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乙肝病毒聚合酶与人核不均一性核糖核蛋白KI结构域之间相互作用的研究

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
一、前言第12-28页
    1 研究背景第12-26页
        1.1 HBV病毒颗粒结构第13-14页
        1.2 HBV Pol的结构第14-15页
        1.3 HBV Pol参与HBV基因组复制第15-17页
        1.4 HBV Pol的研究进展第17-19页
        1.5 HnRNPK的简介第19页
        1.6 HnRNPK的PCBPs属性第19-23页
        1.7 HnRNPK的亚细胞定位第23-24页
        1.8 HnRNPK KI domain的特性第24-25页
        1.9 HnRNPK参与核酸加工的研究进展第25-26页
    2、课题意义第26-27页
    3、研究思路第27-28页
二、实验仪器、实验材料及试剂配制第28-32页
    2.1 主要实验仪器第28-29页
    2.2 主要实验材料第29-30页
    2.3 试剂配制第30-32页
        2.3.1 培养基及试剂配制第30-32页
三、实验方法第32-55页
    3.1 pGEX-4T1ΔKI重组质粒的构建第32-40页
        3.1.1 hnRNPK-5’端截短型基因PCR第32页
        3.1.2 hnRNPK-3’端截短型基因PCR第32-33页
        3.1.3 hnRNPK-5’端截短型基因及hnRNPK-3’端截短型基因PCR产物切胶回收第33-34页
        3.1.4 pGEX-4T-1 载体小量抽提第34页
        3.1.5 hnRNPK-5’端截短型基因双酶切第34-35页
        3.1.6 hnRNPK-3’端截短型基因双酶切第35页
        3.1.7 pGEX-4T-1 载体双酶切第35页
        3.1.8 酶切产物清洁第35-36页
        3.1.9 hnRNPK-5’端截短型和hnRNPK-3’端截短型基因酶切产物与pGEX-4T-1 载体酶切产物连接第36页
        3.1.10 连接产物转化大肠杆菌DH5α第36-38页
        3.1.11 菌落PCR筛选、鉴定pGEX-4T1ΔKI重组质粒第38页
        3.1.12 pGEX-4T1ΔKI重组质粒酶切鉴定第38-40页
    3.2 GST-pulldown实验检测Pol与KI之间的相互作用第40-45页
        3.2.1 pGEX-4T1ΔKI重组质粒转化Rosetta表达菌第40页
        3.2.2 含有pGEX-4T1ΔKI重组质粒的菌种保藏第40页
        3.2.3 IPTG诱导GST- KI融合蛋白表达第40-41页
        3.2.4 SDS-PAGE检测GST-ΔKI融合蛋白样品第41-42页
        3.2.5 真核蛋白Pol-flag的获得第42-43页
        3.2.6 GST-pulldown第43-44页
        3.2.7 SDS-PAGE检测GST-bead纯化GST融合蛋白样品第44页
        3.2.8 Western-blot第44-45页
    3.3 pcDNA3.1-ΔKI-HA重组质粒的构建第45-48页
        3.3.1 hnRNPK-5’端截短型基因PCR第45页
        3.3.2 hnRNPK-3’端截短型基因PCR第45页
        3.3.3 hnRNPK-5’端截短型基因及hnRNPK-3’端截短型基因PCR产物切胶回收第45-46页
        3.3.4 pcDNA3.1(+)载体小量抽提第46页
        3.3.5 hnRNPK-5’端截短型基因双酶切第46页
        3.3.6 hnRNPK-3’端截短型基因双酶切第46页
        3.3.7 pcDNA3.1(+)载体双酶切第46页
        3.3.8 酶切产物清洁第46页
        3.3.9 hnRNPK-5’端截短型和hnRNPK-3’端截短型基因酶切产物与pcDNA3.1(+)载体酶切产物连接第46-47页
        3.3.10 连接产物转化大肠杆菌DH5α第47页
        3.3.11 菌落PCR筛选、鉴定pcDNA3.1-ΔKI-HA重组质粒第47页
        3.3.12 pcDNA3.1-ΔKI-HA重组质粒酶切鉴定第47-48页
