| 摘要 | 第8-13页 |
| ABSTRACT | 第13-18页 |
| 本文部分缩略词的中英文对照 | 第19-20页 |
| 引言 | 第20-22页 |
| 第一章 文献综述 | 第22-39页 |
| 1 肠道微生物组成及功能 | 第22-28页 |
| 1.1 肠道微生物的组成 | 第22-23页 |
| 1.2 猪肠道微生物的主要功能 | 第23-24页 |
| 1.3 肠道微生物代谢产物及功能 | 第24-28页 |
| 2 肠道黏膜先天免疫系统 | 第28-31页 |
| 2.1 Toll样受体 | 第29页 |
| 2.2 黏蛋白 | 第29页 |
| 2.3 紧密连接 | 第29-30页 |
| 2.4 分泌性免疫球蛋白A | 第30-31页 |
| 2.5 抗菌肽 | 第31页 |
| 3 肠道微生物与肠道黏膜免疫系统互作 | 第31-35页 |
| 3.1 肠道微生物对肠道黏膜免疫的影响 | 第31-33页 |
| 3.2 免疫系统对消化道微生物区系的影响 | 第33-35页 |
| 4 抗生素和不同蛋白水平日粮对肠道健康的影响 | 第35-38页 |
| 4.1 抗生素 | 第35-37页 |
| 4.2 日粮蛋白水平 | 第37-38页 |
| 5 总结与展望 | 第38-39页 |
| 本研究的目的、意义、内容和技术路线 | 第39-42页 |
| 1 本研究的目的 | 第39页 |
| 2 研究意义 | 第39页 |
| 3 本论文内容 | 第39-40页 |
| 4 技术路线 | 第40-42页 |
| 第二章 早期抗生素干预对肠道微生物及盲肠代谢产物的影响 | 第42-60页 |
| 1 材料与方法 | 第43-48页 |
| 1.1 试验动物与饲养管理 | 第43页 |
| 1.2 样品采集 | 第43页 |
| 1.3 空肠、回肠、盲肠和结肠食糜中总菌DNA提取 | 第43-45页 |
| 1.4 盲肠食糜中细菌16S rRNA高通量测序 | 第45页 |
| 1.5 空肠、回肠、结肠食糜中菌群荧光定量PCR检测 | 第45-46页 |
| 1.6 盲肠食糜中微生物代谢产物的测定 | 第46-48页 |
| 1.7 数据统计分析 | 第48页 |
| 2 结果 | 第48-55页 |
| 2.1 盲肠食糜中细菌16S rRNA高通量测序结果 | 第48-53页 |
| 2.2 空肠、回肠以及结肠食糜中主要细菌绝对定量分析 | 第53-54页 |
| 2.3 盲肠食糜中代谢产物的变化 | 第54-55页 |
| 3 讨论 | 第55-56页 |
| 4 本章小结 | 第56-60页 |
| 第三章 早期抗生素干预对仔猪肠道黏膜及血清免疫状态的影响 | 第60-70页 |
| 1 材料与方法 | 第61-63页 |
| 1.1 试验设计与动物饲养 | 第61页 |
| 1.2 样品采集 | 第61页 |
| 1.3 空肠、回肠和结黏膜肠RNA提取 | 第61页 |
| 1.4 RNA质量检测 | 第61-62页 |
| 1.5 RNA反转录 | 第62页 |
| 1.6 荧光定量PCR | 第62页 |
| 1.7 空肠、回肠、盲肠、结肠黏膜和血清中细胞因子及免疫球蛋白浓度的测定 | 第62-63页 |
| 1.8 统计分析 | 第63页 |
| 2 结果 | 第63-67页 |
| 2.1 早期抗生素干预对肠道黏膜免疫基因表达的影响 | 第63-64页 |
| 2.2 早期抗生素干预对肠道黏膜细胞因子和免疫球蛋白浓度的影响 | 第64-66页 |
| 2.3 早期抗生素干预对血清中细胞因子和免疫球蛋白浓度的影响 | 第66-67页 |
| 3 讨论 | 第67-68页 |
| 4 本章小结 | 第68-70页 |
| 第四章 早期抗生素干预对后期生长猪肠道微生物区系及代谢产物的影响 | 第70-92页 |
| 1 材料与方法 | 第71-74页 |
| 1.1 试验动物和日粮 | 第71-73页 |
| 1.2 样品采集 | 第73页 |
| 1.3 空肠、回肠、盲肠、结肠食糜中细菌DNA提取 | 第73页 |
