| 摘要 | 第1-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 第1章 绪论 | 第8-15页 |
| ·课题背景及研究的目的和意义 | 第8-9页 |
| ·国内外研究现状 | 第9-14页 |
| ·生物信息学数据库的发展 | 第9-10页 |
| ·NAR分子生物学数据库索引 | 第10-11页 |
| ·本体论的基本概念 | 第11-13页 |
| ·生物医学本体 | 第13-14页 |
| ·本文的主要研究内容 | 第14-15页 |
| 第2章 生物信息数据库集成模型 | 第15-23页 |
| ·生物信息数据库特征分析 | 第15-18页 |
| ·miR2Disease数据库 | 第15-16页 |
| ·miR2Disease数据库的特征分析 | 第16-17页 |
| ·生物信息数据库的一般特征 | 第17-18页 |
| ·基于多数据库的一般生物信息学研究过程 | 第18-19页 |
| ·生物信息数据库集成系统的双层网络模型 | 第19-20页 |
| ·数据采集策略 | 第20-22页 |
| ·本章小结 | 第22-23页 |
| 第3章 基于生物医学本体的生物学概念网络 | 第23-30页 |
| ·本文的参考生物医学本体 | 第23-24页 |
| ·生物学概念网络的概念节点 | 第24-25页 |
| ·生物信息数据库相关概念的基本情况 | 第24页 |
| ·概念定义的一些问题 | 第24-25页 |
| ·生物学概念网络的概念关系 | 第25-29页 |
| ·概念关系的分类 | 第25页 |
| ·is_a关系 | 第25-27页 |
| ·part_of关系 | 第27-28页 |
| ·生物学关系 | 第28页 |
| ·疾病相关关系 | 第28-29页 |
| ·生物医学本体概念关系的代数性质 | 第29页 |
| ·本章小结 | 第29-30页 |
| 第4章 生物信息数据库网络的构建 | 第30-38页 |
| ·构建生物信息数据库网络的基本思想 | 第30-32页 |
| ·建立生物信息数据库网络的过程 | 第30页 |
| ·生物信息数据库网络的关系规则 | 第30-31页 |
| ·数据库相关概念的关联形式 | 第31-32页 |
| ·数据库网络关系权值算法 | 第32-36页 |
| ·基本加权算法 | 第32-34页 |
| ·基本加权算法的改进 | 第34-36页 |
| ·生物信息数据库的内容关系 | 第36-37页 |
| ·本章小结 | 第37-38页 |
| 第5章 基于生物医学本体的生物信息数据库集成系统平台实现 | 第38-45页 |
| ·总体设计 | 第38页 |
| ·生物学概念网络工具 | 第38-40页 |
| ·概念信息 | 第38-39页 |
| ·概念-数据库关系分析工具 | 第39-40页 |
| ·数据库网络工具 | 第40-42页 |
| ·数据库详细信息 | 第40-41页 |
| ·数据库-数据库关系分析工具 | 第41-42页 |
| ·本体工具 | 第42-43页 |
| ·Bio-DB^2 后台结构 | 第43-44页 |
| ·本章小结 | 第44-45页 |
| 结论 | 第45-47页 |
| 参考文献 | 第47-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第53-55页 |
| 致谢 | 第55页 |