| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTARACT | 第9-11页 |
| 缩略语 | 第11-12页 |
| 第一章 文献综述 | 第12-28页 |
| 1 分子标记以及在水稻遗传研究中的应用 | 第12-15页 |
| 1.1 分子标记 | 第12-13页 |
| 1.2 遗传图谱 | 第13页 |
| 1.3 分子标记辅助选择(MAS) | 第13-15页 |
| 1.3.1 MAS的原理 | 第13-14页 |
| 1.3.2 MAS的应用 | 第14-15页 |
| 2 QTL定位及研究现状 | 第15-18页 |
| 2.1 QTL的研究历史和发展进程 | 第15页 |
| 2.2 QTL定位的基本原理和方法 | 第15-17页 |
| 2.2.1 基于性状的分析方法 | 第15-16页 |
| 2.2.2 基于标记的分析方法 | 第16-17页 |
| 2.3 QTL定位的常用群体 | 第17-18页 |
| 2.3.1 初级分离群体 | 第17页 |
| 2.3.2 次级分离群体 | 第17-18页 |
| 3 染色体片段置换系的发展 | 第18-19页 |
| 3.1 染色体片段置换系的定义 | 第18页 |
| 3.2 染色体片段置换系的构建方法 | 第18页 |
| 3.3 染色体片段置换系在植物遗传研究中的应用 | 第18-19页 |
| 3.3.1 QTL的初步定位 | 第18-19页 |
| 3.3.2 QTL精细定位和克隆 | 第19页 |
| 4 水稻穗部性状及柱头长度的分子定位研究进展 | 第19-24页 |
| 4.1 水稻穗部性状分子定位研究进展 | 第19-23页 |
| 4.1.1 水稻穗部性状QTL的定位研究进展 | 第20-21页 |
| 4.1.2 水稻穗部性状相关基因研究进展 | 第21-23页 |
| 4.2 水稻柱头长度分子定位研究进展 | 第23-24页 |
| 5 植物关联分析研究进展 | 第24-26页 |
| 5.1 关联分析 | 第24页 |
| 5.2 关联分析的理论基础 | 第24页 |
| 5.3 连锁不平衡的测定 | 第24-25页 |
| 5.4 影响LD的因素及其衰减 | 第25页 |
| 5.5 关联分析在植物遗传研究中的应用 | 第25-26页 |
| 6 本研究的目的和意义 | 第26-28页 |
| 第二章 利用Ⅱ-32B/A7444组合CSSL群体定位水稻7个穗部性状QTL | 第28-42页 |
| 1 材料与方法 | 第28-31页 |
| 1.1 供试材料 | 第29-30页 |
| 1.2 Ⅱ-32B/A7444染色体片段置换系的构建过程 | 第30页 |
| 1.3 群体种植与性状考察 | 第30-31页 |
| 1.4 QTL分析 | 第31页 |
| 1.5 基因测序 | 第31页 |
| 2 结果与分析 | 第31-39页 |
| 2.1 双亲及IIA-CSSL群体7个穗部性状的表现 | 第31-33页 |
| 2.2 7个穗部性状间的相关性 | 第33-34页 |
| 2.3 7个穗部性状的QTL | 第34-36页 |
| 2.4 穗部性状QTL成簇分布区间 | 第36-38页 |
| 2.5 主效QTL qSBN6和qSBN8所在染色体区间与已知基因序列的双亲差异 | 第38-39页 |
| 3 讨论 | 第39-42页 |
| 第三章 基于关联分析发掘水稻柱头长度有利等位变异 | 第42-56页 |
| 1 材料方法 | 第42-45页 |
| 1.1 实验材料和田间种植 | 第42-43页 |
| 1.2 表型鉴定 | 第43-44页 |
| 1.3 标记基因型的鉴定 | 第44页 |
| 1.4 数据分析 | 第44-45页 |
| 2 结果分析 | 第45-53页 |
| 2.1 品种群体柱头长度的表型分析 | 第45-46页 |
| 2.2 品种群体SSR分子标记基因型分析 | 第46页 |
| 2.3 品种群体遗传结构分析 | 第46-49页 |
| 2.4 各亚群间的遗传分化 | 第49页 |
| 2.5 7个亚群的遗传多样性分析 | 第49-50页 |
| 2.6 7个亚群的连锁不平衡分析 | 第50-51页 |
| 2.7 水稻柱头长度与SSR标记的关联分析 | 第51-53页 |
| 2.7.1 与水稻柱头长度显著关联的标记位点 | 第51页 |
| 2.7.2 柱头长度的优异等位变异及其典型材料 | 第51-53页 |
| 3 讨论 | 第53-56页 |
| 3.1 表型变异分析 | 第53页 |
| 3.2 遗传多样性和群体结构分析 | 第53页 |
| 3.3 本研究检测到的关联位点与前人研究结果的比较 | 第53-54页 |
| 3.4 优异等位变异及其载体材料的应用 | 第54-56页 |
| 全文结论及创新点 | 第56-58页 |
| 1 全文结论 | 第56页 |
| 2 创新点 | 第56-58页 |
| 参考文献 | 第58-66页 |
| 附录 | 第66-82页 |
| 发表与撰写的学术论文 | 第82-84页 |
| 致谢 | 第84页 |
