基因芯片分子标记物研究及其在乳腺癌数据中的应用
| 摘要 | 第1-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 引言 | 第9-10页 |
| 第二章 原理与文献综述 | 第10-38页 |
| 第一节 基因芯片技术与芯片数据分析 | 第10-25页 |
| ·基因芯片技术平台概述 | 第10-13页 |
| ·基因芯片数据与分析理论 | 第13-18页 |
| ·基因芯片数据分析 | 第18-23页 |
| ·差异基因筛选 | 第18-21页 |
| ·聚类分析与可视化 | 第21-23页 |
| ·MIA施标准与芯片数据存储 | 第23-25页 |
| 第二节 乳腺癌的临床病理与分子机制研究 | 第25-30页 |
| ·乳腺癌概述 | 第25-27页 |
| ·乳腺癌分子机制研究与分子分型 | 第27-28页 |
| ·乳腺癌基因芯片研究与分子标记物 | 第28-30页 |
| 第三节 基因芯片分子标记物研究 | 第30-38页 |
| ·生物标记物研究 | 第31-32页 |
| ·生物标记物性能评价 | 第32-33页 |
| ·基因芯片分子标记物研究中的分类方法 | 第33-35页 |
| ·基因芯片分子标记物研究准则 | 第35-36页 |
| ·元分析整合芯片数据的分子标记物 | 第36-38页 |
| 第三章 实验研究 | 第38-71页 |
| 第一节 乳腺癌预测分类器的构建 | 第38-63页 |
| ·MAQC项目简介 | 第38-39页 |
| ·采用机器学习方法寻找乳腺癌标记物 | 第39-59页 |
| ·实验数据 | 第39-40页 |
| ·乳腺癌芯片基因标记物分析 | 第40-59页 |
| ·芯片质量控制 | 第42-49页 |
| ·芯片数据预处理 | 第49-50页 |
| ·基因挑选策略 | 第50-55页 |
| ·构建分类器 | 第55-58页 |
| ·在测试数据上验证分类器 | 第58-59页 |
| ·基因标记物分析 | 第59-62页 |
| ·基因标记物功能分析 | 第59-60页 |
| ·基因标记物通路分析 | 第60-62页 |
| ·平衡训练集分析 | 第62-63页 |
| 第二节 对基因标记物依据表达谱相关性的图连通分析 | 第63-68页 |
| ·问题的提出和思路 | 第63-64页 |
| ·算法描述及应用 | 第64-66页 |
| ·实验数据展示 | 第66-68页 |
| ·基因标记间的比较 | 第66-67页 |
| ·基因标记去冗余研究 | 第67-68页 |
| 第三节 小结 | 第68-71页 |
| 参考文章 | 第71-77页 |
| 发表文章 | 第77-78页 |
| 致谢 | 第78页 |
