| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-12页 |
| 第一章 引言 | 第12-16页 |
| ·高性能计算化学系统研究 | 第12-14页 |
| ·高性能计算化学系统研究与建设的必要性 | 第12-13页 |
| ·高性能计算化学系统国内外研究现状分析 | 第13-14页 |
| ·本论文选题意义及目标 | 第14-15页 |
| ·论文结构 | 第15-16页 |
| 第二章 GridMol软件系统结构 | 第16-22页 |
| ·GridMol系统设计 | 第16-17页 |
| ·GridMol功能需求 | 第16页 |
| ·系统结构设计 | 第16-17页 |
| ·GridMol程序设计 | 第17-21页 |
| ·小结 | 第21-22页 |
| 第三章 GridMol分子可视化功能设计及实现 | 第22-40页 |
| ·分子可视化软件介绍 | 第22-23页 |
| ·Java3D与其它3D技术的比较 | 第23-24页 |
| ·GridMol可视化功能设计和实现 | 第24-32页 |
| ·分子文件读取 | 第24-25页 |
| ·分子显示模式 | 第25-27页 |
| ·大分子二级结构确定 | 第27-32页 |
| ·软件实现效果测试 | 第32-40页 |
| ·GridMol分子可视化功能测试 | 第32-34页 |
| ·程序实现 | 第34-40页 |
| 第四章 GridMol分子建模功能设计及实现 | 第40-54页 |
| ·建模功能设计 | 第40-44页 |
| ·基团设计 | 第40-42页 |
| ·面角修改算法 | 第42-44页 |
| ·分子结构优化 | 第44-49页 |
| ·全局优化算法简介 | 第45-46页 |
| ·遗传优化算法 | 第46-47页 |
| ·分子结构优化问题描述 | 第47-48页 |
| ·GridMol中分子力场 | 第48页 |
| ·遗传算法实现分子结构优化 | 第48-49页 |
| ·分子建模模块程序设计与实现 | 第49-54页 |
| ·主要程序设计 | 第49-50页 |
| ·实现结果 | 第50-54页 |
| 第五章 GridMol在中国国家网格上的部署及应用 | 第54-62页 |
| ·中国国家网格CNGrid简介 | 第54页 |
| ·GridMol与网格的交互 | 第54-57页 |
| ·作业提交描述语言 | 第55-56页 |
| ·Gaussian作业提交参数 | 第56页 |
| ·程序设计 | 第56-57页 |
| ·应用实例 | 第57-58页 |
| ·GridMol实现整体效果 | 第58-62页 |
| 第六章 工作总结与展望 | 第62-64页 |
| ·完成工作 | 第62-63页 |
| ·下一步工作 | 第63-64页 |
| 参考文献 | 第64-68页 |
| 发表文章目录 | 第68-69页 |
| 简历 | 第69-71页 |
| 致谢 | 第71-72页 |