| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 1 引言 | 第11-23页 |
| 1.1 染色体显微分离克隆技术 | 第11-13页 |
| 1.1.1 染色体显微分离克隆技术的概念及意义 | 第11页 |
| 1.1.2 染色体显微分离克隆技术的方法及特点 | 第11-13页 |
| 1.1.3 染色体显微分离克隆技术的发展及应用 | 第13页 |
| 1.2 染色体体外扩增的方法 | 第13-17页 |
| 1.2.1 接头引物PCR法(LA-PCR) | 第13-15页 |
| 1.2.2 简并寡聚核苷酸引物PCR法(DOP-PCR) | 第15页 |
| 1.2.3 单细胞全基因组扩增(SWGA) | 第15-17页 |
| 1.3 染色体鉴定 | 第17-18页 |
| 1.3.1 southern杂交鉴定 | 第17页 |
| 1.3.2 FISH杂交鉴定 | 第17-18页 |
| 1.3.3 核型分析鉴定 | 第18页 |
| 1.4 高通量测序研究进展 | 第18-20页 |
| 1.5 林木植物及热带植物单染色体研究现状 | 第20-21页 |
| 1.6 本研究的目的意义及技术路线 | 第21-23页 |
| 1.6.1 研究的目的意义 | 第21-22页 |
| 1.6.2 技术路线 | 第22-23页 |
| 2 材料与方法 | 第23-33页 |
| 2.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第23页 |
| 2.1.2 试验试剂 | 第23页 |
| 2.1.3 试验的主要仪器 | 第23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-33页 |
| 2.2.1 染色体标本的制备 | 第23-25页 |
| 2.2.2 染色体的显微分离 | 第25-26页 |
| 2.2.3 单染色体的体外扩增 | 第26-27页 |
| 2.2.4 琼脂糖凝胶电泳检测 | 第27页 |
| 2.2.5 巴西橡胶树基因组DNA的提取 | 第27-28页 |
| 2.2.6 Southern杂交验证 | 第28-31页 |
| 2.2.7 FISH验证 | 第31-32页 |
| 2.2.8 高通量测序 | 第32-33页 |
| 3 结果与分析 | 第33-51页 |
| 3.1 适于分离巴西橡胶树单染色体标本制备方法的优化 | 第33页 |
| 3.2 巴西橡胶树单染色体的显微分离 | 第33-35页 |
| 3.3 单染色体DNA体外单细胞全基因组扩增结果 | 第35-36页 |
| 3.4 单染色体扩增产物的鉴定 | 第36-39页 |
| 3.4.1 巴西橡胶树热研7-33-97基因组DNA提取 | 第36-37页 |
| 3.4.2 单染色体第二轮单细胞全基因组MALBAC-PCR产物的Southern杂交分析 | 第37-38页 |
| 3.4.3 单染色体第二轮单细胞全基因组MALBAC-PCR产物的FISH杂交验证 | 第38-39页 |
| 3.5 巴西橡胶树热研7-33-97第8号染色体的高通量测序 | 第39-51页 |
| 3.5.1 热研7-33-97第8号染色体MALBAC-PCR第二轮扩增产物质量检测 | 第39-40页 |
| 3.5.2 热研7-33-97第8号染色体MALBAC-PCR第二轮扩增产物高通量测序一重过滤数据的处理及质控 | 第40-42页 |
| 3.5.3 热研7-33-97第8号染色体MALBAC-PCR第二轮扩增产物高通量测序双重过滤数据的比对及质控 | 第42-43页 |
| 3.5.4 热研7-33-97第8号染色体变异检测 | 第43-45页 |
| 3.5.5 热研7-33-97第8号染色体clean reads在线BLAST比对 | 第45-51页 |
| 4 讨论 | 第51-55页 |
| 4.1 关于显微分离方法的选择 | 第51页 |
| 4.2 关于橡胶树单染色体体外扩增方法的选择 | 第51-52页 |
| 4.3 关于全基因组扩增技术的选择 | 第52页 |
| 4.4 关于对亿康基因公司单细胞全基因组扩增试剂盒的优化 | 第52-53页 |
| 4.5 关于序列分析结果的讨论 | 第53-55页 |
| 5 结论 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-68页 |
| 附录Ⅰ | 第68-71页 |
| 附录Ⅱ | 第71-72页 |
| 致谢 | 第72页 |
