| 摘要 | 第7-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 缩略语表 | 第13-14页 |
| 第一章: 甘蓝型油菜含油量性状的全基因组关联分析 | 第14-45页 |
| 1 前言 | 第14-20页 |
| 1.1 植物关联分析研究进展 | 第14-18页 |
| 1.1.1 关联分析的原理 | 第14-15页 |
| 1.1.2 从候选基因关联分析到全基因组关联分析 | 第15-16页 |
| 1.1.3 油菜关联分析研究进展 | 第16-17页 |
| 1.1.4 关联分析研究趋势 | 第17-18页 |
| 1.2 甘蓝型油菜含油量的遗传研究进展 | 第18-19页 |
| 1.3 本研究的目的和意义 | 第19-20页 |
| 2 材料和方法 | 第20-24页 |
| 2.1 试验材料 | 第20页 |
| 2.1.1 自然群体的构建 | 第20页 |
| 2.1.2 双亲群体ZD DH群体的构建 | 第20页 |
| 2.2 田间试验和性状考察 | 第20-21页 |
| 2.3 表型的统计分析 | 第21页 |
| 2.4 SNP基因分型,质量控制及基因组位置的确定 | 第21-22页 |
| 2.5 甘蓝型油菜含油量QTLs的整合 | 第22页 |
| 2.6 群体结构,亲缘关系及遗传分化分析 | 第22-23页 |
| 2.7 连锁不平衡分析 | 第23页 |
| 2.8 全基因组关联分析 | 第23页 |
| 2.9 等位特异SNP标记的开发及QTL定位 | 第23-24页 |
| 3 结果与分析 | 第24-41页 |
| 3.1 SNP质量控制及分布 | 第24-27页 |
| 3.2 群体结构及亲缘关系分析 | 第27-30页 |
| 3.3 连锁不平衡分析 | 第30页 |
| 3.4 甘蓝型油菜含油量QTLs的整合分析 | 第30-33页 |
| 3.5 自然群体含油量表型变异 | 第33-34页 |
| 3.6 甘蓝型油菜含油量的全基因组关联分析 | 第34-37页 |
| 3.7 OilA5位点等位特异SNP标记的开发及双亲连锁群体的验证 | 第37-39页 |
| 3.8 含油量位点的累加效应 | 第39-41页 |
| 4 讨论 | 第41-45页 |
| 4.1 影响关联分析检测功效的因素 | 第41-42页 |
| 4.2 通过不同的关联分析方法检测甘蓝型油菜含油量关联位点 | 第42-43页 |
| 4.3 关联分析与连锁分析相结合解析植物数量性状的遗传基础 | 第43页 |
| 4.4 甘蓝型油菜含油量全基因组关联分析对育种的启示及推动 | 第43-44页 |
| 4.5 进一步工作设想 | 第44-45页 |
| 第二章: 甘蓝型油菜叶片硫苷含量的全基因组关联分析 | 第45-79页 |
| 1 前言 | 第45-55页 |
| 1.1 硫苷的结构、分类及分布 | 第46-47页 |
| 1.2 硫苷的合成代谢 | 第47-51页 |
| 1.2.1 侧链的延伸 | 第47-48页 |
| 1.2.2 核心结构的形成 | 第48-50页 |
| 1.2.3 侧链的修饰 | 第50-51页 |
| 1.3 硫苷的转运 | 第51-52页 |
| 1.4 硫苷的降解代谢 | 第52-53页 |
| 1.5 硫苷的功能和作用 | 第53-54页 |
| 1.5.1 硫苷与植物抗病虫 | 第53页 |
| 1.5.2 硫苷可作为天然的杂草生长抑制剂 | 第53-54页 |
| 1.5.3 硫苷的食用功效 | 第54页 |
| 1.6 甘蓝型油菜硫苷QTL的研究进展 | 第54-55页 |
| 1.7 本研究的目的和意义 | 第55页 |
| 2 材料和方法 | 第55-60页 |
| 2.1 试验材料 | 第55-56页 |
| 2.2 田间试验及性状考察 | 第56页 |
| 2.3 叶片硫苷的提取、检测及分析 | 第56-58页 |
| 2.3.1 叶片硫苷的提取 | 第56-57页 |
| 2.3.2 硫苷的HPLC检测 | 第57页 |
| 2.3.3 叶片硫苷分量的计算及分析 | 第57-58页 |
| 2.4 表型的统计分析 | 第58-59页 |
| 2.5 油菜苗期离体叶片菌核病抗性鉴定 | 第59页 |
| 2.6 SNP基因分型,质量控制及基因组位置的确定 | 第59-60页 |
| 2.7 全基因组关联分析 | 第60页 |
| 3 结果与分析 | 第60-75页 |
| 3.1 甘蓝型油菜硫苷表型变异及相关性 | 第60-66页 |
| 3.2 叶片硫苷含量与苗期叶片菌核病抗性的相关性 | 第66-67页 |
| 3.3 甘蓝型油菜叶片硫苷组分性状的全基因组关联分析 | 第67-74页 |
| 3.3.1 硫苷侧链修饰位点的鉴定 | 第70页 |
| 3.3.2 控制甘蓝型油菜叶片脂肪族和吲哚族硫苷含量位点的独立性 | 第70-71页 |
| 3.3.3 控制甘蓝型油菜叶片与种子硫苷含量位点的异同 | 第71-74页 |
| 3.4 甘蓝型油菜种子低硫苷材料中控制叶片硫苷含量变异的主要位点 | 第74-75页 |
| 4 讨论 | 第75-79页 |
| 4.1 利用全基因组关联分析解析甘蓝型油菜硫苷代谢的遗传基础 | 第75-76页 |
| 4.2 MYB28在芸薹科植物硫苷代谢中扮演着至关重要的角色 | 第76页 |
| 4.3 GLS-A3是造成甘蓝型油菜叶片高硫苷种子低硫苷的关键位点 | 第76-77页 |
| 4.4 通过提高吲哚族硫苷含量增强甘蓝型油菜抗菌核病能力 | 第77-78页 |
| 4.5 进一步工作设想 | 第78-79页 |
| 参考文献 | 第79-91页 |
| 附录 | 第91-117页 |
| 附录1 自然群体521份甘蓝型油菜自交系详单 | 第91-103页 |
| 附录2 甘蓝型油菜含油量QTLs的整合分析结果 | 第103-107页 |
| 附录3 三种方法(GLM,MLM和A-D test)鉴定的含油量关联位点汇总 | 第107-111页 |
| 附录4 25个硫苷组分性状关联分析结果汇总 | 第111-116页 |
| 附录5 作者简介以及研究生阶段发表的成果 | 第116-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
