| 摘要 | 第5-8页 |
| Abstract | 第8-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第17-39页 |
| 1 细菌性疾病的治疗手段 | 第17-18页 |
| 2 微生物的密度感应系统及其种类 | 第18-25页 |
| 2.1 AHL 信号分子的结构与特性 | 第21-22页 |
| 2.2 QS 系统的同一性和多样性 | 第22-25页 |
| 3 天然密度感应淬灭物质 | 第25-37页 |
| 3.1 小分子 QS 阻抑物 | 第25-30页 |
| 3.1.1 海洋来源的 AHL 类 QS 小分子阻抑物 | 第26-29页 |
| 3.1.2 陆地来源的 AHL 类 QS 小分子阻抑物 | 第29页 |
| 3.1.3 抑制其他 QS 系统的天然化合物 | 第29-30页 |
| 3.2 大分子密度感应淬灭物质 | 第30-37页 |
| 3.2.1 AHL 内酯酶 | 第34-35页 |
| 3.2.2 AHL 酰基转移酶 | 第35-36页 |
| 3.2.3 AHL 氧化还原酶 | 第36-37页 |
| 4 海洋来源的密度感应淬灭细菌 | 第37-38页 |
| 5 本论文的研究目的和意义 | 第38-39页 |
| 第二章 密度感应淬灭菌株高通量筛选方法 | 第39-57页 |
| 1 材料与方法 | 第39-43页 |
| 1.1 报告菌株 | 第39-40页 |
| 1.2 N-酰基高丝氨酸内酯（N-acylhomoserine lactones, AHLs） | 第40页 |
| 1.3 高通量 QQ 菌株筛选方法概述 | 第40-41页 |
| 1.4 高通量 QQ 菌株筛选方法校正系数的测定及优化 | 第41-42页 |
| 1.5 高通量 QQ 菌株筛选方法与传统 ONPG 法的比较 | 第42页 |
| 1.6 高通量 QQ 菌株筛选方法的应用 | 第42页 |
| 1.7 QQ 菌株 AHL 降解特性的进一步检测 | 第42-43页 |
| 1.8 QQ 菌株对斑马鱼的致病性以及保护能力 | 第43页 |
| 2 结果 | 第43-52页 |
| 2.1 高通量 QQ 菌株筛选方法校正系数的测定 | 第43-45页 |
| 2.2 高通量 QQ 菌株筛选方法的优化 | 第45页 |
| 2.3 高通量 QQ 菌株筛选方法的最终流程 | 第45-46页 |
| 2.4 高通量 QQ 菌株筛选方法与传统 ONPG 法的比较 | 第46-47页 |
| 2.5 QQ 菌株的高通量筛选 | 第47-49页 |
| 2.6 QQ 菌株 AHL 降解特性的进一步研究 | 第49-52页 |
| 2.7 QQ 菌株对斑马鱼的保护效果 | 第52页 |
| 3 讨论 | 第52-56页 |
| 4 小结 | 第56-57页 |
| 第三章 耐油具柄菌 (Muricauda olearia) Th120 的密度感应淬灭活性分析 | 第57-99页 |
| 1 材料与方法 | 第57-64页 |
| 1.1 菌株与质粒 | 第57-58页 |
| 1.2 AHL 降解活性的检测方法概述 | 第58页 |
| 1.3 菌株 Th120 的小分子物质的提取、初步纯化与检测 | 第58-59页 |
| 1.4 菌株 Th120 胞外产物和细胞内含物的制备 | 第59页 |
| 1.5 菌株 Th120 胞外产物中蛋白的初步分离 | 第59页 |
| 1.6 内酯酶活性的初步检测：酸化法 | 第59页 |
| 1.7 胶内 QQ 活性检测 | 第59-60页 |
| 1.8 菌株 Th120 的全基因组测序 | 第60页 |
| 1.9 胶内 QQ 活性蛋白条带的质谱检测 | 第60页 |
