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赤霉素促进梨果实库强的转录组学和蛋白质组学研究

摘要第6-10页
ABSTRACT第10-14页
缩略词第20-23页
第一章 绪论第23-38页
    1.1 GA与果实发育研究进展第23-24页
        1.1.1 GA的作用机制研究现状第23页
        1.1.2 GA信号转导途径主要的功能分子第23-24页
        1.1.3 GA信号转导途径研究进展第24页
    1.2 GA与果实库强形成密切相关第24-30页
        1.2.1 库强决定同化物向果实的分配第24-26页
        1.2.2 GA与同化物分配第26-27页
        1.2.3 GA与源强第27-28页
        1.2.4 GA与韧皮部的装载和卸载第28-30页
    1.3 GA对库容调控的研究进展第30-31页
        1.3.1 GA对细胞分裂影响的研究进展第30页
        1.3.2 GA对细胞膨大影响的研究进展第30-31页
    1.4 GA处理对库活力影响的研究进展第31-33页
        1.4.1 GA与输导组织第31页
        1.4.2 GA与糖代谢第31-33页
        1.4.3 GA与糖载体第33页
        1.4.4 GA与质子泵第33页
    1.5 GA在果树生产中的应用第33-34页
    1.6 研究内容和技术路线第34-37页
        1.6.1 砂梨转录组DE NOVO拼接分析第34-35页
        1.6.2 GA促进梨果实库强的基因表达谱分析第35-36页
        1.6.3 GA促进梨果实库强的比较蛋白质组学研究第36页
        1.6.4 GA应答基因PPFW2.2 基因克隆及遗传转化第36页
        1.6.5 GA对梨果实发育及品质的影响第36-37页
    1.7 本研究的目的与意义第37页
    1.8 本章小结第37-38页
第二章 砂梨果实转录组的DE NOVO组装和功能注释第38-59页
    2.1 材料与方法第38-41页
        2.1.1 试验材料第38-39页
        2.1.2 主要仪器与试剂第39页
        2.1.3 试验方法第39-41页
    2.2 结果与分析第41-57页
        2.2.1 RNA质量检测结果第41-42页
        2.2.2 砂梨转录组DE NOVO组装第42-44页
        2.2.3 UNIGENES序列的同源性分析第44-46页
        2.2.4 UNIGENES序列的GO功能分类第46-48页
        2.2.5 UNIGENES序列的COG功能分类第48-49页
        2.2.6 UNIGENES序列的KEGG功能分类第49-50页
        2.2.7 SNP和SSR预测第50-51页
        2.2.8 预测UNIGENES开放阅读框第51页
        2.2.9 植物激素信号转导通路基因第51-55页
        2.2.10 光合同化物跨膜转运基因第55-57页
    2.3 讨论第57-58页
    2.4 本章小结第58-59页
第三章 GA增强砂梨果实库强的数字基因表达谱分析第59-94页
    3.1 材料与方法第59-62页
        3.1.1 试验材料第59-60页
        3.1.2 主要仪器与设备第60页
        3.1.3 主要试验药品与试剂第60页
        3.1.4 试验方法第60-62页
    3.2 结果与分析第62-87页
        3.2.1 RNA提取质量检测第62页
        3.2.2 RNA-SEQ测序数据与质量评估第62-63页
        3.2.3 不同发育阶段高丰度表达基因分析第63-66页
        3.2.4 不同发育时期GA响应DEGS分析第66-74页
        3.2.5 DEGS的层次聚类(HIERARCHICALCLUSTERING,HCL)第74-76页
        3.2.6 DEGS的GO功能富集分析第76-78页
        3.2.7 差异基因GO功能显著性富集可视化分析第78-80页
        3.2.8 差异表达基因KEGG PATHWAY显著性富集分析第80-83页
        3.2.9 差异表达基因MAPMAN分析第83-86页
        3.2.10 QRT-PCR验证第86-87页
    3.3 讨论第87-93页
        3.3.1 代谢相关的DEGS第87-89页
        3.3.2 转运相关的DEGS第89-91页
        3.3.3 外源GA处理后和植物激素合成、代谢和信号转导相关的差异基因第91-92页
        3.3.4 GA处理调控了细胞形态增加了库容第92页
        3.3.5 GA在调控源库关系中的角色第92-93页
    3.4 本章小结第93-94页
第四章 GA增强砂梨果实库强的比较蛋白质组研究第94-119页
