| 摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-10页 |
| 第1章 绪论 | 第10-14页 |
| ·国内外研究进展 | 第10-11页 |
| ·系统生物学代谢网络的研究方案 | 第11页 |
| ·生化系统理论的研究及优化方法 | 第11-12页 |
| ·系统生物学的建模和仿真软件 | 第12页 |
| ·研究的目的和意义 | 第12-14页 |
| 第2章 乳酸链球菌发酵的系统计算 | 第14-21页 |
| ·引言 | 第14页 |
| ·反应方程及其标准化 | 第14-16页 |
| ·乳酸链球菌代谢过程 | 第14-15页 |
| ·标准化及其自动生成 | 第15-16页 |
| ·参数确定及方程求解 | 第16-18页 |
| ·参数确定 | 第16-17页 |
| ·结果模拟 | 第17-18页 |
| ·讨论 | 第18-21页 |
| 第3章 模型与数据的同化研究 | 第21-33页 |
| ·引言 | 第21页 |
| ·实验与模型的不匹配 | 第21-22页 |
| ·模型研究一次性反应与实际代谢连续回补过程 | 第22-25页 |
| ·一次性反应过程 | 第22-23页 |
| ·连续性反应过程 | 第23-25页 |
| ·浓度的瞬时值、平均值与脉动值 | 第25-26页 |
| ·平均浓度的计算 | 第25页 |
| ·脉动浓度的计算 | 第25-26页 |
| ·实例验证 | 第26页 |
| ·应用 | 第26-33页 |
| ·公式C_i = (C_i)|- + C_i' 在代谢组学数据中的应用 | 第26-27页 |
| ·公式C_i = (C_i)|- + C_i' 在发酵生产中的扩展应用 | 第27-33页 |
| 第4章 应用系统理论研究水产动物免疫力变化 | 第33-47页 |
| ·引言 | 第33页 |
| ·系统观点与免疫变化的确定 | 第33-36页 |
| ·免疫力的系统化研究思想 | 第34-35页 |
| ·指标变化F_i( Y_1,Y_2,...,Y_n)的确定与表达 | 第35-36页 |
| ·指标的相空间与平衡域 | 第36-38页 |
| ·指标的相空间 | 第36-37页 |
| ·指标变化的平衡域 | 第37-38页 |
| ·几何分析与数值模拟 | 第38-39页 |
| ·应用与讨论 | 第39-47页 |
| ·借助系统，揭示关联 | 第39-43页 |
| ·对免疫力变化的再认识 | 第43-45页 |
| ·关于免疫力实验的设定 | 第45页 |
| ·免疫疲劳新认识 | 第45-47页 |
| 第5章 结语与展望 | 第47-48页 |
| ·结论 | 第47页 |
| ·展望 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-50页 |
| 在读期间发表的学术论文 | 第50-51页 |
| 致谢 | 第51页 |