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二硫键和拇指结构对木聚糖酶温度及pH特性的影响

摘要第1-4页
Abstract第4-10页
第一章 绪论第10-18页
   ·木聚糖酶概述第10-12页
     ·木聚糖酶的应用第10-12页
     ·木聚糖酶的分类第12页
   ·GH11 木聚糖酶的结构特征第12-13页
     ·11 家族木聚糖酶的基本结构特征第12-13页
     ·11 家族木聚糖酶 N 端二硫键第13页
     ·11 家族木聚糖酶拇指结构第13页
   ·酶分子改造第13-15页
     ·定点突变第14页
     ·杂合酶技术第14页
     ·计算机辅助设计第14-15页
     ·分子动力学模拟第15页
   ·国内外研究进展第15-16页
     ·利用生物信息学工具研究酶蛋白的进展第15-16页
     ·木聚糖酶研究进展第16页
   ·本课题研究的内容和意义第16-18页
     ·研究的基础第16-17页
     ·研究内容第17页
     ·研究意义第17-18页
第二章 木聚糖酶二硫键的生物信息学分析第18-23页
   ·引言第18页
   ·实验材料第18-20页
     ·研究对象第18-19页
     ·计算机硬件配置第19页
     ·同源建模、计算及分析软件第19页
     ·常用数据库第19-20页
   ·实验方法第20-21页
     ·木聚糖酶一级结构的同源比对第20页
     ·同源建模第20页
     ·EvXyn11M的分子动力学模拟第20-21页
   ·结果与讨论第21-23页
     ·木聚糖酶一级结构的分析第21页
     ·木聚糖酶 EvXyn11M的分子动力学模拟第21-23页
第三章 二硫键影响木聚糖酶温度特性的验证第23-36页
   ·引言第23页
   ·实验材料第23-26页
     ·主要仪器第23页
     ·菌种和试剂第23-24页
     ·实验软件第24页
     ·培养基及主要溶液配制第24-26页
   ·实验方法第26-31页
     ·合成基因 Evxyn11TS二硫键的去除第26页
     ·琼脂糖凝胶电泳检测第26页
     ·PCR 产物的纯化第26-27页
     ·大肠杆菌 JM109 感受态细胞的制备第27页
     ·重组质粒的转化及蓝白斑筛选第27页
     ·质粒提取方法(碱法)第27-28页
     ·pUCm-T-Evxyn11M载体的构建第28页
     ·pPIC9K-Evxyn11M的构建第28-29页
     ·酵母感受态的制备第29页
     ·pPIC9K- Evxyn11M的转化第29页
     ·毕赤酵母重组子的筛选第29-30页
     ·毕赤酵母重组子的表达第30页
     ·表达产物的 SDS-PAGE 鉴定第30页
     ·重组酶的纯化第30-31页
     ·DNS 法测定木聚糖酶活性第31页
     ·酶学性质测定第31页
   ·结果与讨论第31-36页
     ·合成基因 Evxyn11TS二硫键的去除第31-32页
     ·pUCm-T- Evxyn11M和 pPIC9K-Evxyn11M的构建的第32-33页
     ·酵母基因组的 PCR 验证第33页
     ·重组木聚糖酶的表达和纯化第33-34页
     ·酶学性质分析第34-36页
第四章 木聚糖酶拇指结构的生物信息学分析第36-43页
   ·引言第36-37页
   ·实验材料第37页
     ·研究对象第37页
     ·计算机硬件配置第37页
     ·同源建模、计算及分析软件第37页
     ·常用数据库第37页
   ·实验方法第37-38页
     ·木聚糖酶一级结构的同源比对第37页
     ·同源建模第37页
     ·木聚糖酶空间结构比对第37-38页
     ·EvXyn11A 的分子动力学模拟第38页
     ·EvXyn11A 蛋白结构中 Glu 与拇指结构个分子的距离测定第38页
   ·结果与讨论第38-43页
     ·木聚糖酶一级结构的同源比对第38-39页
     ·木聚糖酶空间结构比对及距离测定第39-40页
     ·木聚糖酶 EvXyn11A 的分子动力学模拟第40-43页
第五章 拇指结构影响木聚糖酶 pH 特性的验证第43-52页
   ·引言第43页
   ·实验材料第43页
     ·菌种和试剂第43页
     ·主要仪器第43页
     ·培养基及主要溶液配制第43页
   ·实验方法第43-46页
     ·EvXyn11TS拇指区域基因序列的替换第43-46页
     ·pUCm-T- Evxyn11A 的构建第46页
     ·pPIC9K - Evxyn11A 的构建第46页
     ·转化毕赤酵母第46页
     ·毕赤酵母重组子的筛选和表达第46页
     ·表达产物的 SDS-PAGE 鉴定第46页
     ·重组酶的纯化第46页
     ·酶学性质测定第46页
   ·结果与讨论第46-52页
     ·EvXyn11TS拇指区域基因序列的替换第46-47页
     ·pUCm-T- Evxyn11A 和 pPIC9K - Evxyn11A 的构建的第47-48页
     ·酵母基因组的 PCR 验证第48页
     ·重组木聚糖酶的表达和纯化第48-49页
     ·酶学性质分析第49-52页
主要结论与展望第52-54页
 主要结论第52页
 存在的问题及展望第52-54页
致谢第54-55页
参考文献第55-61页
附录: 作者在攻读硕士学位期间发表的论文第61页

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