| 中文摘要 | 第9-12页 |
| 第一章 土壤微生物的镉污染生理生态效应及生物修复研究进展 | 第12-44页 |
| 1.1 引言 | 第12页 |
| 1.2 重金属镉污染对土壤微生物生态多样性的影响 | 第12-22页 |
| 1.2.1 土壤重金属镉污染概况 | 第12-14页 |
| 1.2.2 土壤重金属镉污染的微生物生态效应 | 第14-21页 |
| 1.2.3 问题与展望 | 第21-22页 |
| 1.3 微生物分子生态学研究进展及其在污染环境微生物基因多样性研究中的应用 | 第22-31页 |
| 1.3.1 土壤总DNA的分离 | 第23-25页 |
| 1.3.2 样品总rDNA的PCR扩增 | 第25-26页 |
| 1.3.3 扩增产物的分析及其在污染环境微生物多样性研究中的应用 | 第26-30页 |
| 1.3.4 讨论与展望 | 第30-31页 |
| 1.4 重金属对微生物的毒性、微生物的抗性及其作用机理研究 | 第31-40页 |
| 1.4.1 重金属对微生物的毒性作用及影响因素 | 第31-33页 |
| 1.4.2 微生物对重金属的抗性及其作用机制 | 第33-39页 |
| 1.4.3 讨论与展望 | 第39-40页 |
| 1.5 微生物技术在重金属污染土壤生物修复中的应用 | 第40-44页 |
| 1.5.1 微生物对重金属的生物吸收作用 | 第40-41页 |
| 1.5.2 微生物对重金属的沉淀作用 | 第41页 |
| 1.5.3 微生物对重金属的生物转化作用 | 第41-42页 |
| 1.5.4 生物大分子与重金属的结合及其应用 | 第42页 |
| 1.5.5 基因工程技术及其展望 | 第42-44页 |
| 第二章 镉胁迫对淹水稻田土壤厌氧微生物种群影响的研究 | 第44-54页 |
| 2.1 引言 | 第44-45页 |
| 2.2 材料与方法 | 第45-47页 |
| 2.2.1 供试土壤 | 第45页 |
| 2.2.2 试验设计与实施 | 第45页 |
| 2.2.3 测定及计算方法 | 第45-47页 |
| 2.3 结果与分析 | 第47-52页 |
| 2.3.1 镉处理不同时期土壤全镉及有效镉含量的变化 | 第47-48页 |
| 2.3.2 Cd~(2+)胁迫对稻田土壤好氧微生物种群数量的影响 | 第48页 |
| 2.3.3 Cd~(2+)胁迫对稻田土壤水解发酵性细菌(AFB)种群数量的影响 | 第48-50页 |
| 2.3.4 Cd~(2+)胁迫对稻田土壤反硝化细菌(DNB)种群数量的影响 | 第50页 |
| 2.3.5 Cd~(2+)胁迫对稻田土壤产氢产乙酸细菌(HPAB)种群数量的影响 | 第50-51页 |
| 2.3.6 Cd~(2+)胁迫对稻田土壤产甲烷细菌种群数量的影响 | 第51页 |
| 2.3.7 Cd~(2+)胁迫对稻田土壤厌氧固氮细菌种群数量的影响 | 第51-52页 |
| 2.3.8 Cd~(2+)胁迫下各微生物种群的综合因子分析 | 第52页 |
| 2.4 结论 | 第52-54页 |
| 第三章 镉胁迫对淹水稻田土壤生物活性与酶活性影响的研究 | 第54-64页 |
| 3.1 引言 | 第54页 |
| 3.2 材料与方法 | 第54-57页 |
| 3.2.1 供试土壤 | 第54-55页 |
| 3.2.2 试验设计与实施 | 第55页 |
| 3.2.3 土壤生物活性测定方法 | 第55页 |
| 3.2.4 土壤酶活性测定方法 | 第55-57页 |
| 3.2.5 数据分析 | 第57页 |
| 3.3 结果与分析 | 第57-62页 |
| 3.3.1 Cd~(2+)胁迫对土壤呼吸强度的影响 | 第57-58页 |
| 3.3.2 Cd~(2+)胁迫对土壤反硝化活性的影响 | 第58页 |
| 3.3.3 Cd~(2+)胁迫对土壤硫酸盐还原活性(SRA)的影响 | 第58页 |
