链码技术和聚类分析在基因序列中的应用
| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 目录 | 第7-9页 |
| 第一章 绪论 | 第9-13页 |
| ·课题背景与意义 | 第9-10页 |
| ·国内外研究动态 | 第10-12页 |
| ·DNA序列查找研究动态 | 第10-11页 |
| ·生物序列聚类技术研究动态 | 第11-12页 |
| ·论文研究内容及组织架构 | 第12-13页 |
| 第二章 相关技术简介 | 第13-24页 |
| ·链码技术 | 第13-16页 |
| ·Freeman链码 | 第13-15页 |
| ·基于Freeman链码的曲线匹配方法 | 第15页 |
| ·链码目标面积计算方法 | 第15-16页 |
| ·DNA序列的图形化表示 | 第16-19页 |
| ·2 -D图形表示 | 第16-18页 |
| ·3 -D及高维图形表示 | 第18-19页 |
| ·生物序列聚类分析 | 第19-23页 |
| ·特征提取及相似性度量 | 第19-21页 |
| ·DNA序列聚类方法 | 第21-22页 |
| ·蛋白质序列聚类方法 | 第22-23页 |
| ·本章小结 | 第23-24页 |
| 第三章 基于链码的DNA序列查找 | 第24-33页 |
| ·引言 | 第24页 |
| ·算法描述 | 第24-31页 |
| ·DNA序列的链码表示及图形化 | 第24-26页 |
| ·向量过滤器 | 第26页 |
| ·面积过滤器 | 第26-29页 |
| ·算法流程 | 第29-31页 |
| ·算法复杂度分析 | 第31-32页 |
| ·空间复杂度 | 第31页 |
| ·时间复杂度 | 第31页 |
| ·理论复杂度与其他方法比较 | 第31-32页 |
| ·本章小结 | 第32-33页 |
| 第四章 DNA序列聚类分析 | 第33-44页 |
| ·引言 | 第33页 |
| ·整体相似性聚类算法描述 | 第33-37页 |
| ·特征向量提取及相似性度量函数 | 第33-35页 |
| ·算法流程 | 第35-37页 |
| ·算法复杂度分析 | 第37页 |
| ·局部相似性聚类算法 | 第37-43页 |
| ·特征向量提取及相似性度量函数 | 第37-41页 |
| ·算法流程 | 第41-43页 |
| ·算法复杂度分析 | 第43页 |
| ·本章小结 | 第43-44页 |
| 第五章 实验结果与讨论 | 第44-58页 |
| ·实验环境 | 第44-45页 |
| ·算法的实现 | 第45-51页 |
| ·DNA查找算法 | 第45-46页 |
| ·整体相似性聚类算法 | 第46-49页 |
| ·局部相似性聚类算法 | 第49-51页 |
| ·实验结果 | 第51-57页 |
| ·DNA查找算法 | 第51-55页 |
| ·整体相似性聚类算法 | 第55-56页 |
| ·局部相似性聚类算法 | 第56-57页 |
| ·本章小结 | 第57-58页 |
| 结束语 | 第58-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 攻读硕士学位期间取得的研究成果 | 第64-65页 |
| 致谢 | 第65页 |
