| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 第1章 鲸类适应性进化的研究进展 | 第10-16页 |
| 1.1 鲸类基因组研究 | 第10-11页 |
| 1.2 形态的改变 | 第11-13页 |
| 1.3 视觉功能的退化 | 第13-14页 |
| 1.4 嗅觉功能的退化 | 第14页 |
| 1.5 回声定位功能的出现 | 第14-16页 |
| 第2章 鲸类渗透调节的适应性进化 | 第16-49页 |
| 2.1 前言 | 第16-21页 |
| 2.1.1 鲸类的渗透调节 | 第16-18页 |
| 2.1.2 鲸类渗透调节相关基因的筛选 | 第18-21页 |
| 2.2 材料与方法 | 第21-30页 |
| 2.2.1 实验步骤 | 第21-27页 |
| 2.2.2 数据分析 | 第27-30页 |
| 2.3 结果 | 第30-44页 |
| 2.3.1 基因扩增 | 第30-31页 |
| 2.3.2 系统发生分析 | 第31-33页 |
| 2.3.3 选择压力分析 | 第33-39页 |
| 2.3.4 氨基酸极性分析 | 第39页 |
| 2.3.5 正选择位点在蛋白质三维结构上的分布 | 第39-44页 |
| 2.4 讨论 | 第44-49页 |
| 2.4.1 渗透调节基因的分子进化普遍存在于鲸类谱系中 | 第44-46页 |
| 2.4.2 鲸类水盐调节能力的增强 | 第46-47页 |
| 2.4.3 鲸类中较高的非同义突变率与有效种群大小的关系 | 第47-49页 |
| 第3章 鲸类表皮衍生物相关基因的分子进化 | 第49-65页 |
| 3.1 前言 | 第49-50页 |
| 3.2 材料和方法 | 第50-52页 |
| 3.2.1 实验步骤 | 第50-51页 |
| 3.2.2 实验及分析方法 | 第51-52页 |
| 3.3 结果 | 第52-62页 |
| 3.3.1 数据获得 | 第52-56页 |
| 3.3.2 系统发育分析 | 第56-57页 |
| 3.3.3 选择压力分析 | 第57-61页 |
| 3.3.4 氨基酸极性变化 | 第61-62页 |
| 3.4 讨论 | 第62-65页 |
| 3.4.1 鲸类EDA信号途径经历了适应性进化 | 第62-64页 |
| 3.4.2 鲸类特异的氨基酸变化 | 第64-65页 |
| 第4章 昆虫线粒体能量代谢相关基因分子进化(扩展内容) | 第65-92页 |
| 4.1 前言 | 第65-66页 |
| 4.2 材料和方法 | 第66-74页 |
| 4.2.1 数据的获得 | 第66-72页 |
| 4.2.2 分析方法 | 第72-74页 |
| 4.3 结果 | 第74-90页 |
| 4.3.1 飞行与不飞行昆虫的线粒体蛋白编码基因的选择压力 | 第74-75页 |
| 4.3.2 有翅亚纲祖先节点的选择压力 | 第75-77页 |
| 4.3.3 新翅下纲祖先节点的选择压力 | 第77页 |
| 4.3.4 进化过程中线粒体基因所受的选择压力 | 第77-90页 |
| 4.4 讨论 | 第90-92页 |
| 4.4.1 飞行昆虫的线粒体蛋白编码基因具有较强的正选择作用 | 第90-91页 |
| 4.4.2 间接飞行昆虫的线粒体蛋白编码基因具有较强的正选择作用 | 第91页 |
| 4.4.3 线粒体蛋白编码基因的正选择作用于昆虫整个进化过程中 | 第91-92页 |
| 第5章 小结与展望 | 第92-93页 |
| 附录A | 第93-98页 |
| A1 本实验使用试剂以及仪器 | 第93-94页 |
| A2 试剂配置 | 第94页 |
| A3 基本操作步骤 | 第94-98页 |
| 附录B | 第98-105页 |
| 附录C | 第105-109页 |
| 参考文献 | 第109-126页 |
| 在读期间发表的学术论文及研究成果 | 第126-127页 |
| 致谢 | 第127页 |
