| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-14页 |
| 第1章 引言 | 第14-34页 |
| ·线粒体基因组的基本特征 | 第14-18页 |
| ·结构特征 | 第14-15页 |
| ·各组分特征 | 第15-16页 |
| ·应用价值 | 第16-18页 |
| ·比较基因组学概述 | 第18-22页 |
| ·全基因组的比较研究 | 第18-21页 |
| ·系统发生的进化关系分析 | 第21-22页 |
| ·系统进化 | 第22-31页 |
| ·不同的数据集对系统的影响 | 第22-28页 |
| ·数据处理对系统构建的影响 | 第28-31页 |
| ·论文的研究意义与总体思路 | 第31-34页 |
| ·论文的研究背景及意义 | 第31-32页 |
| ·论文的总体思路与框架 | 第32-34页 |
| 第2章 四种直翅目蝗虫线粒体全基因组结构分析 | 第34-66页 |
| ·基本材料和方法 | 第34-38页 |
| ·昆虫样品采集与形态学鉴定 | 第34页 |
| ·主要仪器与试剂 | 第34-35页 |
| ·实验方法 | 第35-38页 |
| ·结果分析 | 第38-66页 |
| ·西伯利亚蝗线粒体基因组的基本特征 | 第38-43页 |
| ·红胫波腿蝗线粒体基因组的基本特征 | 第43-51页 |
| ·贺兰山短臂蝗线粒体基因组的基本特征 | 第51-58页 |
| ·红缘疙蝗线粒体基因组的基本特征 | 第58-66页 |
| 第3章 直翅目线粒体基因组碱基组成演化模式 | 第66-100页 |
| ·材料与方法 | 第66-69页 |
| ·序列来源 | 第66-68页 |
| ·分析方法 | 第68-69页 |
| ·结果分析 | 第69-100页 |
| ·昆虫纲线粒体基因组碱基组成演化模式 | 第69-71页 |
| ·直翅目线粒体总蛋白基因的碱基组成异质性分析 | 第71-75页 |
| ·蛋白编码基因碱基组成的链间偏向性 | 第75页 |
| ·13个线粒体蛋白基因的序列特征 | 第75-86页 |
| ·tRNA基因的长度变异及序列分化 | 第86-90页 |
| ·rRNA基因的长度变异及序列分化 | 第90-100页 |
| 第4章 槌角蝗科线粒体基因组比较研究 | 第100-119页 |
| ·13个线粒体蛋白基因的长度变异及序列分化 | 第100-106页 |
| ·长度变异 | 第100-101页 |
| ·核苷酸和氨基酸序列变异 | 第101-103页 |
| ·遗传P-距离分析 | 第103-104页 |
| ·非同义与同义置换率的比率分析 | 第104-106页 |
| ·线粒体蛋白基因碱基组成的链间偏向性 | 第106-107页 |
| ·全线粒体基因组分区域的碱基组成比较 | 第107-108页 |
| ·A+T含量(AT%) | 第107页 |
| ·AT-偏斜和GC-偏斜 | 第107-108页 |
| ·线粒体各蛋白基因的碱基组成 | 第108-111页 |
| ·A+T含量(AT%) | 第108页 |
| ·AT-偏斜和GC-偏斜 | 第108-111页 |
| ·tRNA二级结构的比较 | 第111-113页 |
| ·rrnS和rrnL二级结构的比较 | 第113-116页 |
| ·rrnS的比较 | 第113页 |
| ·rrnL的比较 | 第113-116页 |
| ·A+T丰富区的比较 | 第116-119页 |
| 第5章 癞蝗科线粒体基因组比较研究 | 第119-130页 |
| ·13个线粒体蛋白基因的长度变异及序列分化(每个PCG) | 第119-124页 |
| ·长度变异 | 第119页 |
| ·核苷酸和氨基酸序列变异 | 第119-122页 |
| ·遗传P-距离及非同义与同义置换率的比率分析 | 第122-124页 |
| ·线粒体蛋白基因碱基组成的链间偏向性 | 第124页 |
| ·全线粒体基因组分区域的碱基组成比较 | 第124-126页 |
| ·A+T含量(AT%) | 第125页 |
| ·AT-偏斜和GC-偏斜 | 第125-126页 |
| ·线粒体各蛋白基因的碱基组成 | 第126-128页 |
| ·A+T含量(AT%) | 第126页 |
| ·AT-偏斜和GC-偏斜 | 第126-128页 |
| ·A+T丰富区的比较 | 第128-130页 |
| 第6章 基于线粒体基因组序列的直翅目昆虫系统发育关系 | 第130-145页 |
| ·材料与方法 | 第130-133页 |
| ·外类群的选择 | 第130-131页 |
| ·参考数据序列来源 | 第131-132页 |
| ·序列比对及修饰 | 第132-133页 |
| ·构建系统发育树 | 第133页 |
| ·结果分析 | 第133-145页 |
| ·基于蛋白密码子位点数据集构建系统树 | 第133-139页 |
| ·基于不同蛋白类型及rRNA不同区段数据集构建系统树 | 第139-145页 |
| 第7章 总结 | 第145-152页 |
| ·结果与讨论 | 第145-150页 |
| ·槌角蝗科线粒体基因的序列特征 | 第145-146页 |
| ·癞蝗科 | 第146页 |
| ·两科内整体碱基组成共同特性 | 第146页 |
| ·昆虫纲线粒体基因组碱基组成演化 | 第146-148页 |
| ·不同数据集的系统建树分析 | 第148-150页 |
| ·创新之处 | 第150页 |
| ·不足之处 | 第150-152页 |
| 参考文献 | 第152-177页 |
| 致谢 | 第177-178页 |
| 攻读博士学位期间研究成果 | 第178-179页 |
