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耐辐射球菌基因组的生物信息学研究

摘要第1-4页
Abstract第4-7页
第一章 引言第7-15页
   ·耐辐射球菌简介第7-8页
     ·耐辐射球菌的分离及分类第7-8页
   ·耐辐射球菌的基本特性第8-10页
     ·耐辐射球菌的细胞结构第8-9页
     ·耐辐射球菌的生理、生化和遗传特性第9-10页
   ·耐辐射球菌的酶学研究第10页
   ·耐辐射球菌的自我保护和DNA 损伤修复第10-13页
     ·耐辐射球菌的自我保护第10-11页
     ·耐辐射球菌的DNA 损伤修复第11页
     ·切除修复第11-12页
     ·重组修复第12-13页
     ·SOS 修复第13页
   ·耐辐射球菌研究及其新进展第13-15页
第二章 生物信息学在基因组分析中的应用第15-23页
   ·生物信息学的产生与发展第15-17页
     ·生物数据库的建立第15页
     ·基因组测序与核酸序列数据库第15-16页
     ·蛋白质测序与氨基酸序列数据库、蛋白质结构数据库第16-17页
   ·生物信息学基本方法第17-19页
     ·生物序列分析第17页
     ·序列比对简介第17-18页
     ·DNA 序列分析第18页
     ·蛋白质三维结构分析第18-19页
   ·生物信息学的应用第19页
     ·基因组分析第19页
     ·基因芯片第19页
   ·耐辐射球菌的生物信息学研究第19-21页
   ·课题的提出及其意义第21-23页
第三章 耐辐射球菌的基因组研究第23-31页
   ·耐辐射球菌基因组氨基酸水平的研究第23-26页
     ·氨基酸序列数据来源第23-24页
     ·氨基酸含量的数据处理与结果分析第24-26页
   ·蛋白质二级结构研究第26-29页
     ·蛋白质结构的数据来源第27页
     ·蛋白质二级结构含量分析及结果第27-29页
   ·蛋白质高级结构的基因组分析第29-30页
     ·蛋白质结构的预处理第29-30页
     ·数据处理结果及分析第30页
   ·总结第30-31页
第四章 耐辐射球菌及其它四种抗辐射菌的基因表达分析第31-43页
   ·研究方法第32-33页
     ·基因群之间密码子使用差异的计算第32-33页
     ·基因表达的度量指标第33页
     ·高表达基因的判定第33页
   ·抗辐射菌中PHX 基因的统计分析第33-41页
     ·RP、TF 和CH 的高表达基因分析第36-37页
     ·能量代谢途径中的高表达基因分析第37页
     ·核苷酸代谢和DNA 修复基因的高表达分析第37-40页
     ·细胞表面结构和ABC 通道蛋白的高表达基因分析第40-41页
   ·结果讨论第41-43页
第五章 总结第43-45页
参考文献第45-51页
硕士期间参与的科研课题以及发表的文章第51-52页
致谢第52页

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