| 摘要 | 第1-6页 |
| ABSTRACT | 第6-11页 |
| 第一章 概述 | 第11-21页 |
| ·生物信息学与生物数据库的概况 | 第11-13页 |
| ·生物信息学的定义及发展状况 | 第11页 |
| ·生物信息学的研究任务 | 第11-12页 |
| ·常见的生物数据库 | 第12-13页 |
| ·本文所分析的生物基因序列 | 第13-14页 |
| ·tRNA | 第13-14页 |
| ·HIV | 第14页 |
| ·生物序列中重复序列的概述 | 第14-16页 |
| ·重复序列 | 第14-15页 |
| ·回文序列 | 第15-16页 |
| ·CVTree方法的概述 | 第16-18页 |
| ·复杂网络的概述 | 第18-21页 |
| 第二章 利用CVTREE方法构建及分析TRNA序列的亲缘关系进化网络 | 第21-33页 |
| ·引言 | 第21-22页 |
| ·材料与方法 | 第22-23页 |
| ·tRNA序列来源及网络相关参数 | 第22页 |
| ·构建tRNA序列网络的方法 | 第22-23页 |
| ·本章结果与分析 | 第23-31页 |
| ·tRNA序列进化网络的拓扑结构图 | 第23-25页 |
| ·tRNA序列进化网络的度分布 | 第25-28页 |
| ·tRNA序列网络的平均聚类系数 | 第28-29页 |
| ·tRNA序列网络的平均最短路径 | 第29-31页 |
| ·本章小结 | 第31-33页 |
| 第三章 TRNA序列中重复序列的研究 | 第33-44页 |
| ·引语 | 第33-34页 |
| ·材料与方法 | 第34页 |
| ·tRNA序列的来源 | 第34页 |
| ·统计重复序列的方法 | 第34页 |
| ·本章结果与分析 | 第34-42页 |
| ·不同长度含量最多的重复序列 | 第34-38页 |
| ·重复序列出现power-law行为 | 第38-41页 |
| ·所有tRNA序列中缺失序列的统计 | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-44页 |
| 第四章 TRNA序列中回文序列的研究 | 第44-51页 |
| ·引言 | 第44-45页 |
| ·材料与方法 | 第45页 |
| ·tRNA来源 | 第45页 |
| ·统计回文序列的方法 | 第45页 |
| ·本章结果与分析 | 第45-49页 |
| ·tRNA序列中的回文序列出现power-law分布 | 第45-47页 |
| ·最长的回文序列与出现次数最多的回文序列 | 第47-48页 |
| ·100%AT/GC含量的回文序列 | 第48-49页 |
| ·本章小结 | 第49-51页 |
| 第五章 HIV全序列中重复序列的研究 | 第51-57页 |
| ·引语 | 第51-52页 |
| ·材料与方法 | 第52页 |
| ·HIV全序列的来源 | 第52页 |
| ·统计重复序列的方法 | 第52页 |
| ·本章结果与分析 | 第52-56页 |
| ·重复序列出现power-law行为 | 第52-53页 |
| ·不同长度含量最多的重复序列 | 第53-55页 |
| ·重复序列中AT/GC含量的分析 | 第55-56页 |
| ·本章小结 | 第56-57页 |
| 第六章 结论与展望 | 第57-60页 |
| ·本文工作总结 | 第57-58页 |
| ·展望 | 第58-60页 |
| 参考文献 | 第60-64页 |
| 致谢 | 第64-65页 |
| 攻读硕士学位期间完成的论文 | 第65页 |