| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-9页 |
| 第一章 前言 | 第13-20页 |
| 1.1 放线菌 | 第13-15页 |
| 1.1.1 放线菌概述 | 第13-14页 |
| 1.1.2 海洋放线菌研究现状及意义 | 第14-15页 |
| 1.2 微生物多样性研究方法 | 第15-16页 |
| 1.2.1 16S rDNA 克隆文库多样性方法 | 第15页 |
| 1.2.2 RFLP 技术 | 第15-16页 |
| 1.2.3 其他多样性分析方法 | 第16页 |
| 1.3 放线菌分类学研究 | 第16-17页 |
| 1.3.1 放线菌分类学进展及经典分类学法 | 第16-17页 |
| 1.3.2 现代分类学方法 | 第17页 |
| 1.4 南海放线菌研究现状 | 第17-18页 |
| 1.4.1 南海概况 | 第17-18页 |
| 1.4.2 南海微生物多样性研究概况 | 第18页 |
| 1.5 新种的多相分类鉴定方法 | 第18-19页 |
| 1.6 本论文研究的目的及意义 | 第19-20页 |
| 第二章 16S rDNA 文库技术分析南海放线菌多样性 | 第20-38页 |
| 2.1 实验材料 | 第20-22页 |
| 2.1.1 样品 | 第20页 |
| 2.1.2 主要试剂和仪器 | 第20-22页 |
| 2.2 实验方法 | 第22-28页 |
| 2.2.1 土壤 DNA 的提取及纯化 | 第22-23页 |
| 2.2.2 放线菌特异性引物扩增及纯化 | 第23-25页 |
| 2.2.3 16S rDNA 序列的克隆及测序 | 第25-27页 |
| 2.2.4 构建 16S rDNA 文库及系统发育和多样性分析 | 第27-28页 |
| 2.3 结果与讨论 | 第28-36页 |
| 2.3.1 土壤宏基因组 DNA 的提取、纯化 | 第28-29页 |
| 2.3.2 纯化 DNA 特异性引物扩增 | 第29页 |
| 2.3.3 放线菌 16S rDNA 基因克隆文库的构建及测序 | 第29-30页 |
| 2.3.4 多样性指数分析 | 第30-31页 |
| 2.3.5 16S rDNA 基因文库多样性分析 | 第31-34页 |
| 2.3.6 构建系统发育进化树树 | 第34-36页 |
| 2.4 本章小结 | 第36-38页 |
| 第三章 南海海洋沉积物放线菌可培养多样性研究 | 第38-52页 |
| 3.1 实验材料 | 第38-41页 |
| 3.1.1 样品 | 第38-39页 |
| 3.1.2 主要试剂和仪器 | 第39-41页 |
| 3.2 实验方法 | 第41-45页 |
| 3.2.1 放线菌分离培养 | 第41页 |
| 3.2.2 放线菌的纯化及保藏 | 第41-42页 |
| 3.2.3 放线菌菌株基因组 DNA 提取 | 第42页 |
| 3.2.4 放线菌菌株 16S rDNA 的基因扩增 | 第42-43页 |
| 3.2.5 PCR 产物质粒的提取 | 第43-44页 |
| 3.2.6 质粒的酶切验证及测序 | 第44-45页 |
| 3.3 结果与分析 | 第45-50页 |
| 3.3.1 南海放线菌菌株的分离及纯化 | 第45-46页 |
| 3.3.2 南海放线菌菌株基因组 DNA 的提取 | 第46页 |
| 3.3.3 南海放线菌菌株 16S rDNA 的基因扩增 | 第46-47页 |
| 3.3.4 南海放线菌株多样性分析 | 第47-49页 |
| 3.3.5 构建 16S rDNA 系统发育树及分析 | 第49-50页 |
| 3.4 本章小结 | 第50-52页 |
| 第四章 南海一株放线菌新种的分类鉴定 | 第52-70页 |
| 4.1 实验材料 | 第52-54页 |
| 4.1.1 样品 | 第52页 |
| 4.1.2 主要试剂和仪器 | 第52-53页 |
| 4.1.3 培养基 | 第53-54页 |
| 4.2 实验方法 | 第54-60页 |
| 4.2.1 16S rDNA 的扩增和分析 | 第54-55页 |
| 4.2.2 电镜和保藏号 | 第55页 |
| 4.2.3 (G+C)mol%含量测定及 DNA 杂交 | 第55页 |
| 4.2.4 菌株培养特征测定 | 第55-56页 |
| 4.2.5 碳源优化实验 | 第56页 |
| 4.2.6 生理生化实验的测定 | 第56-58页 |
| 4.2.7 菌株细胞化学组分的分析 | 第58-60页 |
| 4.3 结果与分析 | 第60-69页 |
| 4.3.1 OAct400 基因组 DNA 提取及 16S rDNA 的扩增 | 第60页 |
| 4.3.2 16S rDNA 序列比对选取模式菌株 | 第60-61页 |
| 4.3.3 电镜形态观察和保藏号收录 | 第61-62页 |
| 4.3.4 新种(G+C)mol%含量测定及 DNA-DNA 杂交结果及讨论 | 第62页 |
| 4.3.5 菌株培养特征测定 | 第62-63页 |
| 4.3.6 碳源利用实验结果 | 第63页 |
| 4.3.7 生理生化实验的测定结果 | 第63-66页 |
| 4.3.8 菌株细胞化学组分的分析结果 | 第66-69页 |
| 4.4 本章小结 | 第69-70页 |
| 论文总结 | 第70-72页 |
| 研究展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 个人简历 | 第77页 |
| 相关的学术论文 | 第77-78页 |
