| 中文摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第10-20页 |
| 1.1 乙肝病毒 | 第10-12页 |
| 1.2 非小细胞肺癌简述 | 第12-16页 |
| 1.2.1 非小细胞肺癌靶标 | 第13-14页 |
| 1.2.2 ALK抑制剂 | 第14-16页 |
| 1.3 计算机模拟在非小细胞肺癌治疗中的应用 | 第16-17页 |
| 1.4 基因表达谱数据分析 | 第17-18页 |
| 1.5 本文主要研究工作 | 第18-20页 |
| 第二章 杂芳基二氢嘧啶类抑制剂与HBV的作用机制研究 | 第20-38页 |
| 2.1 引言 | 第20-21页 |
| 2.2 材料和方法 | 第21-27页 |
| 2.2.1 数据集 | 第21-25页 |
| 2.2.2 CoMFA和CoMSIA建模 | 第25-26页 |
| 2.2.3 分子对接 | 第26页 |
| 2.2.4 MD模拟 | 第26-27页 |
| 2.2.5 结合自由能计算和分解 | 第27页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第27-37页 |
| 2.3.1 CoMFA和CoMSIA模型的分析 | 第27-30页 |
| 2.3.2 分子对接分析 | 第30-31页 |
| 2.3.3 MD模拟和结合自由能分析 | 第31-37页 |
| 2.4 结论 | 第37-38页 |
| 第三章 Brigatinib与ALK激酶的作用机理研究 | 第38-53页 |
| 3.1 研究背景 | 第38-39页 |
| 3.2 数据和方法 | 第39-40页 |
| 3.2.1 模拟系统 | 第39页 |
| 3.2.2 分子动力学研究 | 第39页 |
| 3.2.3 结合自由能计算和分解 | 第39-40页 |
| 3.3 结果与讨论 | 第40-52页 |
| 3.3.1 分子对接的验证和分析 | 第40-41页 |
| 3.3.2 模拟体系的稳定性和灵活性 | 第41-43页 |
| 3.3.3 ALK-Brigatinib作用机制的全局能量和结构分析 | 第43-45页 |
| 3.3.4 Brigatinib和Crizotinib作用与WTALK的结合模式的比较 | 第45-48页 |
| 3.3.5 突变的影响 | 第48-51页 |
| 3.3.6 改善ALK抑制剂的建议 | 第51-52页 |
| 3.4 结论 | 第52-53页 |
| 第四章 2,4-二芳基氨基嘧啶类ALK抑制剂的选择性机制研究和设计 | 第53-71页 |
| 4.1 研究背景 | 第53-54页 |
| 4.2 材料和方法 | 第54-57页 |
| 4.2.1 模拟体系 | 第54页 |
| 4.2.2 分子对接 | 第54页 |
| 4.2.3 动态平衡 | 第54-55页 |
| 4.2.4 结自由能计算和分解 | 第55页 |
| 4.2.5 3D-QSAR分析 | 第55-57页 |
| 4.3 结果与讨论 | 第57-70页 |
| 4.3.1 选择性研究 | 第57-62页 |
| 4.3.2 比较10b,11e,11q,11r,12f与ALK的结合模式 | 第62-65页 |
| 4.3.4 3D-QSAR模型的可视化 | 第65-68页 |
| 4.3.5 药物设计 | 第68-70页 |
| 4.4 结论 | 第70-71页 |
| 第五章 差异性表达谱分析非小细胞肺癌 | 第71-80页 |
| 5.1 研究背景 | 第71-72页 |
| 5.2 方法 | 第72-73页 |
| 5.2.1 数据来源与处理 | 第72页 |
| 5.2.2 GO和KEGG富集 | 第72页 |
| 5.2.3 蛋白质相互作用分析 | 第72-73页 |
| 5.3 结果 | 第73-78页 |
| 5.3.1 NSCLC基因差异性表达 | 第73-74页 |
| 5.3.2 功能富集与通道分析 | 第74-76页 |
| 5.3.3 PPI分析 | 第76-78页 |
| 5.4 讨论 | 第78-80页 |
| 第六章 总结与展望 | 第80-82页 |
| 6.1 主要内容 | 第80-81页 |
| 6.2 研究展望 | 第81-82页 |
| 参考文献 | 第82-94页 |
| 在学期间的研究成果 | 第94-95页 |
| 致谢 | 第95页 |
