| 摘要 | 第1-5页 |
| Summary | 第5-6页 |
| 目录 | 第6-8页 |
| 第一部分 文献综述 | 第8-20页 |
| 1．中国家禽遗传资源概况 | 第8-11页 |
| ·中国地方鸡种分布及肉禽业发展 | 第8-9页 |
| ·家鸡与原鸡亲缘关系 | 第9-10页 |
| ·部分鸡品种介绍 | 第10-11页 |
| ·丝羽乌骨鸡 | 第10-11页 |
| ·德化黑鸡 | 第11页 |
| 2．鸡 MHC 概述 | 第11-15页 |
| ·MHC 的概述 | 第11页 |
| ·鸡 MHC 提出 | 第11-12页 |
| ·鸡 MHC 结构发展过程 | 第12-13页 |
| ·鸡 MHC I 类、II 类和 IV 类基因 | 第13-15页 |
| ·鸡 MHC I 类基因 | 第13-14页 |
| ·鸡 MHC II 类基因 | 第14页 |
| ·鸡 MHC IV 类基因 | 第14-15页 |
| ·鸡 MHC Y 区基因 | 第15页 |
| 3．鸡 MHC B 单倍型及其与鸡传染性疾病的关系 | 第15-18页 |
| ·B 单倍型命名 | 第15-16页 |
| ·B 单倍型与传染性疾病之间的关系 | 第16-18页 |
| ·B 单倍型与马立克氏病的关系 | 第17页 |
| ·B 单倍型与禽白血病（AL）等疾病的关系 | 第17-18页 |
| 4．鸡 MHC-BF 基因研究进展 | 第18-19页 |
| ·BF1 和 BF2 基因扩增方法研究 | 第18-19页 |
| ·鸡 MHC-BF 单倍型研究 | 第19页 |
| 5．本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 第二部分 材料与方法 | 第20-29页 |
| 1．实验材料 | 第20-22页 |
| ·样品来源 | 第20页 |
| ·主要试剂 | 第20-21页 |
| ·仪器设备 | 第21页 |
| ·溶液配制 | 第21-22页 |
| 2．实验方法 | 第22-29页 |
| ·血液 DNA 提取 | 第22-23页 |
| ·DNA 浓度浓度和质量检测 | 第23页 |
| ·PCR 引物设计及扩增 | 第23-25页 |
| ·鸡 MHC-BF 基因相似区域确定 | 第23-24页 |
| ·BF1 基因全长扩增 | 第24页 |
| ·BF2 基因全长扩增 | 第24-25页 |
| ·未知序列 Gap 区补充引物 | 第25页 |
| ·PCR 反应体系 | 第25页 |
| ·鸡 MHC-BF 基因测序引物 | 第25-26页 |
| ·克隆操作过程 | 第26-28页 |
| ·PCR 产物纯化步骤 | 第26-27页 |
| ·连接和转化步骤 | 第27-28页 |
| ·数据分析 | 第28-29页 |
| 第三部分 结果与分析 | 第29-50页 |
| 1．DNA 提取结果 | 第29页 |
| 2．BF1 基因全长扩增 | 第29-33页 |
| ·BF1 基因缺失筛选 | 第29-30页 |
| ·群体内基因型和基因型频率统计 | 第30-33页 |
| 3．BF2 基因全长扩增 | 第33页 |
| 4．鸡 MHC-BF 基因新单倍型确定 | 第33-36页 |
| 5．鸡 MHC-BF 基因 5’UTR 和 3’UTR 序列分析 | 第36-37页 |
| 6．BF1 基因多态性分析 | 第37-42页 |
| ·缺失 BF1 基因序列分析—B 基因 | 第37-38页 |
| ·正常 BF1 基因序列分析—A 和 Adel基因 | 第38-41页 |
| ·BF1 基因编码区多态性分析 | 第38-39页 |
| ·BF1 基因高变区多态性分析 | 第39-40页 |
| ·BF1 基因高变区聚类分析 | 第40-41页 |
| ·BF1 基因聚类分析 | 第41-42页 |
| 7. BF2 基因多态性分析 | 第42-46页 |
| ·BF2 基因编码区多态性分析 | 第42-43页 |
| ·BF2 基因高变区多态性分析 | 第43-45页 |
| ·BF2 基因高变区遗传聚类分析 | 第44-45页 |
| ·BF2 基因聚类分析 | 第45-46页 |
| 8．BF1 和 BF2 遗传聚类分析 | 第46-47页 |
| 9. BF1 和 BF2 基因内特殊结构统计 | 第47-50页 |
| ·BF1 和 BF2 基因内插入缺失 | 第47-48页 |
| ·BF1 和 BF2 Poly G 确定 | 第48-49页 |
| ·BF1 和 BF2 基因 3’UTR 中 Gap 区补充 | 第49-50页 |
| ·BF1-B19 Gap 区补充 | 第49页 |
| ·BF2-B19 和 BF2-B24 Gap 区补充 | 第49-50页 |
| 第四部分 讨论 | 第50-53页 |
| 1. BF2-B24 序列不一致性讨论 | 第50页 |
| 2. BF1 和 BF2 基因测序方法的经济性 | 第50页 |
| 3. BF1 缺失现象真实性 | 第50-51页 |
| 4. 鸡 MHC-BF 基因扩增方法 | 第51页 |
| 5. 影响 BF1 基因低表达的原因 | 第51-52页 |
| 6. BF 基因高变内含子出现和保守序列一致性 | 第52-53页 |
| 第五部分 结论 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-62页 |
| 附录 | 第62-72页 |
| 致谢 | 第72-73页 |
| 作者简介 | 第73-74页 |
| 导师简介 | 第74-76页 |
