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拟南芥ALP1互作基因的筛选

摘要第1-8页
Abstract第8-9页
第一部分 综述第9-20页
 1 拟南芥的优势及研究策略第9-11页
   ·模式植物拟南芥第9-10页
   ·拟南芥分子生物学研究策略第10-11页
 2 J 蛋白的研究与进展第11-14页
   ·分子伴侣——热休克蛋白第11-12页
   ·J 蛋白的结构与功能第12-13页
   ·拟南芥中J 蛋白的研究第13-14页
 3 生物信息学方法研究蛋白的相互作用第14-16页
   ·生物信息学的网络资源第14-15页
   ·蛋白互作生物信息学的计算方法概述第15-16页
 4 基于酵母双杂交系统(yeast two-hybrid system)的蛋白互作研究第16-20页
   ·酵母双杂交系统的原理与应用第16-18页
   ·酵母双杂交系统的局限和进展第18-20页
第二部分 实验材料与方法第20-35页
 1 材料第20-22页
   ·植物材料第20页
   ·菌株与载体第20页
   ·各种酶及试剂第20-21页
   ·培养基第21-22页
 2 实验方法与步骤第22-35页
   ·拟南芥的培养第22页
   ·基因引物设计第22页
   ·TriZol 一步法提取拟南芥总RNA第22-23页
   ·半定量 RT-PCR 方法第23-24页
   ·大肠杆菌感受态细胞的制备第24页
   ·PCR 产物的连接第24-25页
   ·连接反应物对宿主感受态细胞的转化第25页
   ·重组克隆的PCR 鉴定第25页
   ·大肠杆菌质粒的提取第25-26页
   ·质粒的酶切鉴定第26页
   ·酶切质粒的连接第26-27页
   ·酵母质粒的小量转化第27页
   ·酵母质粒的提取第27页
   ·诱饵蛋白自激活实验第27-28页
   ·酵母蛋白的提取第28页
   ·SDS-PAGE 电泳第28-29页
   ·Western bloting第29-30页
   ·cDNA 文库的构建第30-32页
   ·使用CHROMA SPIN? TE-400 Column 纯化ds cDNA第32页
   ·酵母感受态的制备第32-33页
   ·酵母文库质粒的大量转化(pGADT7)第33页
   ·转化子的收获第33-34页
   ·接合杂交第34-35页
第三部分 结果与分析第35-50页
 1 数据库分析预测ALP1 互作基因第35-37页
 2 pGBKT7-ALP1 载体的构建和检测第37-40页
   ·目的片段的获得及重组质粒酶切鉴定第37-38页
   ·重组诱饵质粒pGBKT7-ALP1 的毒性与自激活检测第38-39页
   ·SDS-PAGE 和Western blotting 验证AH109/pGBKT7-ALP1 蛋白的表达第39-40页
 3 pGADT7-X 载体的构建第40-44页
 4 pGBKT7- ALP1 与pGADT7-X 共转酵母AH109 检测蛋白互作第44-45页
 5 拟南芥cDNA 文库的构建第45-48页
   ·拟南芥RNA 的提取与检测第45页
   ·ds cDNA 的合成第45-46页
   ·文库的构建及鉴定第46-48页
     ·文库的转化效率第46-47页
     ·文库的保存及滴度的测定第47页
     ·文库多态性及重组比的鉴定第47-48页
 6 酵母Y187(pGADT7-library)与AH109(pGBKT7-ALP1) 菌株表达验证第48-50页
第四部分 小结与讨论第50-53页
下一步工作第53-54页
参考文献第54-58页
附录1 本研究中所用的引物第58-59页
附录2 主要试剂与缓冲液的配制第59-61页
致谢第61页

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