中文摘要 | 第1-10页 |
英文摘要 | 第10-13页 |
第一章 前言 | 第13-19页 |
·血肽图技术国内外研究现状 | 第14-16页 |
·现有的生物信息学工具 | 第16-17页 |
·小结 | 第17-19页 |
第二章 血清多肽组谱图数据库的构建 | 第19-24页 |
·血清多肽组谱图数据 | 第19页 |
·数据库管理系统MySQL | 第19-20页 |
·数据库设计工具DB Designer 4 | 第20-21页 |
·血肽图数据库设计 | 第21-23页 |
·结果与讨论 | 第23-24页 |
第三章 血清多肽组谱图管理分析系统BioSunMS 的构建 | 第24-36页 |
·BioSunMS 的需求分析 | 第24页 |
·BioSunMS 的设计与实现 | 第24-35页 |
·BioSunMS 的设计 | 第24-31页 |
·BioSunMS 的工作流程 | 第31-33页 |
·BioSunMS 的Plug-in 机制 | 第33页 |
·BioSunMS 的质谱数据读取和预处理 | 第33-34页 |
·BioSunMS 基于R 语言的统计分析环境 | 第34-35页 |
·结果与讨论 | 第35-36页 |
第四章 应用BioSunMS 对肺癌血肽图样本进行分型与分类研究 | 第36-52页 |
·概述 | 第36-37页 |
·方法与数据 | 第37-38页 |
·样品收集 | 第37页 |
·血清多肽提取 | 第37-38页 |
·质谱检测 | 第38页 |
·患者数据录入和质谱数据导入 | 第38页 |
·数据准备 | 第38页 |
·BioSunMS 的应用 | 第38-42页 |
·特征峰提取与对齐 | 第38页 |
·变量选择 | 第38-39页 |
·构建模型 | 第39-40页 |
·模型评价 | 第40-41页 |
·聚类分析 | 第41-42页 |
·结果与讨论 | 第42-52页 |
·样本临床信息 | 第42-43页 |
·变量选择 | 第43-46页 |
·肺癌血肽图早期诊断模型构建 | 第46-49页 |
·聚类分析 | 第49-52页 |
第五章 结论 | 第52-53页 |
参考文献 | 第53-60页 |
附录 | 第60-71页 |
文献综述 | 第71-81页 |
血清多肽组谱图的生物信息学 | 第71-81页 |
1 质谱数据的获取和预处理 | 第73-75页 |
2 聚类分析 | 第75-76页 |
3 分类研究 | 第76-77页 |
4 展望 | 第77-78页 |
5 参考文献 | 第78-81页 |
发表论文 | 第81-90页 |
个人简历 | 第90-91页 |
致谢 | 第91页 |