| 目录 | 第2-3页 |
| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 绪论 | 第6-15页 |
| 1.1 碳纳米管以及蛋白质基础知识 | 第6-12页 |
| 1.1.1 碳纳米管 | 第6-8页 |
| 1.1.2 碳纳米管的可溶性修饰 | 第8-10页 |
| 1.1.3 蛋白质 | 第10-12页 |
| 1.2 碳纳米管与蛋白质相互作用 | 第12-14页 |
| 1.3 本论文研究目的意义以及论文内容安排 | 第14-15页 |
| 第二章 分子动力学及Gromacs模拟软件 | 第15-27页 |
| 2.1 分子动力学模拟简介 | 第15页 |
| 2.2 分子动力学模拟原理 | 第15-19页 |
| 2.3 分子动力学模拟相关概念 | 第19-23页 |
| 2.3.1 力场 | 第19页 |
| 2.3.2 能量最小化 | 第19-20页 |
| 2.3.3 周期性边界条件 | 第20-21页 |
| 2.3.4 不同系综的分子动力学处理 | 第21-23页 |
| 2.4 Gromacs模拟软件介绍 | 第23-27页 |
| 2.4.1 Gromacs简介 | 第23-24页 |
| 2.4.2 Gromacs相关文件及工作流程 | 第24-27页 |
| 第三章 f-SWCNT与YAP65WW domain相互作用的研究 | 第27-47页 |
| 3.1 引言 | 第27-29页 |
| 3.2 模拟系统构建与模拟参数设置 | 第29-32页 |
| 3.3 f-SWCNT水溶性分析 | 第32-34页 |
| 3.4 f-SWCNT与YAP65WW domain相互作用的模拟结果 | 第34-35页 |
| 3.5 f-SWCNT与YAP65WW domain结合过程分析 | 第35-38页 |
| 3.6 f-SWCNT与YAP65WW domain之间氢键分析 | 第38-44页 |
| 3.7 f-SWCNT、配体与YAP65WW domain三者相互作用 | 第44-46页 |
| 3.8 本章小结 | 第46-47页 |
| 第四章 全文总结 | 第47-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 攻读硕士期间发表学术论文 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
