摘要 | 第4-5页 |
abstract | 第5-6页 |
第1章 绪论 | 第9-23页 |
1.1 引言 | 第9-10页 |
1.2 Rho激酶的结构 | 第10-11页 |
1.3 Rho激酶抑制剂的研究进展 | 第11-14页 |
1.3.1 Rho激酶与三磷酸腺苷(ATP)作用机制 | 第11-12页 |
1.3.2 Rho激酶抑制剂 | 第12-14页 |
1.4 Rho激酶抑制剂的治疗作用 | 第14-17页 |
1.5 计算机辅助药物设计理论基础 | 第17-21页 |
1.5.1 三维定量构效关系(3D-QSAR) | 第17-18页 |
1.5.2 分子对接与分子动力学模拟 | 第18-20页 |
1.5.3 结合自由能计算 | 第20-21页 |
1.6 研究目标、内容和意义 | 第21-23页 |
第2章 高活性苯并唑类ROCK抑制剂的研究 | 第23-44页 |
2.1 数据来源与准备 | 第23-25页 |
2.2 实验方法与步骤 | 第25-27页 |
2.2.1 3D-QSAR模型建立 | 第25-26页 |
2.2.2 半柔性分子对接与MD模拟 | 第26页 |
2.2.3 MM-GB/SA结合自由能计算 | 第26-27页 |
2.3 实验结果与讨论 | 第27-38页 |
2.3.1 最优CoMFA/CoMSIA模型统计学分析 | 第27-29页 |
2.3.2 CoMFA/CoMSIA模型三维等势场分析 | 第29-32页 |
2.3.3 MD模拟结果分析 | 第32-34页 |
2.3.4 结合自由能计算与分解结果分析 | 第34-38页 |
2.4 新ROCK抑制剂的设计 | 第38页 |
2.5 合成与生物活性测试 | 第38-43页 |
2.6 本章小结 | 第43-44页 |
第3章 选择性ROCK2/ROCK1抑制剂研究 | 第44-49页 |
3.1 计算方法与步骤 | 第45页 |
3.1.1 分子对接和MD模拟 | 第45页 |
3.1.2 MMPBSA结合自由能计算 | 第45页 |
3.2 结果和讨论 | 第45-48页 |
3.2.1 分子对接与MD模拟结果分析 | 第45-47页 |
3.2.2 结合自由能计算结果分析 | 第47-48页 |
3.3 本章小结 | 第48-49页 |
第4章 全文总结 | 第49-50页 |
参考文献 | 第50-57页 |
致谢 | 第57-58页 |
攻读学位期间所发表的学术论文 | 第58页 |