LncRNA中结合二级结构的多特征mRNA识别
摘要 | 第4-6页 |
Abstract | 第6-7页 |
第1章 绪论 | 第10-13页 |
1.1 生物信息学 | 第10-11页 |
1.2 lnc RNA的国内外研究现状及背景 | 第11页 |
1.3 本课题的研究意义和论文的结构安排 | 第11-13页 |
第2章 RNA生物知识 | 第13-24页 |
2.1 RNA分子组成及结构 | 第13-16页 |
2.1.1 分子组成 | 第13-14页 |
2.1.2 一级结构 | 第14-15页 |
2.1.3 二级结构 | 第15-16页 |
2.2 lnc RNA知识介绍 | 第16-21页 |
2.2.1 定义 | 第16页 |
2.2.2 分类 | 第16-19页 |
2.2.3 特征 | 第19-20页 |
2.2.4 作用机制 | 第20-21页 |
2.3 mRNA相关知识介绍 | 第21-24页 |
2.3.1 mRNA的发现 | 第21-22页 |
2.3.2 mRNA结构特点 | 第22-23页 |
2.3.3 mRNA二级结构功能 | 第23-24页 |
第3章 RNA二级结构预测 | 第24-32页 |
3.1 二级结构预测的研究现状 | 第24页 |
3.2 动态规划法 | 第24-27页 |
3.2.1 热力学最小自由能法 | 第25-26页 |
3.2.2 碱基最大配对法 | 第26-27页 |
3.3 比较序列分析 | 第27-29页 |
3.3.1 随机上下文无关语法模型 | 第27-28页 |
3.3.2 共变模型 | 第28-29页 |
3.4 组合优化法 | 第29-30页 |
3.4.1 最大权重匹配 | 第29页 |
3.4.2 螺旋区堆积法 | 第29-30页 |
3.5 常见的预测软件对比 | 第30-32页 |
第4章 LNCRNA中MRNA的识别研究 | 第32-46页 |
4.1 研究相关RNA的数据库资源及收集 | 第32-34页 |
4.2 特征分析 | 第34-36页 |
4.3 模型构建 | 第36-37页 |
4.4 验证方法 | 第37页 |
4.5 实验结果与分析 | 第37-46页 |
4.5.1 五折交叉验证法 | 第37-41页 |
4.5.2 mRNA数据集验证法 | 第41-46页 |
第5章 总结和展望 | 第46-47页 |
致谢 | 第47-48页 |
参考文献 | 第48-52页 |
作者简介及在学期间所取得的科研成果 | 第52页 |