| 摘要 | 第7-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 常用中英文缩略词表 | 第11-12页 |
| 1 前言 | 第12-22页 |
| 1.1 研究问题的由来 | 第12页 |
| 1.2 羽囊的发生发育 | 第12-15页 |
| 1.2.1 羽囊的发生发育过程 | 第12-14页 |
| 1.2.2 鸡羽囊形态发生和发育过程中的分子机制研究 | 第14-15页 |
| 1.3 Wnt信号通路在羽囊形态发生中的研究进展 | 第15-17页 |
| 1.4 鹅羽囊发生发育的研究进展 | 第17-18页 |
| 1.5 转录组测序(RNA-Seq)技术概述 | 第18-20页 |
| 1.5.1 转录组测序的发展 | 第18页 |
| 1.5.2 RNA-seq的基本流程和数据处理 | 第18-20页 |
| 1.6 RNA-seq在鹅相关性状研究中的应用 | 第20-21页 |
| 1.7 本研究的目的及意义 | 第21-22页 |
| 2 材料与方法 | 第22-37页 |
| 2.1 试验材料 | 第22-25页 |
| 2.1.1 组织样品 | 第22页 |
| 2.1.2 主要仪器设备 | 第22页 |
| 2.1.3 主要的分子生物学试剂 | 第22-23页 |
| 2.1.4 其他试验用生化试剂的配制 | 第23-24页 |
| 2.1.5 原位杂交试剂配制 | 第24-25页 |
| 2.2 研究方法 | 第25-37页 |
| 2.2.1 转录组的建库流程 | 第25页 |
| 2.2.2 转录组测序生物信息分析流程 | 第25-28页 |
| 2.2.3 皖西白鹅背部皮肤RNA提取 | 第28页 |
| 2.2.4 cDNA第一链的合成及质量检测 | 第28-29页 |
| 2.2.5 Wnt信号通路相关基因的PCR扩增 | 第29-30页 |
| 2.2.6 Wnt信号通路相关基因PCR扩增产物纯化 | 第30-31页 |
| 2.2.7 连接与转化 | 第31页 |
| 2.2.8 阳性单克隆菌菌液PCR | 第31-32页 |
| 2.2.9 DNA测序及序列分析 | 第32页 |
| 2.2.10 定量检测Wnt信号通路相关基因在鹅胚皮肤发育中的表达模式 | 第32-33页 |
| 2.2.11 整体原位杂交(WISH)检测Wnt信号通路相关基因在皖西白鹅胚胎发育早期的表达模式 | 第33-37页 |
| 3 结果 | 第37-54页 |
| 3.1 鹅胚与鸡胚背部皮肤羽囊早期发育模式存在差异 | 第37-38页 |
| 3.2 皖西白鹅胚胎期背部皮肤RNA-seq整体质量评估及转录本拼接 | 第38-39页 |
| 3.3 基因功能注释 | 第39-44页 |
| 3.3.1 Nr注释结果 | 第40-41页 |
| 3.3.2 GO分类 | 第41-42页 |
| 3.3.3 KOG分类 | 第42-43页 |
| 3.3.4 KEGG分类 | 第43-44页 |
| 3.4 差异表达分析 | 第44-46页 |
| 3.4.1 差异基因的筛选 | 第44-45页 |
| 3.4.2 差异基因KEGG富集分析 | 第45-46页 |
| 3.5 羽囊发育相关基因的筛选及实时荧光定量PCR验证(qRT-PCR) | 第46-49页 |
| 3.6 Wnt信号通路相关基因的整体原位杂交验证 | 第49-54页 |
| 4 讨论 | 第54-59页 |
| 4.1 皖西白鹅转录组测序时期的选择 | 第54页 |
| 4.2 Wnt信号通路候选基因在皖西白鹅胚胎羽囊发育中的作用 | 第54-59页 |
| 4.2.1 WNT16在皖西白鹅胚胎羽囊发育中的调节作用 | 第54-55页 |
| 4.2.2 DKK1在皖西白鹅胚胎羽囊发育中的调节作用 | 第55-56页 |
| 4.2.3 FZD1在皖西白鹅胚胎羽囊发育中的调节作用 | 第56页 |
| 4.2.4 LEF1在皖西白鹅胚胎羽囊发育中的调节作用 | 第56-57页 |
| 4.2.5 SFRP1与FRZB在皖西白鹅胚胎羽囊发育中的调节作用 | 第57页 |
| 4.2.6 SOSTDC1在皖西白鹅胚胎羽囊发育中的调节作用 | 第57-59页 |
| 5 小结 | 第59-61页 |
| 5.1 本研究的结果与结论 | 第59页 |
| 5.2 本研究的创新点与特色 | 第59页 |
| 5.3 本研究的不足之处及下一步工作建议 | 第59-61页 |
| 参考文献 | 第61-68页 |
| 致谢 | 第68页 |