| 1.4 荧光定量PCR | 第73页 |
| 1.5 盲肠食糜中细菌PCR扩增与变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第73-74页 |
| 1.6 盲肠和结肠食糜中短链脂肪酸浓度的测定 | 第74页 |
| 1.7 盲肠和结肠食糜中蛋白质发酵产物浓度的测定 | 第74页 |
| 1.8 统计分析 | 第74页 |
| 2 结果 | 第74-85页 |
| 2.1 早期抗生素干预对后期生长猪生长性能的影响 | 第74-75页 |
| 2.2 早期抗生素干预对后期生长猪肠道食糜中微生物区系影响 | 第75-79页 |
| 2.3 早期抗生素干预对后期生长猪大肠食糜中短链脂肪酸浓度的影响 | 第79-80页 |
| 2.4 早期抗生素干预对后期生长猪大肠食糜中蛋白质发酵产物浓度的影响 | 第80-85页 |
| 2.6 大肠食糜中主要细菌的数量与代谢产物的浓度相关性分析 | 第85页 |
| 3 讨论 | 第85-88页 |
| 4 本章小结 | 第88-92页 |
| 第五章 早期抗生素干预对后期生长猪肠道黏膜及血清免疫状态的影响 | 第92-108页 |
| 1 材料与方法 | 第93-94页 |
| 1.1 试验设计 | 第93页 |
| 1.2 样品采集 | 第93页 |
| 1.3 空肠、回肠和结肠黏膜RNA提取 | 第93页 |
| 1.4 RNA反转录 | 第93-94页 |
| 1.5 荧光定量PCR | 第94页 |
| 1.6 空肠、回肠、结肠黏膜和血清中细胞因子及免疫球蛋白浓度的测定 | 第94页 |
| 1.7 统计分析 | 第94页 |
| 2 结果 | 第94-103页 |
| 2.1 早期抗生素干预对后期生长猪肠道黏膜基因表达的影响 | 第94-98页 |
| 2.2 早期抗生素干预对后期生长猪肠道黏膜细胞因子和免疫球蛋白浓度的影响 | 第98-101页 |
| 2.3 早期抗生素干预对后期生长猪血清中细胞因子和免疫球蛋白浓度的影响 | 第101-102页 |
| 2.4 肠道微生物和代谢产物与肠道黏膜免疫相关指标相关性分析 | 第102-103页 |
| 3 讨论 | 第103-105页 |
| 4 本章小结 | 第105-108页 |
| 第六章 回肠末端灌注抗生素对生长猪空肠、结肠微生物区系及免疫状态的影响 | 第108-120页 |
| 1 材料与方法 | 第109-111页 |
| 1.1 试验设计 | 第109-110页 |
| 1.2 样品采集 | 第110页 |
| 1.3 空肠和结肠食糜中细菌DNA提取和荧光定量PCR | 第110-111页 |
| 1.4 空肠和结肠食糜中短链脂肪酸浓度的测定 | 第111页 |
| 1.5 空肠和结肠黏膜RNA提取 | 第111页 |
| 1.6 RNA反转录 | 第111页 |
| 1.7 荧光定量PCR | 第111页 |
| 1.8 空肠、结肠黏膜和血清中细胞因子及免疫球蛋白浓度的测定 | 第111页 |
| 1.9 统计分析 | 第111页 |
| 2 结果 | 第111-115页 |
| 2.1 回肠末端灌注抗生素对空肠和结肠食糜中微生物区系的影响 | 第111-112页 |
| 2.2 回肠末端灌注抗生素对空肠和结肠食糜中短链脂肪酸浓度的影响 | 第112-113页 |
| 2.3 回肠末端灌注抗生素对空肠和结肠黏膜基因表达的影响 | 第113页 |
| 2.4 回肠末端灌注抗生素对空肠和结肠黏膜细胞因子和免疫球蛋白浓度的影响 | 第113-114页 |
| 2.5 回肠末端灌注抗生素对血清中细胞因子和免疫球蛋白浓度的影响 | 第114-115页 |
| 3 讨论 | 第115-117页 |
| 4 本章小结 | 第117-120页 |
| 参考文献 | 第120-144页 |
| 全文结论 | 第144-146页 |
| 本文创新点 | 第146-148页 |
| 致谢 | 第148-150页 |
| 攻读博士学位期间论文发表 | 第150-152页 |
| 附录 | 第152-155页 |