    4.1 材料与方法第95-98页
        4.1.1 试验材料第95页
        4.1.2 主要试剂与仪器第95页
        4.1.3 研究的技术路线第95-96页
        4.1.4 试验方法第96-98页
    4.2 结果与分析第98-114页
        4.2.1 砂梨蛋白质提取的BRADFORD定量结果第98-99页
        4.2.2 差异蛋白质点检测第99-100页
        4.2.3 差异蛋白点单因素方差分析第100-102页
        4.2.4 差异蛋白点的质谱鉴定第102-107页
        4.2.5 差异蛋白分层聚类分析第107-109页
        4.2.6 差异蛋白功能富集分析第109-113页
        4.2.7 差异蛋白质的QRT-PCR验证第113-114页
    4.3 讨论第114-118页
        4.3.1 物质与能量代谢相关的蛋白第114-115页
        4.3.2 逆境防御相关的蛋白第115页
        4.3.3 信号转导和转录后修饰相关的蛋白第115-116页
        4.3.4 GA处理增加果实库容第116页
        4.3.5 GA处理增强果实库活力第116-118页
    4.4 本章小结第118-119页
第五章 GA应答基因PPFW2.2 基因克隆及亚细胞定位第119-130页
    5.1 材料与方法第119-121页
        5.1.1 试验材料第119页
        5.1.2 主要仪器与试剂第119-120页
        5.1.3 PPFW2.2 相关引物设计与PCR扩增第120页
        5.1.4 植物表达载体的构建第120-121页
        5.1.5 亚细胞定位第121页
        5.1.6 梨PPFW2.2 基因生物信息学分析第121页
        5.1.7 同源性与系统发育分析第121页
        5.1.8 梨PPFW2.2 的QRT-PCR的表达检测第121页
    5.2 结果与分析第121-128页
        5.2.1 PPFW2.2 基因全长序列的克隆第121-122页
        5.2.2 PPFW2.2 的生物信息学分析第122-123页
        5.2.3 PHB-PPFW2.2 转化烟草和梨果实第123-124页
        5.2.4 FW2.2 家族是一个高度保守的基因家族第124-126页
        5.2.5 PPFW2.2 响应GA处理的QRT-PCR检测第126-128页
    5.3 讨论第128-129页
        5.3.1 GA可能通过调控PPFW2.2 调控细胞分裂第128页
        5.3.2 细胞分裂和细胞膨大对库容可能存在不同调控机制第128-129页
    5.4 小结第129-130页
第六章 GA对砂梨果实品质和糖代谢关键酶 基因表达影响的研究第130-141页
    6.1 材料与方法第130-133页
        6.1.1 试验材料第130-131页
        6.1.2 主要仪器与试剂第131页
        6.1.3 试验方法第131-133页
    6.2 结果与分析第133-139页
        6.2.1 GA对梨果实质量的影响第133页
        6.2.2 GA对果实可溶性糖含量的影响第133-136页
        6.2.3 GA对山梨糖醇代谢关键酶转录水平表达的影响第136页
        6.2.4 GA对蔗糖代谢关键酶转录水平表达的影响第136-138页
        6.2.5 GA对细胞形态的影响第138-139页
    6.3 讨论第139-140页
    6.4 本章小结第140-141页
第七章 结论与展望第141-148页
    7.1 GA增强砂梨果实库强的转录组和蛋白质组学综合分析第141-144页
        7.1.1 GA处理对库容的影响第142-143页
        7.1.2 GA对库活力的影响第143页
        7.1.3 转录水平和蛋白水平表达上的相关关系第143-144页
    7.2 主要结论第144-146页
        7.2.1 GA处理对果实品质的影响第144页
        7.2.2 砂梨转录组测序分析第144-145页
        7.2.3 GA增强砂梨果实库强的表达谱分析第145页
        7.2.4 GA增强砂梨果实库强的比较蛋白质组分析第145-146页
        7.2.5 GA应答基因PPFW2.2 基因克隆及遗传转化第146页
    7.3 主要创新点第146-147页
    7.4 展望第147-148页
参考文献第148-163页
附录 1第163-189页
附录 2第189-193页
攻读博士学位期间代表性成果第193-196页
获奖情况第196-197页
攻读博士学位期间参与的科研项目第197-198页
致谢第198-199页

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