温度对微环DNA拓扑结构的影响及DNA表面凝聚机制研究
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第一章 绪论 | 第7-13页 |
| 1.1 引言 | 第7-9页 |
| 1.2 环状DNA分子拓扑结构的研究背景及现状 | 第9-10页 |
| 1.3 DNA表面凝聚的研究背景 | 第10-11页 |
| 1.4 本文的研究目的与研究内容 | 第11页 |
| 1.4.1 研究目的 | 第11页 |
| 1.4.2 研究内容 | 第11页 |
| 1.5 本文创新点 | 第11-13页 |
| 第二章 基本算法与环状DNA拓扑结构 | 第13-20页 |
| 2.1 蒙特卡洛模拟基本原理 | 第13-17页 |
| 2.1.1 微观状态的概率 | 第13页 |
| 2.1.2 重要性采样 | 第13-14页 |
| 2.1.3 细致平衡原理 | 第14-15页 |
| 2.1.4 Metropolis判据 | 第15页 |
| 2.1.5 随机数的产生 | 第15-16页 |
| 2.1.6 蒙特卡罗模拟的一般步骤 | 第16-17页 |
| 2.2 环状DNA的拓扑结构 | 第17-20页 |
| 2.2.1 连接数 | 第17-18页 |
| 2.2.2 扭转数 | 第18页 |
| 2.2.3 环绕数 | 第18-20页 |
| 第三章 温度对环状DNA拓扑结构的影响 | 第20-30页 |
| 3.1 引言 | 第20-21页 |
| 3.2 蠕虫链模型 | 第21-22页 |
| 3.3 基于DNA蠕虫链模型计算方法 | 第22-23页 |
| 3.4 基于蠕虫链模型连接数分布计算方法 | 第23-24页 |
| 3.5 结果 | 第24-29页 |
| 3.5.1 温度对环绕数分布的影响 | 第24页 |
| 3.5.2 温度对微环DNA连接数分布的影响 | 第24-25页 |
| 3.5.3 扭转数方差、环绕数方差以及连接数方差 | 第25-26页 |
| 3.5.4 环绕数方差与长度的关系 | 第26-27页 |
| 3.5.5 连接数方差与长度的关系 | 第27-29页 |
| 3.6 本章小结 | 第29-30页 |
| 第四章 环状DNA蠕虫链模型与蠕虫棒模型比较研究 | 第30-42页 |
| 4.1 引言 | 第30-32页 |
| 4.2 蠕虫棒模型 | 第32-34页 |
| 4.3 基于蠕虫棒模型模拟计算方法 | 第34-35页 |
| 4.4 结果 | 第35-41页 |
| 4.4.1 基于蠕虫棒模型环绕数分布特征 | 第35-38页 |
| 4.4.2 扭转刚度对环绕数分布的影响 | 第38-39页 |
| 4.4.3 环绕数分布对比 | 第39-41页 |
| 4.5 本章小结与讨论 | 第41-42页 |
| 第五章 DNA表面凝聚机制研究 | 第42-53页 |
| 5.1 引言 | 第42-44页 |
| 5.2 DNA表面凝聚模型 | 第44-45页 |
| 5.3 DNA表面凝聚计算方法 | 第45-46页 |
| 5.4 结果 | 第46-52页 |
| 5.4.1 DNA表面凝聚的基本特征 | 第46-48页 |
| 5.4.2 DNA表面临界吸附及有效作用距离 | 第48-51页 |
| 5.4.3 DNA临界吸附半径 | 第51-52页 |
| 5.5 本章小结 | 第52-53页 |
| 第六章 展望 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-59页 |
| 附录 | 第59-60页 |