| 3.3.4 Cd~(2+)胁迫对土壤产甲烷活性的影响 | 第58-59页 |
| 3.3.5 Cd~(2+)胁迫对土壤过氧化氢酶活性的影响 | 第59-60页 |
| 3.3.6 Cd~(2+)胁迫对土壤脲酶活性的影响 | 第60页 |
| 3.3.7 Cd~(2+)胁迫对土壤转化酶活性的影响 | 第60-61页 |
| 3.3.8 Cd~(2+)胁迫对土壤磷酸酶活性的影响 | 第61页 |
| 3.3.9 Cd~(2+)胁迫下各微生物种群的综合因子分析 | 第61-62页 |
| 3.4 结论 | 第62-64页 |
| 第四章 镉胁迫稻田土壤微生物基因多样性的DGGE分子指纹分析 | 第64-82页 |
| 4.1 引言 | 第64页 |
| 4.2 材料与方法 | 第64-68页 |
| 4.2.1 供试土壤 | 第64页 |
| 4.2.2 试验设计与实施 | 第64-65页 |
| 4.2.3 土壤总DNA的提取 | 第65-66页 |
| 4.2.4 PCR扩增 | 第66-67页 |
| 4.2.5 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第67页 |
| 4.2.6 染色 | 第67页 |
| 4.2.7 指纹图谱生物信息学分析 | 第67页 |
| 4.2.8 特异性微生物的回收、测序与序列比对 | 第67-68页 |
| 4.3 结果与分析 | 第68-80页 |
| 4.3.1 不经过培养土壤微生物总DNA的提取与纯化 | 第68页 |
| 4.3.2 从总DNA中扩增16S rDNA片段 | 第68-69页 |
| 4.3.3 镉胁迫下稻田土壤总DNA的DGGE指纹图谱分析 | 第69-79页 |
| 4.3.3.1 镉处理第1周稻田土壤总DNA的DGGE分析 | 第69页 |
| 4.3.3.2 镉处理第2周稻田土壤总DNA的DGGE分析 | 第69-71页 |
| 4.3.3.3 镉处理第3周稻田土壤总DNA的DGGE分析 | 第71-74页 |
| 4.3.3.4 镉处理第4周稻田土壤总DNA的DGGE分析 | 第74-76页 |
| 4.3.3.5 镉处理第8周稻田土壤总DNA的DGGE分析 | 第76页 |
| 4.3.3.6 镉处理第12周稻田土壤总DNA的DGGE分析 | 第76-79页 |
| 4.3.4 特征性微生物的测序与序列比对 | 第79-80页 |
| 4.4 结论 | 第80-82页 |
| 第五章 重金属对稻田土壤典型微生物种的生理毒性研究 | 第82-96页 |
| 5.1 引言 | 第82-83页 |
| 5.2 材料与方法 | 第83-85页 |
| 5.2.1 供试菌种 | 第83页 |
| 5.2.2 仪器与试剂 | 第83页 |
| 5.2.3 培养基 | 第83页 |
| 5.2.4 试验实施及研究方法: | 第83-85页 |
| 5.2.5 数据处理 | 第85页 |
| 5.3 结果与分析 | 第85-94页 |
| 5.3.1 Cd~(2+)对土壤典型微生物纯培养物的影响 | 第85-86页 |
| 5.3.2 Cd~(2+)对土壤功能性微生物生物活性的影响 | 第86-88页 |
| 5.3.3 Cd~(2+)镉对土壤典型微生物细胞内含物含量的影响 | 第88-89页 |
| 5.3.4 微生物对Cd~(2+)胁迫的应激反应 | 第89-94页 |
| 5.5 结论 | 第94-96页 |
| 第六章 重金属镉抗性菌株的筛选、鉴定及抗性研究 | 第96-106页 |
| 6.1 引言 | 第96页 |
| 6.2 试验材料 | 第96-97页 |
| 6.2.1 分离源 | 第96页 |
| 6.2.2 试剂 | 第96页 |
| 6.2.3 主要仪器 | 第96-97页 |
| 6.2.4 主要培养基 | 第97页 |
| 6.3 试验方法 | 第97-99页 |