    3.4 Co-immuneprecipitation实验检测Pol与KI之间的相互作用第48-49页
        3.4.1 细胞培养和质粒共同转染第48页
        3.4.2 裂解细胞获取上清第48页
        3.4.3 Co-immuneprecipitation第48-49页
        3.4.4 Western-blot第49页
    3.5 pGEX-4T1HD重组质粒的构建第49-51页
        3.5.1 hnRNPK蛋白KI单独结构域基因PCR第49页
        3.5.2 hnRNPK蛋白KI单独结构域基因PCR产物切胶回收第49页
        3.5.3 pGEX-4T-1 载体小量抽提第49页
        3.5.4 hnRNPK蛋白KI单独结构域基因双酶切第49-50页
        3.5.5 pGEX-4T-1 载体双酶切第50页
        3.5.6 酶切产物清洁第50页
        3.5.7 hnRNPK蛋白KI单独结构域基因酶切产物与pGEX-4T-1 载体酶切产物连接第50页
        3.5.8 连接产物转化大肠杆菌DH5α第50页
        3.5.9 菌落PCR筛选、鉴定pGEX-4T1HD重组质粒第50-51页
        3.5.10 pGEX-4T1HD重组质粒酶切鉴定第51页
    3.6 GST-pulldown实验检测Pol与HD之间的相互作用第51-52页
        3.6.1 pGEX-4T1ΔKI重组质粒转化Rosetta表达菌第51页
        3.6.2 IPTG诱导GST-HD融合蛋白表达第51页
        3.6.3 真核蛋白Pol-flag的获得第51页
        3.6.4 GST-pulldown第51-52页
    3.7 pcDNA3.1-HD-HA重组质粒的构建第52-53页
        3.7.1 hnRNPK蛋白KI单独结构域基因PCR第52页
        3.7.2 hnRNPK蛋白KI单独结构域基因PCR产物切胶回收第52页
        3.7.3 pcDNA3.1(+)载体小量抽提第52页
        3.7.4 hnRNPK蛋白KI单独结构域基因双酶切第52页
        3.7.5 pcDNA3.1(+)载体双酶切第52页
        3.7.6 酶切产物清洁第52页
        3.7.7 hnRNPK蛋白KI单独结构域基因酶切产物与pcDNA3.1(+)载体酶切产物连接第52-53页
        3.7.8 连接产物转化大肠杆菌DH5α第53页
        3.7.9 菌落PCR筛选、鉴定pGEX-4T1HD重组质粒第53页
        3.7.10 pGEX-4T1HD重组质粒酶切鉴定第53页
    3.8 Co-immuneprecipitation实验检测Pol与HD之间的相互作用第53-55页
        3.8.1 细胞培养和质粒共同转染第53页
        3.8.2 裂解细胞获取上清第53页
        3.8.3 Co-ip第53-54页
        3.8.4 Western-blot第54-55页
四、结果与分析第55-69页
    4.1 GST-pulldown实验检测缺失KI结构域的hnRNPK与Pol的相互作用第55-60页
        4.1.1 pGEX-4T1ΔKI重组质粒的构建第55-57页
        4.1.2 GST-pulldown实验检测Pol与KI结构域缺失型hnRNPK之间的相互作用第57-60页
    4.2 Co-ip实验检测缺失KI结构域的hnRNPK与Pol的相互作用第60-62页
        4.2.1 pcDNA3.1-ΔKI-HA重组质粒的构建第60-61页
        4.2.2 Co-ip实验进一步检测Pol与KI结构域缺失型hnRNPK之间的相互作用第61-62页
    4.3 GST-pulldown实验检测单独的KI结构域与Pol的相互作用第62-67页
        4.3.1 pGEX-4T1HD重组质粒构建(即只含有KI单独结构域的质粒)第62-64页
        4.3.2 GST-pulldown实验检测Pol与HD之间的相互作用第64-67页
    4.4 Co-ip实验检测单独的KI结构域与Pol的相互作用第67-69页
        4.4.1 pcDNA3.1-HD-HA重组质粒构建第67-68页
        4.4.2 Co-ip实验进一步检测Pol与HD之间的相互作用第68-69页
五、讨论第69-73页
结论与展望第73-74页
参考文献第74-78页
附录第78-80页
致谢第80-81页

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