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秦川牛PACAP基因多态性及其与部分生长性状的关联研究

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
引言第11-12页
第一章 文献综述第12-32页
   ·秦川牛的选育概况第12-15页
     ·现今肉牛业的发展现状第12页
     ·黄牛在动物学上的地位第12页
     ·秦川牛(Qinchuan cattle)简介第12-13页
     ·秦川牛的选育进展第13-15页
   ·主要的遗传标记介绍第15-21页
     ·形态学标记第15页
     ·细胞遗传标记第15-16页
     ·生化遗传标记第16页
     ·免疫学标记第16页
     ·DNA 分子遗传标记第16-21页
   ·分子标记在牛研究中的应用第21-26页
     ·主效基因第21-23页
     ·数量性状位点第23-25页
     ·标记辅助选择第25-26页
   ·侯选基因PACAP 基因的研究现状第26-31页
     ·PACAP 基因第26页
     ·PACAP 分子结构与进化第26-28页
     ·PACAP 的组织分布第28-29页
     ·PACAP 的作用机理第29页
     ·PACAP 的结构与功能的关系第29页
     ·PACAP 生物功能第29-31页
     ·PACAP 的研究展望第31页
   ·本研究的目的意义第31-32页
第二章 材料与方法第32-43页
   ·实验材料第32-34页
     ·实验动物及其血样采集,相关指标测定第32页
     ·主要仪器设备第32页
     ·主要试剂与药品第32-33页
     ·溶液与缓冲液第33-34页
   ·试验方法第34-41页
     ·血液基因组DNA 的提取,检测以及DNA 池的构建第34-37页
     ·PCR 扩增体系第37-38页
     ·PCR-SSCP 分析第38-39页
     ·产物的纯化、克隆鉴定和测序第39-41页
   ·资料的统计与分析第41-43页
     ·基因频率和基因型频率的计算第41页
     ·基因频率和基因型频率的差异显著性检验第41-42页
     ·位点遗传纯合度(Ho)、杂合度(He)和有效等位基因数(Ne)第42页
     ·多态信息含量第42页
     ·统计分析模型第42-43页
第三章 结果与分析第43-55页
   ·血液基因组DNA 的电泳检测第43页
   ·PACAP 基因5'端调控序列的遗传变异及其对生长性状的影响第43-46页
     ·5'UTR 的SNP 检测第43-44页
     ·PACAP 基因T-465G 突变位点的PCR 产物检测第44页
     ·PACAP 基因T-465G 突变位点的PCR-SSCP 分析第44页
     ·PACAP 基因T-465G 突变位点的遗传多态性指标第44-45页
     ·PACAP 基因T-465G 突变位点对生长性状的影响第45-46页
   ·PACAP 基因第一外显子的遗传变异及其对生长性状的影响第46-48页
     ·PCR 产物检测第46页
     ·SSCP 分析第46-47页
     ·不同基因型序列测定及蛋白变异第47页
     ·PACAP 基因T87C 突变位点的遗传多态性指标第47-48页
     ·PACAP 基因T87C 突变位点对生长性状影响第48页
   ·PACAP 基因第二外显子的遗传变异及其对生长性状的影响第48-49页
     ·PCR 产物检测第48-49页
     ·SSCP 分析第49页
   ·PACAP 基因第三外显子的遗传变异及其对生长性状的影响第49-52页
     ·PCR 产物检测第49页
     ·SSCP 分析第49页
     ·杂合子序列测定第49-50页
     ·PACAP 基因T2805C 突变位点的遗传多态性指标第50-51页
     ·PACAP 基因T2805C 突变位点对生长性状的影响第51-52页
   ·PACAP 基因第 3 内含子的遗传变异及其对生长性状的影响第52-55页
     ·PCR 产物检测第52页
     ·SSCP 分析第52页
     ·不同基因型序列测定第52-53页
     ·PACAP 基因G3909A 突变位点的遗传多态性指标第53页
     ·PACAP 基因G3909A 突变位点对生长性状的影响第53-55页
第四章 讨论第55-61页
   ·高质量DNA 提取的改进第55页
   ·PCR 的优化第55-56页
     ·模板的质量第55页
     ·退火温度的确定第55-56页
     ·引物的设计第56页
   ·SSCP 的优化第56-58页
     ·扩增片段长度第56页
     ·PCR 产物的浓度及上样量第56页
     ·凝胶的浓度第56-57页
     ·电泳的条件第57页
     ·DNA 染色方法的改进第57-58页
   ·PCR 产物的纯化测序第58页
   ·测序峰图的判读第58页
   ·PACAP 基因的遗传变异分析第58-59页
   ·PACAP 基因多态位点对生长性状的影响分析第59-60页
   ·本研究存在问题以及后续研究方向第60-61页
第五章 结论第61-62页
参考文献第62-68页
致谢第68-69页
作者简介第69页

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