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影响QTL连锁定位因素的实证分析和模拟研究

摘要第7-9页
ABSTRACT第9-11页
缩略语表第12-13页
第一章 文献综述第13-29页
    1.1 植物数量遗传体系第13-16页
        1.1.1 植物数量性状遗传体系的多基因遗传体系第13-14页
        1.1.2 植物数量性状遗传体系的主基因遗传体系第14-15页
        1.1.3 数量性状遗传体系的主基因-多基因遗传体系第15-16页
    1.2 QTL连锁定位的方法第16-23页
        1.2.1 单标记分析法(Single Marker Analysis,SMA)第16-17页
        1.2.2 区间作图法(Interval Mapping,IM)第17页
        1.2.3 复合区间作图法(Complex Interval Mapping,CIM)第17-19页
        1.2.4 混合线性模型复合区间作图法(Mixed-modle-based Composite IntervalMapping,MCIM)第19-20页
        1.2.5 完备区间作图法(Inclusive Composite Interval Mapping,ICIM)第20-21页
        1.2.6 多区间作图法(Multiple Interval Mapping,MIM)第21-22页
        1.2.7 多QTL模型(Multiple QTL Models,MQM)第22页
        1.2.8 其他连锁定位方法第22-23页
    1.3 影响QTL连锁定位准确性的因素第23-28页
        1.3.1 群体类型第23-24页
        1.3.2 标记密度第24-25页
        1.3.3 样本容量第25-26页
        1.3.4 性状遗传率第26-27页
        1.3.5 连锁定位的统计方法第27-28页
    1.4 本研究的目的意义第28-29页
第二章 植物数量遗传体系的实证分析第29-51页
    2.1 数据的获取第29页
    2.2 数据的描述性统计分析第29-42页
        2.2.1 总条目数第29-31页
        2.2.2 连锁定位的统计方法第31-33页
        2.2.3 群体类型第33-35页
        2.2.4 样本容量第35-38页
        2.2.5 标记数目第38-40页
        2.2.6 QTL的数目第40-42页
    2.3 数据的线性模型分析第42-47页
        2.3.1 无性状遗传率的模型分析第43-45页
        2.3.2 有性状遗传率的模型分析第45-47页
    2.4 植物数量遗传体系的主基因+多基因混合模型的初步论证第47-51页
第三章 数据的模拟和结论第51-101页
    3.1 数据模拟的方法第51页
    3.2 QTL的效应为指数分布下的模拟结果第51-63页
        3.2.1 QTL数目为10时模拟结果第51-56页
        3.2.2 QTL数目为20时模拟结果第56-58页
        3.2.3 QTL数目为50时模拟结果第58-59页
        3.2.4 QTL数目为100时模拟结果第59-61页
        3.2.5 QTL数目为200时模拟结果第61-63页
    3.3 QTL效应为指数分布时,比较不同QTL数目对结果的影响第63-64页
    3.4 QTL的效应为正态分布下的模拟结果第64-70页
        3.4.1 QTL数目为10时模拟结果第64-66页
        3.4.2 QTL数目为20时模拟结果第66-68页
        3.4.3 QTL数目为50时模拟结果第68-69页
        3.4.4 QTL数目为100时模拟结果第69页
        3.4.5 QTL数目为200时模拟结果第69-70页
    3.5 比较QTL的效应为指数分布和正态分布时对结果的影响第70-101页
第四章 全文结论和讨论第101-103页
    4.1 全文结论第101-102页
    4.2 讨论第102-103页
主要创新点第103-105页
附录第105-115页
    附录1 主函数( sim.qtl.power.r)的模拟程序第105-110页
    附录2 QTL在染色体上的效应分布为指数分布下的模拟程序第110-112页
    附录3 QTL在染色体上的效应分布为正态分布下的模拟程序第112-115页
参考文献第115-153页
攻读硕士期间发表及待发表论文第153-155页
致谢第155页

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