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长链非编码RNA H19在慢性粒细胞白血病(CML)中的功能及其靶蛋白和靶microRNA的鉴定研究

摘要第3-6页
Abstract第6-9页
前言第14-23页
    1.慢性粒细胞白血病概述第14页
    2.长链非编码RNA概述第14-15页
    3.长链非编码RNA的功能及作用机制第15-17页
    4.长链非编码RNA的研究方法第17-18页
    5.长链非编码RNAH19概述及其表达特点第18-19页
    6.RNA干扰技术第19-20页
    7.研究假说与研究思路第20-21页
    8.技术路线第21页
    9.研究意义及创新之处第21-22页
    10.实验内容第22-23页
第一部分 :H19在K562细胞及CML小鼠模型中的功能研究第23-38页
    实验材料与方法第23-31页
        1.主要试剂和实验材料第23页
        2.H19-SiRNA序列和H19慢病毒表达载体第23-24页
            2.1 H19SiRNA序列第23-24页
            2.2 H19慢病毒表达载体第24页
        3.细胞株第24页
        4.主要试剂配制第24-26页
            4.1 含10%血清的细胞培养基第24页
            4.2 pH7.2磷酸缓冲液(PBS)第24-25页
            4.3 配制2.7%的甲基纤维素半固体培养基第25-26页
        5.主要仪器和材料第26页
        6.实验方法第26-31页
            6.1 细胞培养第26页
            6.2 H19-SiRNA有效序列的筛选第26-29页
            6.3 建立稳定表达H19的K562细胞株第29页
            6.4 Real-timePCR检测细胞内H19mRNA的相对表达水平第29页
            6.5 H19对K562细胞colony形成的影响第29-30页
            6.6 H19在CML小鼠模型中的功能研究第30-31页
    实验结果第31-36页
        1.H19对K562细胞进展的影响第31-33页
            1.1 H19表达量检测第31页
            1.2 H19-SiRNA有效序列的筛选第31-32页
            1.3 H19慢病毒载体转染K562细胞的效率检测第32-33页
            1.4 H19过表达对K562细胞colony形成的影响第33页
        2.过表达H19对CML模型鼠Balb/c裸鼠的影响第33-34页
        3.过表达H19对CML模型小鼠NOD/SCID的影响第34-36页
    讨论第36-38页
第二部分 :lncRNAH19靶蛋白和靶miRNA的鉴定研究第38-64页
    实验材料与方法第38-56页
        1.主要试剂和实验材料第38-39页
        2.带有T7启动子序列的H19基因的引物序列第39-40页
            2.1 带有T7启动子序列的H19基因的引物序列第39-40页
        3.细胞株第40页
        4.主要试剂配制第40-43页
            4.1 配制10×TAE电泳缓冲液第40页
            4.2 配制0.8%的琼脂糖胶第40页
            4.3 LB培养基配制第40页
            4.4 LB固体培养基配制第40-41页
            4.5 配制5M的氯化钠第41页
            4.6 10×TBS缓冲液配制(pH=7.6)第41页
            4.7 配制1×TBST缓冲液第41页
            4.8 配制1×转膜缓冲液(pH=8.5)第41页
            4.9 配制封闭液第41页
            4.10 配制抗体稀释液第41页
            4.11 5×SDS-PAGE电泳缓冲液第41-42页
            4.12 1.5 mol/LpH=8.8Tris-HCL缓冲液第42页
            4.13 30%丙烯酰胺第42页
            4.14 10%的分离胶第42页
            4.15 5%浓缩胶第42-43页
        5.主要仪器和材料第43-44页
        6.实验方法第44-56页
            6.1 获得体外转录的模板第44-47页
            6.2 获得脱硫生物素标记的lncRNAH第47-49页
            6.3 标记完成的RNA进行RNA-ProtienPullDown实验第49-52页
            6.4 RNA-BindingProtein复合物的检测第52页
            6.5 标记好的长链非编码RNAH19与RNA的结合第52-53页
            6.6 RNA-RNA结合复合物进行小RNA测序第53-54页
            6.7 WesternBlot验证目的蛋白第54-55页
            6.8 .lncRNAH19靶miRNA验证第55页
            6.9 生物信息学软件第55-56页
    实验结果第56-61页
        1.以H19慢病毒载体为模板扩增带有T7启动子的体外转录的模板第56页
        2.体外转录产物lncRNAH19的鉴定第56-57页
        3.RNApull-down后RNA-bindingprotein的鉴定第57页
        4.RNApull-down产物的蛋白质谱鉴定第57-58页
        5.lncRNAH19pull-down的质谱检测和软件预测共同存在的蛋白质分子第58-59页
        6.WesternBlot验证长链非编码RNAH19的靶蛋白PCBP1和FUS第59页
        7.RNA-seq检测长链非编码RNAH19的靶miRNA第59-60页
        8.Real-timePCR验证lncRNAH19的靶miRNA第60-61页
    讨论第61-64页
第三部分 lncRNAH19靶蛋白和靶miRNA的功能研究第64-78页
    实验材料与方法第64-70页
        1.主要试剂和实验材料第64-65页
        2.miR-19a-3p和miR-106b-5p反义核酸的序列、PCBP1-siRNA和FUS-siRNA序列第65页
            2.1 miR-19a-3p和miR-106b-5p反义核酸的序列第65页
            2.2 PCPB1-SiRNA和FUS-SiRNA序列第65页
        3.细胞株第65页
        4.主要试剂配制第65-66页
            4.1 MTT溶液第65-66页
        5.主要仪器和材料第66页
        6.实验方法第66-70页
            6.1 PCBP1-SiRNA和FUS-SiRNA有效序列的筛选第66-67页
            6.2 靶向抑制PCBP1和FUS对K562细胞colony形成的影响第67页
            6.3 靶向抑制PCPB1和FUS对K562细胞Imatinib药物敏感性的作用第67-68页
            6.4 靶向抑制miR19a-3p和miR-106b-5p对K562细胞活力的影响第68-69页
            6.5 靶向抑制miR19a-3p和miR-106b-5p对K562细胞colony形成的影响第69页
            6.6 生物信息学软件第69页
            6.7 统计学处理第69-70页
    实验结果第70-76页
        1.PCPB1-SiRNA和FUS-SiRNA有效序列的筛选第70-71页
        2.PCPB1和FUS在K562细胞恶性进展的研究第71-72页
            2.1 靶向抑制PCPB1和FUS后对K562细胞恶性进展的影响第71-72页
        3.miR-19a-3p和miR-106b-5p在K562细胞恶性进展的研究第72-74页
            3.1 靶向抑制miR-19a-3p和miR-106b-5p后对K562细胞恶性进展的影响第72-74页
        4.信号通路分析整合第74-76页
    讨论第76-78页
不足与展望第78-79页
参考文献第79-84页
附录英文缩略词第84-85页
在读期间的科研成果第85-86页
致谢第86-87页
附件1第87-102页
附件2第102-132页

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