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一株海洋细菌的初步鉴定和相关功能基因(簇)的克隆

摘要第1-8页
Abstract第8-10页
前言第10-29页
 1 海洋单胞菌简介第10-14页
   ·海洋单胞菌属的分类地位第10页
   ·海洋单胞菌生态分布第10-11页
   ·新酶和功能蛋白质的研究第11-14页
 2 黑色素的研究现状第14-22页
   ·黑色素的分类第14-16页
   ·黑色素的共性特征第16-17页
   ·黑色素生物合成途径中的关键酶第17-18页
   ·黑色素在细胞中的定位第18页
   ·黑色素在细菌中扮演的角色第18-20页
     ·黑色素在异化细菌中作为电子受体第18-19页
     ·黑色素在细菌介导的大气氮的固定中的作用第19页
     ·黑色素在病原细菌中作为毒力因子第19-20页
   ·细菌黑色素的分子遗传第20-21页
   ·黑色素的应用领域第21-22页
     ·黑色素在工业上的应用第21页
     ·黑色素在农业上的应用第21-22页
     ·黑色素在食品业上的应用第22页
     ·黑色素在医药上的应用第22页
     ·黑色素在环境保护上的应用第22页
 3 转座子插入突变第22-27页
   ·转座子的插入机制和随机诱变作用第23-25页
   ·利用转座子插入诱变分离目的基因第25页
   ·转座子插入位点旁侧序列分析的常用方法第25-27页
   ·转座子插入突变在微生物功能基因组学中的应用第27页
 4 展望第27-29页
本研究目的和意义第29-30页
2 材料与方法第30-48页
   ·材料第30-37页
     ·菌株与质粒第30页
     ·培养基与培养条件第30-33页
     ·常用溶液、缓冲液配制第33-36页
     ·工具酶、试剂盒及引物合成第36页
     ·仪器第36-37页
   ·方法第37-44页
     ·菌株的初步鉴定第37-40页
     ·黑色素生物合成相关基因(簇)的克隆及序列分析第40-44页
   ·海洋单胞菌MWYL1丧失硝酸盐利用突变株的筛选第44-48页
     ·MWYL1自发突变株的筛选第44页
     ·转座子插入突变库的建立及丧失硝酸盐利用突变株的筛选第44-45页
     ·Mini-Tn5转座子插入到MWYL1基因组中验证第45-46页
     ·转座子插入位点的定位分析第46-47页
     ·测序结果序列分析第47-48页
3 结果与分析第48-72页
   ·细菌的初步鉴定结果第48-56页
     ·菌落形态观察及革兰氏染色第48-49页
     ·生理生化实验第49-50页
     ·盐耐受试验第50页
     ·菌株MWYL1生长的pH值范围第50页
     ·抗生素敏感性实验结果第50-51页
     ·PCR扩增结果第51页
     ·16S rRNA基因序列的BLAST分析第51-52页
     ·系统发育分析第52-55页
     ·小结第55-56页
   ·黑色素生物合成基因簇的分离及生物信息学初步分析第56-68页
     ·菌株MWYL1的基因组DNA纯度及酶切第56页
     ·基因组文库构建质量检测与文库保存第56页
     ·产生黑色素克隆的发现及亚克隆第56-58页
     ·序列分析第58-64页
     ·推测主要基因编码蛋白的预测及分析第64-67页
     ·推定基因在相关黑色素合成中的功能第67-68页
   ·海洋单胞菌MWYL1丧失硝酸盐突变株的筛选第68-72页
     ·海洋单胞菌MWYL1自发突变株的筛选第68页
     ·不能利用硝酸盐突变株的筛选第68-69页
     ·突变株中mini-Tn5转座子插入基因组的检测第69页
     ·不能利用硝酸盐突变株转座子插入位点分析第69-71页
     ·小结与讨论第71-72页
4 讨论第72-74页
5 进一步研究设想第74-75页
参考文献第75-82页
致谢第82-83页
附录第83-90页

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