54页 |
| ·试验动物及采样方法 | 第49页 |
| ·DNA提取 | 第49-50页 |
| ·温州水牛和中国荷斯坦牛ISG15基因的PCR扩增及检测 | 第50-52页 |
| ·PCR-SSCP分析 | 第52-53页 |
| ·PCR产物的纯化、回收及测序 | 第53页 |
| ·序列分析 | 第53页 |
| ·统计分析 | 第53-54页 |
| 2 结果 | 第54-61页 |
| ·牛ISG15基因PCR-SSCP引物设计及PCR扩增 | 第54-55页 |
| ·牛ISG15基因PCR-SSCP检测与突变区域测序 | 第55-58页 |
| ·牛ISG15基因SNPs的群体遗传学分析 | 第58-60页 |
| ·牛ISG15基因SNPs对转录因子结合位点的影响 | 第60-61页 |
| ·ISG15基因SNPs与中国荷斯坦牛泌乳性状的关联分析 | 第61页 |
| 3 讨论 | 第61-63页 |
| ·ISG15基因SNPs对转录因子结合位点的影响 | 第61-62页 |
| ·牛ISGl5基因突变 | 第62-63页 |
| 第五章 牛IL8基因单核苷酸多态性及其与中国荷斯坦奶产奶性状关联分析 | 第63-85页 |
| 1 材料与方法 | 第63-65页 |
| ·试验动物及采样方法 | 第63页 |
| ·DNA提取 | 第63页 |
| ·温州水牛和中国荷斯坦牛IL8基因的PCR扩增及检测 | 第63-64页 |
| ·PCR-SSCP分析 | 第64页 |
| ·PCR产物的纯化回收及克隆及测序 | 第64页 |
| ·序列分析 | 第64页 |
| ·统计分析 | 第64-65页 |
| 2 结果 | 第65-82页 |
| ·中国荷斯坦牛和温州水牛IL8基因PCR-SSCP引物设计及PCR扩增 | 第65页 |
| ·温州水牛IL8基因PCR-SSCP检测 | 第65页 |
| ·中国荷斯坦牛、天台黄牛、温岭高峰牛IL8基因PCR-SSCP检测及测序(含鲁西黄牛) | 第65-74页 |
| ·中国荷斯坦牛IL8基因SNPs对转录因子结合位点的影响 | 第74页 |
| ·牛IL8基因SNPs的群体遗传学分析 | 第74-79页 |
| ·IL8基因内的SNPs与中国荷斯坦牛乳质性状的关联分析 | 第79-82页 |
| 3 讨论 | 第82-85页 |
| ·牛IL8基因突变分析 | 第82-83页 |
| ·IL8基因内的SNP对转录因子结合位点的影响 | 第83-85页 |
| 第六章 全文结论 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-95页 |
| 附录1 反刍动物ISG15基因MRNA的多重比对(CLUSTALX 1.83) | 第95-96页 |
| 附录2 哺乳动物ISG15蛋白的多重比对(CLUSTALX 1.83) | 第96-99页 |
| 附录3 反刍动物IL8基因MRNA的多重比对(CLUSTALX 1.83) | 第99-102页 |
| 附录4 哺乳动物IL8蛋白的多重比对(CLUSTALX 1.83) | 第102-103页 |
| 附录5 温州水牛ISG15基因与反刍动物标准序列的多重比对(CLUSTALX 1.83) | 第103-106页 |
| 附录6 温州水牛IL8基因与反刍动物标准序列的多重比对(CLUSTALX 1.83) | 第106-113页 |
| 附录7 温州水牛ISG15基因内的转录因子结合位点预测 | 第113-131页 |
| 附录8 中国荷斯坦奶牛IL8基因(NC_000163)内的转录因子结合位点预测 | 第131-153页 |
| 致谢 | 第153-154页 |
| 攻读学位期间取得的研究成果 | 第154-155页 |
