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蒙古冰草抗旱相关microRNA挖掘与功能验证

摘要第3-4页
abstract第4-5页
1 引言第11-18页
    1.1 蒙古冰草及研究现状第11-12页
    1.2 植物miRNA概况第12-17页
        1.2.1 miRNA的发现第12页
        1.2.2 miRNA的命名第12页
        1.2.3 植物miRNA的产生和作用机制第12-13页
        1.2.4 植物miRNA的特点第13-14页
        1.2.5 植物miRNA的靶基因第14页
        1.2.6 植物miRNA的干旱胁迫响应第14-17页
    1.3 研究目的与意义第17-18页
2 材料与方法第18-28页
    2.1 试验材料与试剂第18页
        2.1.1 试验材料及载体菌种第18页
        2.1.2 试验试剂及配方第18页
    2.2 蒙古冰草植株的培养及取样第18-19页
    2.3 蒙古冰草总RNA的提取第19页
    2.4 干旱胁迫下蒙古冰草smallRNA文库构建及Solexa高通量测序第19-21页
        2.4.1 文库构建及测序第19-20页
        2.4.2 信息分析流程第20-21页
    2.5 蒙古冰草7个抗旱相关新预测miRNA的实时荧光定量PCR验证第21-23页
        2.5.1 引物设计第21-22页
        2.5.2 miRNA反转录第22页
        2.5.3 实时荧光定量PCR第22-23页
    2.6 蒙古冰草7个抗旱相关miRNA靶基因预测及生物信息学分析第23页
    2.7 蒙古冰草7个miRNA基因的克隆及植物表达载体的构建第23-26页
        2.7.1 蒙古冰草总RNA的反转录第23-24页
        2.7.2 PCR引物设计第24页
        2.7.3 miRNA目的片段的扩增第24-25页
        2.7.4 表达载体的获得第25页
        2.7.5 表达载体和目的片段的双酶切第25页
        2.7.6 目的片段与载体的连接第25-26页
        2.7.7 大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备第26页
        2.7.8 连接产物转化大肠杆菌DH5α感受态细胞第26页
    2.8 农杆菌介导拟南芥遗传转化第26-27页
        2.8.1 农杆菌感受态细胞的制备第26页
        2.8.2 阳性克隆转化农杆菌感受态细胞第26-27页
        2.8.3 侵染拟南芥花序介导转化第27页
    2.9 转基因拟南芥植株的筛选第27-28页
        2.9.1 转基因拟南芥植株的干旱处理及表型观测第27页
        2.9.2 转基因拟南芥植株的PCR及实时荧光定量PCR鉴定第27-28页
3 结果与分析第28-50页
    3.1 干旱胁迫下蒙古冰草smallRNA文库构建及Solexa高通量测序第28-29页
        3.1.1 测序结果统计第28页
        3.1.2 sRNA注释第28-29页
        3.1.3 公共及特有序列分析第29页
    3.2 蒙古冰草抗旱相关miRNA的筛选及其靶基因预测第29-36页
        3.2.1 基于长度分布的miRNA筛选第29-31页
        3.2.2 基于miRNA成熟序列的碱基偏好性筛选第31-32页
        3.2.3 基于miRBase20数据库的miRNA筛选第32页
        3.2.4 差异表达miRNA分析第32-34页
        3.2.5 靶基因预测及功能注释第34页
        3.2.6 差异表达miRNA靶基因的注释第34-36页
    3.3 蒙古冰草7个抗旱相关miRNA的实时荧光定量PCR验证第36-39页
        3.3.1 蒙古冰草总RNA的提取第36-37页
        3.3.2 蒙古冰草抗旱相关的7个新预测miRNA的真实性检测第37页
        3.3.3 蒙古冰草抗旱相关的7个新预测miRNA的表达分析第37-39页
    3.4 蒙古冰草抗旱相关的7个新预测miRNA的靶基因预测第39-43页
    3.5 成功构建蒙古冰草7个抗旱相关miRNA的表达载体第43-46页
        3.5.1 蒙古冰草7个miRNA基因的克隆第43-44页
        3.5.2 pBI121表达载体的获得第44页
        3.5.3 菌落PCR验证第44-45页
        3.5.4 植物表达载体构建第45-46页
    3.6 农杆菌介导遗传转化和转基因拟南芥植株检测第46-50页
        3.6.1 不同miRNA转基因拟南芥植株的筛选第46页
        3.6.2 转基因拟南芥植株的表型分析第46-47页
        3.6.3 转基因拟南芥植株的PCR检测第47-48页
        3.6.4 转基因拟南芥植株的qRT-PCR检测第48-50页
4 讨论第50-53页
    4.1 蒙古冰草差异表达的miRNA筛选第50页
    4.2 蒙古冰草miRNA的qRT-PCR验证以及靶基因预测第50-51页
    4.3 蒙古冰草miRNA表达载体的构建第51-53页
5 结论第53-54页
致谢第54-55页
参考文献第55-63页
附录第63-70页
作者简介第70页

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