| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 目录 | 第9-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-33页 |
| ·引言 | 第11-13页 |
| ·木质素研究的概述 | 第13-18页 |
| ·木质素的基本结构单元 | 第13-15页 |
| ·木质素的基本物理化学性质 | 第15-16页 |
| ·木质素的工业利用 | 第16-17页 |
| ·作为高分子产物的利用 | 第16页 |
| ·作为低分子产物的利用 | 第16-17页 |
| ·木质素的研究进展 | 第17-18页 |
| ·核酸的概述 | 第18-28页 |
| ·DNA | 第20-24页 |
| ·DNA一级结构 | 第20-21页 |
| ·DNA二级结构-双螺旋结构模型 | 第21-23页 |
| ·DNA三级结构 | 第23-24页 |
| ·RNA | 第24-27页 |
| ·tRNA介绍 | 第25-26页 |
| ·mRNA介绍 | 第26页 |
| ·rRNA介绍 | 第26-27页 |
| ·核酶的介绍 | 第27-28页 |
| ·论文结构和主要研究成果 | 第28-29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| ·本章参考文献 | 第30-33页 |
| 第二章 计算方法及其应用 | 第33-62页 |
| ·引言 | 第33-34页 |
| ·量子化学基本原理 | 第34-39页 |
| ·Hartree-Fock理论 | 第34-37页 |
| ·基函数 | 第37-39页 |
| ·化学精度计算办法 | 第39-46页 |
| ·多体微扰理论 | 第40-41页 |
| ·组态相互作用 | 第41-42页 |
| ·耦合簇理论 | 第42-44页 |
| ·密度泛函理论 | 第44-46页 |
| ·分子动力学方法 | 第46-47页 |
| ·量子力学与分子力学联用的方法(QMMM) | 第47-56页 |
| ·基本原理 | 第48-53页 |
| ·实现过程 | 第53-56页 |
| ·pKa | 第56页 |
| ·NAC理论 | 第56页 |
| ·键解离能 | 第56-58页 |
| ·本章小结 | 第58页 |
| ·本章参考文献 | 第58-62页 |
| 第三章 木质素单体的研究 | 第62-78页 |
| ·木质素单体构型简介 | 第63-64页 |
| ·计算方法 | 第64-65页 |
| ·结果和讨论 | 第65-76页 |
| ·结构 | 第65-68页 |
| ·键离解能 | 第68-70页 |
| ·气态(绝热)电离能 | 第70-71页 |
| ·水溶液中的氧化电动势(E_(?)) | 第71-73页 |
| ·氧化电动势与键离解能以及氧化电动势与电离能之间的关系 | 第73-75页 |
| ·对木质素生物合成过程的思考 | 第75-76页 |
| ·本章小结 | 第76-77页 |
| ·本章参考文献 | 第77-78页 |
| 第四章 HDV核酶自切除反应机理的理论研究 | 第78-112页 |
| ·HDV核酶的简介 | 第79-84页 |
| ·计算过程 | 第84-89页 |
| ·HDV核酶分子体系的预处理 | 第84-86页 |
| ·量子力学计算过程 | 第86页 |
| ·NAC计算过程 | 第86-88页 |
| ·pK_(?)计算过程 | 第88-89页 |
| ·结果与讨论 | 第89-108页 |
| ·机理1(C75-base机理) | 第89-97页 |
| ·反应物结构 | 第89-91页 |
| ·TS1的结构 | 第91-92页 |
| ·五配位的中间体 | 第92-94页 |
| ·TS2的结构 | 第94-95页 |
| ·自切除反应的产物结构 | 第95-97页 |
| ·机理2(C75-acid机理) | 第97-105页 |
| ·反应物结构 | 第97-100页 |
| ·TS1的结构 | 第100-101页 |
| ·五配位的中间体结构 | 第101-102页 |
| ·TS2的结构 | 第102-103页 |
| ·自切除反应产物的结构 | 第103-105页 |
| ·机理1vs机理2 | 第105-108页 |
| ·pK_a的计算结果 | 第106页 |
| ·NAC的计算结果 | 第106页 |
| ·反应路径的搜索 | 第106-108页 |
| ·绝对反应速率 | 第108页 |
| ·本章参考文献 | 第108-112页 |
| 攻读博士期间发表的论文 | 第112-113页 |
| 致谢 | 第113页 |