| 1.10 菌株 Th120 重组 QQ 酶的表达与纯化 | 第60-61页 |
| 1.11 HPLC 和 ESI-MS 检测 MomL 的 AHL 降解产物 | 第61页 |
| 1.12 重组 MomL 酶学动力学参数的测定 | 第61-62页 |
| 1.13 重组 MomL 的 AHL 降解特性的测定 | 第62-63页 |
| 1.13.1 MomL 的最适反应温度和温度稳定性 | 第62页 |
| 1.13.2 EDTA 及金属离子对酶活的影响 | 第62-63页 |
| 1.14 重组 MomL 金属含量的测定 | 第63页 |
| 1.15 MomL 的定点突变 | 第63页 |
| 1.16 重组 MomL 对致病菌毒力因子分泌的影响 | 第63-64页 |
| 2 结果 | 第64-91页 |
| 2.1 QQ 活性检测方法的使用策略 | 第64-65页 |
| 2.2 耐油具柄菌 Th120 的 QQ 活性组分分析 | 第65-68页 |
| 2.3 菌株 Th120 的小分子 QS 抑制物以及胞外蛋白的初步分离纯化 | 第68-69页 |
| 2.4 菌株 Th120 胞外和胞内蛋白的胶内活性检测 | 第69-71页 |
| 2.5 菌株 Th120 的全基因组测序及其胶内活性蛋白条带的质谱检测 | 第71-73页 |
| 2.6 重组 AHL 降解酶的异源表达及其活性验证 | 第73-78页 |
| 2.7 QQ 酶的氨基酸序列分析 | 第78-82页 |
| 2.8 QQ 酶的 AHL 降解特性 | 第82-89页 |
| 2.8.1 QQ 酶 MomL 和 MomA 的降解机制 | 第82-84页 |
| 2.8.2 MomL 的酶学动力学参数测定 | 第84-85页 |
| 2.8.3 MomL 降解速率受温度、pH、EDTA 以及金属离子的影响 | 第85-87页 |
| 2.8.4 MomL 的金属含量及其活性的关系 | 第87-89页 |
| 2.9 MomL 的定点突变 | 第89-90页 |
| 2.10 体外实验评估 MomL 对致病菌毒力因子的降低能力 | 第90-91页 |
| 3 讨论 | 第91-98页 |
| 3.1 MomL 代表一类新型海洋 AHL 内酯酶 | 第91-95页 |
| 3.2 胶内 QQ 活性检测方法及结果 | 第95-96页 |
| 3.3 QQ 活性物质：微生物进化出的生存策略？ | 第96-98页 |
| 4 小结 | 第98-99页 |
| 第四章 耐油具柄菌的全基因组测序、QQ 酶同源蛋白预测及调控分析 | 第99-113页 |
| 1 材料与方法 | 第99-100页 |
| 1.1 菌株与质粒 | 第99-100页 |
| 1.2 胞外产物和细胞内含物的 AHL 降解活性的检测方法 | 第100页 |
| 1.3 菌株 Th120 基因组测序和组装 | 第100页 |
| 1.4 菌株 Th120 及其基因组注释分析 | 第100页 |
| 2 结果与讨论 | 第100-112页 |
| 2.1 菌株 Th120 基因组的一般特征及与其他代表性菌株基因组的比较 | 第100-105页 |
| 2.2 黄杆菌科细菌的 QQ 酶预测 | 第105-109页 |
| 2.3 MomL 的生理学功能及调控表达的生物信息学分析 | 第109-112页 |
| 3 小结 | 第112-113页 |
| 第五章 结论 | 第113-116页 |
| 1 全文总结 | 第113-114页 |
| 2 主要创新点 | 第114-116页 |
| 参考文献 | 第116-134页 |
| 附录 | 第134-143页 |
| 致谢 | 第143-145页 |
| 个人简历 | 第145页 |
| 已发表的学术成果 | 第145-147页 |
