| 摘要 | 第8-9页 |
| ABSTRACT | 第9页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-44页 |
| 第一节 哺乳动物黑色素沉积机理及其调控基因 | 第10-28页 |
| 1 哺乳动物黑色素沉积的生理机制 | 第10-12页 |
| 1.1 黑色素的概念与分类 | 第10页 |
| 1.2 黑色素的形成机理 | 第10-12页 |
| 1.3 黑色素的作用与功能 | 第12页 |
| 2 哺乳动物黑色素合成相关的基因或位点 | 第12-22页 |
| 2.1 黑色素细胞发育相关的基因与位点 | 第13-15页 |
| 2.2 黑素体蛋白 | 第15-17页 |
| 2.3 黑素体迁移相关蛋白位点 | 第17-18页 |
| 2.4 信号蛋白与转录因子基因与位点 | 第18-22页 |
| 3 MC1R基因的研究进展 | 第22-28页 |
| 3.1 MC1R对黑色素生成的调控机制-cAMP信号通路是调节真黑色素形成的关键通路 | 第22-23页 |
| 3.2 MC1R是POMC肽α-MSH与ACTH对真黑色素生成影响所必需的 | 第23-24页 |
| 3.3 MC1R是agouti蛋白对黑色素生成所必需的 | 第24-25页 |
| 3.4 MC1R基因的多态 | 第25-27页 |
| 3.5 鸟类中的关于MC1R的研究 | 第27-28页 |
| 3.6 结语 | 第28页 |
| 第二节 单核苷酸多态性的研究及其应用 | 第28-40页 |
| 1 SNP的基本概念与特点 | 第29-31页 |
| 1.1 SNP的基本概念 | 第29页 |
| 1.2 SNP的特点与优点 | 第29-31页 |
| 2 SNP的检测与分析技术 | 第31-38页 |
| 2.1 基于生物信息学的方法 | 第31-32页 |
| 2.2 基于荧光共振能量传递(FRET)的检测方法 | 第32页 |
| 2.3 基于分子杂交技术的检测方法 | 第32-34页 |
| 2.4 基于DNA构象的方法 | 第34-36页 |
| 2.5 基于PCR或酶切的方法 | 第36-37页 |
| 2.6 直接测序的方法 | 第37-38页 |
| 2.7 毛细管电泳(capillary electrophoresis，CE)技术 | 第38页 |
| 3 存在的问题 | 第38-39页 |
| 4 SNP的应用及前景 | 第39-40页 |
| 4.1 高密度遗传连锁图谱的构建 | 第39页 |
| 4.2 SNP在基因研究和药物设计中的应用 | 第39-40页 |
| 第三节 RH PANEL的研究概况 | 第40-44页 |
| 1 RH的原理 | 第40页 |
| 2 RH的发展 | 第40-41页 |
| 3 RH的使用过程 | 第41页 |
| 4 现有的RH panels及RH图 | 第41-42页 |
| 5 RH的应用 | 第42-43页 |
| 5.1 EST定位 | 第42页 |
| 5.2 基因组作图 | 第42页 |
| 5.3 测定距离RH图 | 第42-43页 |
| 5.4 比较基因组作图 | 第43页 |
| 5.5 寻找新基因 | 第43页 |
| 6 RH的优缺点 | 第43-44页 |
| 第二章 鸡MC1R基因的突变与黑色素性状关系的分析 | 第44-80页 |
| 第一节 材料与方法 | 第44-57页 |
| 1 实验材料 | 第44-47页 |
| 1.1 实验动物 | 第44-45页 |
| 1.2 菌株和克隆载体 | 第45页 |
| 1.3 药品和酶 | 第45-46页 |
| 1.4 主要仪器 | 第46-47页 |
| 1.5 引物的设计与合成 | 第47页 |
| 1.6 统计分析 | 第47页 |
| 1.7 蛋白结构预测网站 | 第47页 |
| 1.8 5’-非编码区调控元件预测网站 | 第47页 |
| 1.9 分析软件 | 第47页 |
| 2 实验方法与步骤 | 第47-57页 |
