蛋白质结构拓扑建模及其应用研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-19页 |
| ·课题背景 | 第12-15页 |
| ·课题内容 | 第15-16页 |
| ·研究意义 | 第16-18页 |
| ·本文的组织结构 | 第18-19页 |
| 第二章 蛋白质结构拓扑建模技术概述 | 第19-31页 |
| ·蛋白质结构相关知识描述 | 第19-22页 |
| ·基于折叠模式的蛋白质拓扑描述 | 第19-20页 |
| ·GPCR结构功能介绍 | 第20-21页 |
| ·GPCR的亲脂性 | 第21页 |
| ·跨膜螺旋(TMH)介绍 | 第21-22页 |
| ·蛋白质结构面向计算的描述 | 第22-26页 |
| ·蛋白质结构 | 第22-24页 |
| ·蛋白质结构在计算机中的表达 | 第24-26页 |
| ·蛋白质结构拓扑的建模现状 | 第26-27页 |
| ·基于折叠模式的建模方法 | 第26页 |
| ·跨膜螺旋结构拓扑建模方法 | 第26-27页 |
| ·常用的蛋白质相关数据库 | 第27-30页 |
| ·PDB | 第27-28页 |
| ·SCOP | 第28-29页 |
| ·GPCRDB | 第29页 |
| ·UniProt | 第29-30页 |
| ·本章小结 | 第30-31页 |
| 第三章 基于折叠模式识别的片段库生成及其应用 | 第31-39页 |
| ·问题描述 | 第31页 |
| ·构建片段库的重要性 | 第31-32页 |
| ·基于折叠模式的片段库构建方法的设计 | 第32-35页 |
| ·SCOP折叠模式识别 | 第32-33页 |
| ·片段库生成器 | 第33-35页 |
| ·实验验证结果 | 第35-38页 |
| ·片段库的三维结构相似性 | 第35页 |
| ·Rosetta中的难案例 | 第35-37页 |
| ·CASP9中的自由建模案例 | 第37-38页 |
| ·讨论 | 第38页 |
| ·本章小结 | 第38-39页 |
| 第四章 跨膜螺旋的拓扑建模及其应用 | 第39-50页 |
| ·问题描述 | 第39-41页 |
| ·综合多种约束的建模技术 | 第41-45页 |
| ·建模描述 | 第41页 |
| ·识别跨膜螺旋(TM)区域 | 第41-42页 |
| ·TM面向计算机的表达 | 第42-45页 |
| ·结果与分析 | 第45-49页 |
| ·TM维结构的预测结果 | 第45-46页 |
| ·优化同源建模的结果 | 第46-49页 |
| ·本章小结 | 第49-50页 |
| 第五章 总结与展望 | 第50-53页 |
| ·工作总结 | 第50-51页 |
| ·研究展望 | 第51-53页 |
| 参考文献 | 第53-60页 |
| 发表文章目录及科研项目 | 第60-61页 |
| 致谢 | 第61页 |