| 6.3.1 抗镉微生物的富集筛选与分离纯化 | 第97页 |
| 6.3.2 分离菌株的形态学研究 | 第97-99页 |
| 6.4 结果与分析 | 第99-105页 |
| 6.4.1 分离菌株的细胞形态学 | 第99-100页 |
| 6.4.2 分离菌株生理鉴定 | 第100-101页 |
| 6.4.3 分离菌株的G+Cmol％含量 | 第101页 |
| 6.4.4 分离菌株的16S rDNA序列测定与分析 | 第101-102页 |
| 6.4.5 16S rDNA的序列测定与系统发育分析 | 第102-103页 |
| 6.4.6 DKC1菌株对Zn~(2+)及其它重金属离子的抗性 | 第103-104页 |
| 6.4.7 加镉前后DKC1菌株细胞形态变化 | 第104-105页 |
| 6.5 结论 | 第105-106页 |
| 第七章 Ralstonia eutropha菌株镉抗性czcC基因的克隆与表达 | 第106-124页 |
| 7.1 引言 | 第106页 |
| 7.2 克隆策略 | 第106页 |
| 7.3 表达策略 | 第106页 |
| 7.4 试验材料 | 第106-111页 |
| 7.4.1 菌株 | 第106页 |
| 7.4.2 克隆宿主菌 | 第106-109页 |
| 7.4.3 PCR试剂盒 | 第109页 |
| 7.4.4 连接试剂盒 | 第109页 |
| 7.4.5 T4 DNA连接酶、限制性内切酶 | 第109页 |
| 7.4.6 其它常规试剂 | 第109页 |
| 7.4.7 标准蛋白MARKER | 第109页 |
| 7.4.8 引物设计及合成 | 第109页 |
| 7.4.9 培养基及主要化学试剂的配制 | 第109-111页 |
| 7.5 试验方法 | 第111-118页 |
| 7.5.1 质粒DNA的提取 | 第111-112页 |
| 7.5.2 质粒消除 | 第112页 |
| 7.5.3 PCR扩增 | 第112-113页 |
| 7.5.4 DNA电泳 | 第113页 |
| 7.5.5 PCR产物回收 | 第113-114页 |
| 7.5.6 连接 | 第114页 |
| 7.5.7 DNA限制性酶切 | 第114页 |
| 7.5.8 感受态细胞的制备 | 第114-115页 |
| 7.5.9 转化 | 第115页 |
| 7.5.10 重组质粒的提取与酶切鉴定 | 第115-116页 |
| 7.5.11 核酸序列的测定和分析 | 第116页 |
| 7.5.12 表达载体pET-30a(+)Vector的双酶切 | 第116页 |
| 7.5.13 连接 | 第116-117页 |
| 7.5.14 感受态细胞的制备、转化 | 第117页 |
| 7.5.15 重组质粒的鉴定 | 第117页 |
| 7.5.16 重组菌株的SDS-PAGE电泳检测 | 第117-118页 |
| 7.6 结果与讨论 | 第118-121页 |
| 7.6.1 DKC1菌株的质粒检测 | 第118页 |
| 7.6.2 目的基因的PCR扩增结果 | 第118-119页 |
| 7.6.3 基因克隆 | 第119页 |
| 7.6.4 序列测定 | 第119-121页 |
| 7.6.5 重组菌株的全细胞蛋白电泳检测 | 第121页 |
| 7.7 结论 | 第121-122页 |
| 附一 pGEM-T Easy Vector | 第122-123页 |
| 附二 pET-30a(+) Vector | 第123-124页 |
| 第八章 研究结论及展望 | 第124-128页 |
| 8.1 全文主要研究结论 | 第124-126页 |
| 8.2 展望 | 第126-128页 |
| ABSTRACT | 第128页 |
| 参考文献 | 第132-142页 |
| 博士研究生期间论文发表及获奖情况 | 第142页 |