| 2.1 缓冲液与常用试剂配制 | 第47-48页 |
| 2.2 鸡血液基因组DNA的提取 | 第48-49页 |
| 2.3 PCR-SSCP过程 | 第49-51页 |
| 2.4 PCR-RFLP过程 | 第51页 |
| 2.5 利用玻璃奶洗脱法回收PCR产物 | 第51-52页 |
| 2.6 连接反应 | 第52页 |
| 2.7 感受态细胞的制备 | 第52-53页 |
| 2.8 转化 | 第53-54页 |
| 2.9 质粒DNA的小规模提取--碱裂解法 | 第54页 |
| 2.10 质粒DNA的大量制备 | 第54-55页 |
| 2.11 筛选重组质粒 | 第55页 |
| 2.12 制备测序模板 | 第55-56页 |
| 2.13 阳性克隆测序 | 第56-57页 |
| 第二节 结果与分析 | 第57-75页 |
| 1 鸡MC1R基因编码区的突变与黑色素性状的关系 | 第57-69页 |
| 1.1 PCR扩增的结果 | 第57-58页 |
| 1.2 PCR-SSCP分析结果 | 第58页 |
| 1.3 测序及分析 | 第58-68页 |
| 1.4 SNPs与黑色素性状的关系 | 第68-69页 |
| 2 鸡MC1R基因非编码区的突变与黑色素性状的关系 | 第69-75页 |
| 2.1 PCR扩增的结果 | 第70页 |
| 2.2 PCR-SSCP分析结果 | 第70页 |
| 2.3 测序结果与分析 | 第70-73页 |
| 2.4 PCR-RFLP的分析结果 | 第73-74页 |
| 2.5 SNPs与黑色素性状的关系 | 第74-75页 |
| 第三节 小结与讨论 | 第75-80页 |
| 1 小节 | 第75-76页 |
| 1.1 MC1R编码区的突变与黑色素性状的关系 | 第75-76页 |
| 1.2 MC1R 5’非编码区的突变与黑色素性状的关系 | 第76页 |
| 1.3 MC1R基因与鸡黑色素性状的关系 | 第76页 |
| 2 讨论 | 第76-80页 |
| 2.1 关于黑色素表型的分析 | 第76-77页 |
| 2.2 关于各MC1R基因型分布与肤色的关系 | 第77页 |
| 2.3 编码区氨基酸突变对MC1R蛋白的影响 | 第77-78页 |
| 2.4 关于5’-非编码区中调控元件的变化 | 第78页 |
| 2.5 关于亲本群体中MC1R基因型的分布 | 第78-79页 |
| 2.6 关于鸡的资源家系 | 第79-80页 |
| 第三章 鸡MC1R基因在染色体上的精细定位 | 第80-84页 |
| 第一节 材料与方法 | 第80-81页 |
| 1 ChickRH6平板 | 第80页 |
| 2 PCR反应 | 第80-81页 |
| 2.1 引物的选用 | 第80-81页 |
| 2.2 PCR反应体系 | 第81页 |
| 2.3 PCR反应条件 | 第81页 |
| 第二节 结果与分析 | 第81-82页 |
| 1 连锁分析的结果 | 第81-82页 |
| 2 染色体定位结果 | 第82页 |
| 第三节 小结与讨论 | 第82-84页 |
| 1 小结 | 第82-83页 |
| 2 讨论 | 第83-84页 |
| 2.1 鸡MC1R基因在染色体上位置 | 第83页 |
| 2.2 MC1R基因在鸡、人等脊椎动物中位置的高度同源性 | 第83-84页 |
| 第五章 结论 | 第84-86页 |
| 参考文献: | 第86-97页 |
| 致谢 | 第97-98页 |
| 附录 | 第98-110页 |
| 附录1: Primer2扩增放射杂交平板chick RH6杂交系的结果统计 | 第98-99页 |
| 附录2: 资源家系鸡F_2代群体中MC1R基因引物3扩增片段的基因型结果 | 第99-103页 |
| 附录3: 资源家系鸡F_2代群体中MC1R基因引物5扩增片段的基因型结果 | 第103-107页 |
| 附录4: 资源家系鸡F_2代群体中MC1R基因引物52扩增片段的基因型结果 | 第107-110页 |
